MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503

Total Repeats: 378

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011882	CAA	2	6	158	163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883410
2	NC_011882	GAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883410
3	NC_011882	CGA	2	6	271	276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883410
4	NC_011882	TTC	2	6	360	365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883410
5	NC_011882	ACA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883410
6	NC_011882	CGA	2	6	604	609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883411
7	NC_011882	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883411
8	NC_011882	CAG	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883411
9	NC_011882	GTA	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883411
10	NC_011882	AGA	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
11	NC_011882	GGA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
12	NC_011882	GTT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883411
13	NC_011882	TCT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883411
14	NC_011882	GGA	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
15	NC_011882	TCG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883411
16	NC_011882	AGA	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
17	NC_011882	GTT	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883411
18	NC_011882	GAG	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883411
19	NC_011882	CCT	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883411
20	NC_011882	CGC	2	6	1708	1713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883411
21	NC_011882	GAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883411
22	NC_011882	ACT	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883411
23	NC_011882	TAT	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883412
24	NC_011882	ATT	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883412
25	NC_011882	TAA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883412
26	NC_011882	TAA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
27	NC_011882	AAT	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
28	NC_011882	GCT	3	9	3080	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
29	NC_011882	CTT	2	6	3126	3131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
30	NC_011882	GAA	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
31	NC_011882	ATA	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
32	NC_011882	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
33	NC_011882	GCT	3	9	3522	3530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
34	NC_011882	CTA	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
35	NC_011882	CTT	2	6	3563	3568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
36	NC_011882	ATT	2	6	3754	3759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
37	NC_011882	GCT	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
38	NC_011882	TAG	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
39	NC_011882	GCA	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
40	NC_011882	TAG	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
41	NC_011882	CCA	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883413
42	NC_011882	GCT	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
43	NC_011882	TCA	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
44	NC_011882	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883413
45	NC_011882	TAC	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
46	NC_011882	TTC	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
47	NC_011882	AGA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
48	NC_011882	CTT	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
49	NC_011882	ATT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883413
50	NC_011882	TCA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
51	NC_011882	GGA	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883413
52	NC_011882	CAG	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
53	NC_011882	TCA	2	6	4511	4516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
54	NC_011882	CAT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
55	NC_011882	TCT	2	6	4617	4622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
56	NC_011882	AGC	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883413
57	NC_011882	AAT	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883413
58	NC_011882	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
59	NC_011882	TCT	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
60	NC_011882	AGT	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883413
61	NC_011882	AAG	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883413
62	NC_011882	TCT	2	6	5033	5038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
63	NC_011882	TTC	2	6	5098	5103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883413
64	NC_011882	TCA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883413
65	NC_011882	CGT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
66	NC_011882	TGC	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883413
67	NC_011882	TAA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883414
68	NC_011882	CTT	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883414
69	NC_011882	AGT	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883414
70	NC_011882	GAT	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883414
71	NC_011882	TTG	2	6	5715	5720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883414
72	NC_011882	TTC	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883415
73	NC_011882	AGC	2	6	6453	6458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883415
74	NC_011882	GTT	2	6	6505	6510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883415
75	NC_011882	GCT	2	6	6655	6660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883416
76	NC_011882	TGT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883416
77	NC_011882	CGT	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883416
78	NC_011882	TTA	2	6	6903	6908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883416
79	NC_011882	AAC	2	6	6965	6970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883416
80	NC_011882	CAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883416
81	NC_011882	TGA	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883417
82	NC_011882	TTC	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883417
83	NC_011882	GCC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883417
84	NC_011882	AAG	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883417
85	NC_011882	CTA	2	6	7228	7233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883417
86	NC_011882	TGT	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883418
87	NC_011882	GGA	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883418
88	NC_011882	GTT	2	6	7449	7454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883418
89	NC_011882	TCT	2	6	7556	7561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883418
90	NC_011882	GCG	2	6	7838	7843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883418
91	NC_011882	ATC	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883419
92	NC_011882	TAA	2	6	8014	8019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883419
93	NC_011882	GAA	2	6	8037	8042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883419
