MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011882	CTAG	2	8	934	941	25 %	25 %	25 %	25 %	219883411
2	NC_011882	ACGA	2	8	944	951	50 %	0 %	25 %	25 %	219883411
3	NC_011882	ACTG	2	8	1065	1072	25 %	25 %	25 %	25 %	219883411
4	NC_011882	GGCA	2	8	1538	1545	25 %	0 %	50 %	25 %	219883411
5	NC_011882	CTTA	2	8	1979	1986	25 %	50 %	0 %	25 %	219883411
6	NC_011882	AAAT	2	8	2050	2057	75 %	25 %	0 %	0 %	219883411
7	NC_011882	GATT	2	8	2358	2365	25 %	50 %	25 %	0 %	219883412
8	NC_011882	TGCG	2	8	2371	2378	0 %	25 %	50 %	25 %	219883412
9	NC_011882	GTTG	2	8	3164	3171	0 %	50 %	50 %	0 %	219883413
10	NC_011882	GGTC	2	8	3248	3255	0 %	25 %	50 %	25 %	219883413
11	NC_011882	ATGT	2	8	3583	3590	25 %	50 %	25 %	0 %	219883413
12	NC_011882	TCTG	2	8	4070	4077	0 %	50 %	25 %	25 %	219883413
13	NC_011882	AATC	2	8	4374	4381	50 %	25 %	0 %	25 %	219883413
14	NC_011882	AGTT	2	8	4461	4468	25 %	50 %	25 %	0 %	219883413
15	NC_011882	CTTC	2	8	4760	4767	0 %	50 %	0 %	50 %	219883413
16	NC_011882	TCCA	2	8	4908	4915	25 %	25 %	0 %	50 %	219883413
17	NC_011882	AAGC	2	8	5122	5129	50 %	0 %	25 %	25 %	219883413
18	NC_011882	CTGT	2	8	5407	5414	0 %	50 %	25 %	25 %	219883414
19	NC_011882	GTAA	2	8	5621	5628	50 %	25 %	25 %	0 %	219883414
20	NC_011882	TCCA	2	8	6749	6756	25 %	25 %	0 %	50 %	219883416
21	NC_011882	TTAA	2	8	6942	6949	50 %	50 %	0 %	0 %	219883416
22	NC_011882	TCAA	2	8	7652	7659	50 %	25 %	0 %	25 %	219883418
23	NC_011882	TGCC	2	8	7811	7818	0 %	25 %	25 %	50 %	219883418
24	NC_011882	AGCC	2	8	8131	8138	25 %	0 %	25 %	50 %	219883419
25	NC_011882	GTCA	2	8	8429	8436	25 %	25 %	25 %	25 %	219883420
26	NC_011882	TCAA	2	8	8446	8453	50 %	25 %	0 %	25 %	219883420
27	NC_011882	CCAG	2	8	8679	8686	25 %	0 %	25 %	50 %	219883420
28	NC_011882	CCAA	2	8	8744	8751	50 %	0 %	0 %	50 %	219883420
29	NC_011882	ATTA	2	8	8789	8796	50 %	50 %	0 %	0 %	219883420
30	NC_011882	TCAG	2	8	8808	8815	25 %	25 %	25 %	25 %	219883420
31	NC_011882	TTCA	2	8	10533	10540	25 %	50 %	0 %	25 %	219883423
32	NC_011882	TTCG	2	8	10868	10875	0 %	50 %	25 %	25 %	219883423
33	NC_011882	CCCA	2	8	11120	11127	25 %	0 %	0 %	75 %	219883423
34	NC_011882	ACGA	2	8	11345	11352	50 %	0 %	25 %	25 %	219883423
35	NC_011882	TCGA	2	8	11662	11669	25 %	25 %	25 %	25 %	219883423
36	NC_011882	GTTT	2	8	11869	11876	0 %	75 %	25 %	0 %	219883423
37	NC_011882	TGCT	2	8	12832	12839	0 %	50 %	25 %	25 %	219883424
38	NC_011882	TGAG	2	8	12896	12903	25 %	25 %	50 %	0 %	219883424
39	NC_011882	AATT	2	8	12946	12953	50 %	50 %	0 %	0 %	219883424
40	NC_011882	AGCA	2	8	13301	13308	50 %	0 %	25 %	25 %	219883425
