MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL02

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011881	CCGGTG	2	12	3975	3986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883263
2	NC_011881	GCGACG	2	12	4120	4131	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219883263
3	NC_011881	TGCCGA	2	12	5294	5305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883264
4	NC_011881	TGGCCG	2	12	6402	6413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883266
5	NC_011881	GTCACC	2	12	10731	10742	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883268
6	NC_011881	CTGCGG	2	12	11693	11704	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883268
7	NC_011881	CGTTCC	2	12	13168	13179	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219883268
8	NC_011881	AGCGAT	2	12	17422	17433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883273
9	NC_011881	GGCGCC	2	12	20276	20287	0 %	0 %	50 %	50 %	219883276
10	NC_011881	AGCTGC	2	12	22550	22561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883278
11	NC_011881	TCCGGG	2	12	23342	23353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011881	ATGGCC	2	12	25620	25631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883282
13	NC_011881	CACGGG	2	12	25848	25859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219883282
14	NC_011881	CGGCTG	2	12	25890	25901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883282
15	NC_011881	CAGCTG	2	12	26388	26399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883282
16	NC_011881	ACGTGC	2	12	27440	27451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883283
17	NC_011881	ATCAGG	2	12	29554	29565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883285
18	NC_011881	CCCAGG	2	12	29662	29673	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219883285
19	NC_011881	GAGCAC	2	12	30762	30773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883286
20	NC_011881	GGCCAG	2	12	35625	35636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219883293
21	NC_011881	GGTTCA	2	12	35930	35941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219883293
22	NC_011881	TCCCGC	2	12	36685	36696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011881	AGCCGC	2	12	36933	36944	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219883294
24	NC_011881	TCCCGG	2	12	41851	41862	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219883299
25	NC_011881	CTCGGT	2	12	42551	42562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883301
26	NC_011881	CCCGTC	2	12	48328	48339	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219883306
27	NC_011881	CGCATC	2	12	53303	53314	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883310
28	NC_011881	CAGCGA	2	12	56447	56458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883311
29	NC_011881	ACTGCG	2	12	58484	58495	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883314
30	NC_011881	TCCGTA	2	12	58915	58926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883314
31	NC_011881	GGCAGA	2	12	65097	65108	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219883321
32	NC_011881	TCCAGC	2	12	65198	65209	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883321
33	NC_011881	CCAACA	2	12	65309	65320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011881	CTGGGT	2	12	66406	66417	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219883323
35	NC_011881	GGCAGC	2	12	67194	67205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219883323
36	NC_011881	AACCGA	2	12	69777	69788	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	219883325
37	NC_011881	CGACAC	2	12	70323	70334	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219883325
38	NC_011881	ACCGGT	2	12	72125	72136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883326
39	NC_011881	CTAGGG	2	12	73354	73365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011881	GAGGGC	2	12	73949	73960	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219883329
41	NC_011881	GACGCA	2	12	75293	75304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883330
42	NC_011881	CGGTCA	2	12	77083	77094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883331
43	NC_011881	GCCGGC	2	12	77812	77823	0 %	0 %	50 %	50 %	219883332
44	NC_011881	CACCCC	2	12	78387	78398	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	219883332
45	NC_011881	TGGCCC	2	12	82062	82073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011881	GACCGG	2	12	91090	91101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219883342
47	NC_011881	CCCCCA	2	12	91236	91247	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	219883342
48	NC_011881	CAGAAT	2	12	101195	101206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219883352
49	NC_011881	TTCTGG	2	12	102821	102832	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219883353
50	NC_011881	CTGATG	2	12	104751	104762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219883354
51	NC_011881	CCAACG	2	12	105066	105077	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219883355
52	NC_011881	CGAGAT	2	12	107557	107568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883358
53	NC_011881	TCGAAC	2	12	110199	110210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219883360
54	NC_011881	TGCCGG	2	12	110248	110259	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883360
55	NC_011881	AGGCCA	2	12	114183	114194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011881	GAGGCG	2	12	116638	116649	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219883367
57	NC_011881	GTCGCC	2	12	120540	120551	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011881	CCGGCC	2	12	123257	123268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883373
59	NC_011881	GACGGT	2	12	124680	124691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219883374
60	NC_011881	GAACCG	2	12	126681	126692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011881	GTTTAG	2	12	128092	128103	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011881	TCAGCG	2	12	129980	129991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883378
63	NC_011881	TGATGC	2	12	131837	131848	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219883379
64	NC_011881	GATCCT	2	12	132051	132062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883379
65	NC_011881	TTGCCG	2	12	132331	132342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883380
66	NC_011881	CCGATC	2	12	133940	133951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883381
67	NC_011881	CACGGA	2	12	143538	143549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883391
68	NC_011881	CAGACC	2	12	143867	143878	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219883391
69	NC_011881	CCCGGA	2	12	146614	146625	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219883393
70	NC_011881	CTCCGC	2	12	153416	153427	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219883403
71	NC_011881	CATCCC	2	12	154744	154755	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	219883404

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.