94	NC_011882	AGC	2	6	8069	8074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883419
95	NC_011882	GAA	2	6	8119	8124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883419
96	NC_011882	TCA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883419
97	NC_011882	CCA	2	6	8473	8478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883420
98	NC_011882	AAG	2	6	8508	8513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883420
99	NC_011882	CAA	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883420
100	NC_011882	TGA	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883420
101	NC_011882	ACC	2	6	8697	8702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883420
102	NC_011882	AGG	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883420
103	NC_011882	CCA	2	6	8936	8941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883420
104	NC_011882	GCT	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883420
105	NC_011882	TGT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883420
106	NC_011882	CTT	2	6	9129	9134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883421
107	NC_011882	CTT	2	6	9203	9208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883421
108	NC_011882	AAG	2	6	9222	9227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883421
109	NC_011882	GAA	3	9	9301	9309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883421
110	NC_011882	ACT	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883421
111	NC_011882	GTT	2	6	9511	9516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883422
112	NC_011882	TCG	2	6	9569	9574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883422
113	NC_011882	ACC	2	6	9856	9861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
114	NC_011882	CTC	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883423
115	NC_011882	CTC	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883423
116	NC_011882	CAC	2	6	10137	10142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
117	NC_011882	GAT	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883423
118	NC_011882	CCA	2	6	10290	10295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
119	NC_011882	GCG	2	6	10358	10363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883423
120	NC_011882	TGT	2	6	10393	10398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883423
121	NC_011882	CCA	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
122	NC_011882	TGC	2	6	10711	10716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883423
123	NC_011882	GAT	2	6	10824	10829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883423
124	NC_011882	CGA	2	6	10919	10924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883423
125	NC_011882	TCT	2	6	11419	11424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883423
126	NC_011882	ACC	2	6	11521	11526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883423
127	NC_011882	GCC	2	6	11644	11649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883423
128	NC_011882	CAA	2	6	11678	11683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883423
129	NC_011882	CGC	2	6	11718	11723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883423
130	NC_011882	TGC	2	6	11791	11796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883423
131	NC_011882	AGC	2	6	11850	11855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883423
132	NC_011882	TCA	2	6	11924	11929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883423
133	NC_011882	TTC	2	6	11985	11990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883423
134	NC_011882	CAA	2	6	12069	12074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883423
135	NC_011882	TGG	2	6	12151	12156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883423
136	NC_011882	TCC	2	6	12163	12168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883423
137	NC_011882	GAA	2	6	12188	12193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883423
138	NC_011882	GCA	2	6	12203	12208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883423
139	NC_011882	ATT	2	6	12237	12242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883423
140	NC_011882	CAG	2	6	12820	12825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883424
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142	NC_011882	TCT	2	6	12972	12977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883424
143	NC_011882	CCT	2	6	13033	13038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883425
144	NC_011882	CGT	2	6	13101	13106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883425
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146	NC_011882	TTC	2	6	13355	13360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883425
147	NC_011882	CTT	2	6	13563	13568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883426
148	NC_011882	GTT	2	6	13606	13611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883426
149	NC_011882	GCG	2	6	13733	13738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883426
150	NC_011882	GCT	2	6	13912	13917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883426
151	NC_011882	CAC	2	6	14746	14751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883427
152	NC_011882	TGC	2	6	14758	14763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883427
153	NC_011882	ATG	2	6	14775	14780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883427
154	NC_011882	CAG	2	6	14825	14830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883427
155	NC_011882	AAC	2	6	15104	15109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883427
156	NC_011882	CAG	2	6	15245	15250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883427
157	NC_011882	GAT	2	6	15299	15304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883427
158	NC_011882	GTC	2	6	15308	15313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883427
159	NC_011882	CTG	2	6	15351	15356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883427
160	NC_011882	GGA	2	6	15364	15369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883427
161	NC_011882	GTA	2	6	15554	15559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883427
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164	NC_011882	ATC	2	6	15758	15763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883427
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240	NC_011882	TTC	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883432
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248	NC_011882	CTT	2	6	24419	24424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883432
249	NC_011882	ATT	2	6	24443	24448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883432
250	NC_011882	AGA	2	6	24460	24465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883432
251	NC_011882	ACT	2	6	24521	24526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883432
252	NC_011882	AAG	2	6	24585	24590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883432
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254	NC_011882	GAC	2	6	24743	24748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883432
255	NC_011882	TCC	2	6	24815	24820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883432
256	NC_011882	CGT	2	6	24821	24826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883432
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258	NC_011882	CCG	2	6	25110	25115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883433
259	NC_011882	CCA	2	6	25211	25216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883433
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.