MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011882	CAA	2	6	158	163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883410
2	NC_011882	GAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883410
3	NC_011882	CGA	2	6	271	276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883410
4	NC_011882	TTC	2	6	360	365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883410
5	NC_011882	ACA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883410
6	NC_011882	CGA	2	6	604	609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883411
7	NC_011882	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883411
8	NC_011882	CAG	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883411
9	NC_011882	GTA	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883411
10	NC_011882	AGA	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
11	NC_011882	GGA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
12	NC_011882	GTT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883411
13	NC_011882	TCT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883411
14	NC_011882	GGA	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
15	NC_011882	TCG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883411
16	NC_011882	AGA	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
17	NC_011882	GTT	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883411
18	NC_011882	GAG	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
19	NC_011882	CCT	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883411
20	NC_011882	CGC	2	6	1708	1713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883411
21	NC_011882	GAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
22	NC_011882	ACT	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883411
23	NC_011882	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011882	TAT	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883412
25	NC_011882	ATT	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883412
26	NC_011882	TAA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883412
27	NC_011882	AGG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011882	TAA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
29	NC_011882	AAT	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
30	NC_011882	GCT	3	9	3080	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
31	NC_011882	CTT	2	6	3126	3131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
32	NC_011882	GAA	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
33	NC_011882	ATA	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
34	NC_011882	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
35	NC_011882	GCT	3	9	3522	3530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
36	NC_011882	CTA	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
37	NC_011882	CTT	2	6	3563	3568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
38	NC_011882	ATT	2	6	3754	3759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
39	NC_011882	GCT	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
40	NC_011882	TAG	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
41	NC_011882	GCA	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
42	NC_011882	TAG	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
43	NC_011882	CCA	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883413
44	NC_011882	GCT	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
45	NC_011882	TCA	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
46	NC_011882	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883413
47	NC_011882	TAC	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
48	NC_011882	TTC	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
49	NC_011882	AGA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
50	NC_011882	CTT	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
51	NC_011882	ATT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
52	NC_011882	TCA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
53	NC_011882	GGA	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883413
54	NC_011882	CAG	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
55	NC_011882	TCA	2	6	4511	4516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
56	NC_011882	CAT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
57	NC_011882	TCT	2	6	4617	4622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
58	NC_011882	AGC	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
59	NC_011882	AAT	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
60	NC_011882	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
61	NC_011882	TCT	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
62	NC_011882	AGT	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
63	NC_011882	AAG	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
64	NC_011882	TCT	2	6	5033	5038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
65	NC_011882	TTC	2	6	5098	5103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
66	NC_011882	TCA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
67	NC_011882	CGT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
68	NC_011882	TGC	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
69	NC_011882	TAA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883414
70	NC_011882	CTT	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883414
71	NC_011882	AGT	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883414
72	NC_011882	GAT	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883414
73	NC_011882	TTG	2	6	5715	5720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883414
74	NC_011882	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011882	ATT	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011882	TTA	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011882	AAT	2	6	5997	6002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011882	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011882	ATT	2	6	6224	6229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011882	TAT	2	6	6230	6235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011882	TTC	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883415
82	NC_011882	AGC	2	6	6453	6458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883415
83	NC_011882	GTT	2	6	6505	6510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883415
84	NC_011882	GCT	2	6	6655	6660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883416
85	NC_011882	TGT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883416
86	NC_011882	CGT	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883416
87	NC_011882	TTA	2	6	6903	6908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883416
88	NC_011882	AAC	2	6	6965	6970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883416
89	NC_011882	CAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883416
90	NC_011882	TGA	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883417
91	NC_011882	TTC	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883417
92	NC_011882	GCC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883417
93	NC_011882	AAG	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883417
94	NC_011882	CTA	2	6	7228	7233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883417
95	NC_011882	ACC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011882	AAT	2	6	7313	7318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011882	TGT	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883418