41	NC_011882	CGTC	2	8	13723	13730	0 %	25 %	25 %	50 %	219883426
42	NC_011882	AAAG	2	8	15028	15035	75 %	0 %	25 %	0 %	219883427
43	NC_011882	GAAA	2	8	16126	16133	75 %	0 %	25 %	0 %	219883427
44	NC_011882	TCGA	2	8	16459	16466	25 %	25 %	25 %	25 %	219883427
45	NC_011882	GCAG	2	8	16723	16730	25 %	0 %	50 %	25 %	219883427
46	NC_011882	CAAG	2	8	17257	17264	50 %	0 %	25 %	25 %	219883427
47	NC_011882	ATCT	2	8	19458	19465	25 %	50 %	0 %	25 %	219883429
48	NC_011882	GGCA	2	8	19587	19594	25 %	0 %	50 %	25 %	219883429
49	NC_011882	GATG	2	8	19747	19754	25 %	25 %	50 %	0 %	219883429
50	NC_011882	AATC	2	8	19939	19946	50 %	25 %	0 %	25 %	219883429
51	NC_011882	GATG	2	8	20407	20414	25 %	25 %	50 %	0 %	219883429
52	NC_011882	TTTG	2	8	20640	20647	0 %	75 %	25 %	0 %	219883429
53	NC_011882	ATGG	2	8	20941	20948	25 %	25 %	50 %	0 %	219883430
54	NC_011882	TTGA	2	8	21016	21023	25 %	50 %	25 %	0 %	219883430
55	NC_011882	GCAG	2	8	21362	21369	25 %	0 %	50 %	25 %	219883431
56	NC_011882	CTAC	2	8	21649	21656	25 %	25 %	0 %	50 %	219883431
57	NC_011882	GATG	2	8	22388	22395	25 %	25 %	50 %	0 %	219883431
58	NC_011882	TCTT	2	8	23311	23318	0 %	75 %	0 %	25 %	219883432
59	NC_011882	GATT	2	8	23455	23462	25 %	50 %	25 %	0 %	219883432
60	NC_011882	GTAA	2	8	24050	24057	50 %	25 %	25 %	0 %	219883432
61	NC_011882	ATTA	2	8	24187	24194	50 %	50 %	0 %	0 %	219883432
62	NC_011882	CGAT	2	8	25049	25056	25 %	25 %	25 %	25 %	219883433
63	NC_011882	CCAG	2	8	25406	25413	25 %	0 %	25 %	50 %	219883433
64	NC_011882	CAGC	2	8	25522	25529	25 %	0 %	25 %	50 %	219883434
65	NC_011882	GGCT	2	8	25582	25589	0 %	25 %	50 %	25 %	219883434
66	NC_011882	CCGT	2	8	25663	25670	0 %	25 %	25 %	50 %	219883434
67	NC_011882	CCTG	2	8	26132	26139	0 %	25 %	25 %	50 %	219883434
68	NC_011882	GCAG	2	8	26286	26293	25 %	0 %	50 %	25 %	219883434
69	NC_011882	CAGC	2	8	26402	26409	25 %	0 %	25 %	50 %	219883434
70	NC_011882	AGGT	2	8	27002	27009	25 %	25 %	50 %	0 %	219883435
71	NC_011882	GGTT	2	8	27730	27737	0 %	50 %	50 %	0 %	219883435
72	NC_011882	CGAT	2	8	30290	30297	25 %	25 %	25 %	25 %	219883435
73	NC_011882	CAAC	2	8	30369	30376	50 %	0 %	0 %	50 %	219883435
74	NC_011882	AGTT	2	8	30386	30393	25 %	50 %	25 %	0 %	219883435
75	NC_011882	GCAA	2	8	30582	30589	50 %	0 %	25 %	25 %	219883435
76	NC_011882	TTCC	2	8	31255	31262	0 %	50 %	0 %	50 %	219883436
77	NC_011882	GAAT	2	8	32658	32665	50 %	25 %	25 %	0 %	219883437
78	NC_011882	TGAA	2	8	34089	34096	50 %	25 %	25 %	0 %	219883438
79	NC_011882	ATTG	2	8	34468	34475	25 %	50 %	25 %	0 %	219883438

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.