98	NC_011882	GGA	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883418
99	NC_011882	GTT	2	6	7449	7454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883418
100	NC_011882	TCT	2	6	7556	7561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883418
101	NC_011882	GCG	2	6	7838	7843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883418
102	NC_011882	ATC	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883419
103	NC_011882	TAA	2	6	8014	8019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883419
104	NC_011882	GAA	2	6	8037	8042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883419
105	NC_011882	AGC	2	6	8069	8074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883419
106	NC_011882	GAA	2	6	8119	8124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883419
107	NC_011882	TCA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883419
108	NC_011882	CTT	2	6	8369	8374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011882	CCA	2	6	8473	8478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883420
110	NC_011882	AAG	2	6	8508	8513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883420
111	NC_011882	CAA	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883420
112	NC_011882	TGA	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883420
113	NC_011882	ACC	2	6	8697	8702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883420
114	NC_011882	AGG	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883420
115	NC_011882	CCA	2	6	8936	8941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883420
116	NC_011882	GCT	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883420
117	NC_011882	TGT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883420
118	NC_011882	CTT	2	6	9129	9134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883421
119	NC_011882	CTT	2	6	9203	9208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883421
120	NC_011882	AAG	2	6	9222	9227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883421
121	NC_011882	GAA	3	9	9301	9309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883421
122	NC_011882	ACT	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883421
123	NC_011882	AGT	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011882	TAT	2	6	9460	9465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011882	TGA	2	6	9483	9488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011882	GTT	2	6	9511	9516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883422
127	NC_011882	TCG	2	6	9569	9574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883422
128	NC_011882	TGC	2	6	9742	9747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011882	TCC	2	6	9789	9794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011882	ACC	2	6	9856	9861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
131	NC_011882	CTC	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883423
132	NC_011882	CTC	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883423
133	NC_011882	CAC	2	6	10137	10142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
134	NC_011882	GAT	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883423
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159	NC_011882	TAA	2	6	12574	12579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_011882	AAG	3	9	22695	22703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883431
258	NC_011882	GGC	2	6	22746	22751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883431
259	NC_011882	ACA	2	6	22759	22764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883431
260	NC_011882	GCT	2	6	22822	22827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883431
261	NC_011882	CTC	2	6	22833	22838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883431
262	NC_011882	CAT	2	6	22916	22921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883431
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379	NC_011882	CTC	2	6	31962	31967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883437
380	NC_011882	GGC	2	6	32069	32074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883437
381	NC_011882	GCA	4	12	32084	32095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883437
382	NC_011882	GAC	2	6	32165	32170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883437
383	NC_011882	GCA	2	6	32304	32309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883437
384	NC_011882	AAT	2	6	32393	32398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883437
385	NC_011882	CAG	2	6	32436	32441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883437
386	NC_011882	TGA	2	6	32545	32550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883437
387	NC_011882	AGC	2	6	32630	32635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883437
388	NC_011882	AGC	2	6	32731	32736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883437
389	NC_011882	AGC	2	6	32854	32859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883437
390	NC_011882	AAC	2	6	32889	32894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883437
391	NC_011882	TAC	2	6	32918	32923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883437
392	NC_011882	GAG	2	6	33004	33009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
393	NC_011882	AAT	2	6	33065	33070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883438
394	NC_011882	GTT	2	6	33182	33187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883438
395	NC_011882	GTT	2	6	33227	33232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883438
396	NC_011882	TTA	2	6	33242	33247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883438
397	NC_011882	TAC	2	6	33380	33385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883438
398	NC_011882	TGA	2	6	33409	33414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883438
399	NC_011882	ATT	2	6	33563	33568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883438
400	NC_011882	GTT	2	6	33578	33583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883438
401	NC_011882	AAT	2	6	33587	33592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883438
402	NC_011882	GAG	2	6	33710	33715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883438
403	NC_011882	TTC	2	6	33867	33872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883438
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406	NC_011882	CAG	2	6	34023	34028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883438
407	NC_011882	CTG	2	6	34113	34118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883438
408	NC_011882	CTG	2	6	34161	34166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883438
409	NC_011882	GAA	2	6	34310	34315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883438
410	NC_011882	ATT	2	6	34361	34366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883438
411	NC_011882	TGA	2	6	34495	34500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883438
412	NC_011882	TCA	2	6	34509	34514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883438
413	NC_011882	GAA	2	6	34550	34555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883438
414	NC_011882	CTC	2	6	34608	34613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883438
415	NC_011882	GGA	2	6	34649	34654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883438
416	NC_011882	CCA	2	6	34720	34725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.