MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL02

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011881	CTTTC	2	10	908	917	0 %	60 %	0 %	40 %	219883260
2	NC_011881	GGCCG	2	10	1736	1745	0 %	0 %	60 %	40 %	219883260
3	NC_011881	CTCCC	2	10	1829	1838	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_011881	CAGCG	2	10	2481	2490	20 %	0 %	40 %	40 %	219883261
5	NC_011881	GTCAC	2	10	2924	2933	20 %	20 %	20 %	40 %	219883262
6	NC_011881	GCGTA	2	10	5993	6002	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011881	CCCGA	2	10	10684	10693	20 %	0 %	20 %	60 %	219883268
8	NC_011881	ACCGA	2	10	11323	11332	40 %	0 %	20 %	40 %	219883268
9	NC_011881	GGACG	2	10	12232	12241	20 %	0 %	60 %	20 %	219883268
10	NC_011881	CAGAC	2	10	13192	13201	40 %	0 %	20 %	40 %	219883268
11	NC_011881	ACATC	2	10	13400	13409	40 %	20 %	0 %	40 %	219883268
12	NC_011881	ATCAA	2	10	14253	14262	60 %	20 %	0 %	20 %	219883269
13	NC_011881	CTCTT	2	10	15070	15079	0 %	60 %	0 %	40 %	219883270
14	NC_011881	TCGAG	2	10	15570	15579	20 %	20 %	40 %	20 %	219883271
15	NC_011881	GATTC	2	10	16274	16283	20 %	40 %	20 %	20 %	219883271
16	NC_011881	CGCGG	2	10	19619	19628	0 %	0 %	60 %	40 %	219883275
17	NC_011881	CCAGC	2	10	21500	21509	20 %	0 %	20 %	60 %	219883277
18	NC_011881	CGGTC	2	10	22356	22365	0 %	20 %	40 %	40 %	219883278
19	NC_011881	GATCA	2	10	23845	23854	40 %	20 %	20 %	20 %	219883280
20	NC_011881	CCGGG	2	10	24021	24030	0 %	0 %	60 %	40 %	219883280
21	NC_011881	GCCGG	2	10	24266	24275	0 %	0 %	60 %	40 %	219883280
22	NC_011881	CGGCG	2	10	25002	25011	0 %	0 %	60 %	40 %	219883281
23	NC_011881	CCGGG	2	10	26019	26028	0 %	0 %	60 %	40 %	219883282
24	NC_011881	GGAAC	2	10	26132	26141	40 %	0 %	40 %	20 %	219883282
25	NC_011881	CCGGG	2	10	27908	27917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011881	CCCGG	2	10	29343	29352	0 %	0 %	40 %	60 %	219883284
27	NC_011881	ACGGC	2	10	30149	30158	20 %	0 %	40 %	40 %	219883285
28	NC_011881	CAGGG	2	10	30912	30921	20 %	0 %	60 %	20 %	219883286
29	NC_011881	AGCGA	2	10	30982	30991	40 %	0 %	40 %	20 %	219883286
30	NC_011881	GGCCG	2	10	32732	32741	0 %	0 %	60 %	40 %	219883289
31	NC_011881	CCATG	2	10	34166	34175	20 %	20 %	20 %	40 %	219883291
32	NC_011881	CCGGA	2	10	34372	34381	20 %	0 %	40 %	40 %	219883291
33	NC_011881	CAGGG	2	10	36022	36031	20 %	0 %	60 %	20 %	219883293
34	NC_011881	CCGGA	2	10	37282	37291	20 %	0 %	40 %	40 %	219883294
35	NC_011881	ACCGA	2	10	38883	38892	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011881	AGCTC	2	10	39027	39036	20 %	20 %	20 %	40 %	219883297
37	NC_011881	GAGCG	2	10	39091	39100	20 %	0 %	60 %	20 %	219883297
38	NC_011881	ACCGG	2	10	41879	41888	20 %	0 %	40 %	40 %	219883299
39	NC_011881	CGGAT	2	10	42046	42055	20 %	20 %	40 %	20 %	219883300
40	NC_011881	TGTGG	2	10	44791	44800	0 %	40 %	60 %	0 %	219883304
41	NC_011881	CGGGT	2	10	48031	48040	0 %	20 %	60 %	20 %	219883306
42	NC_011881	CCGGG	2	10	48288	48297	0 %	0 %	60 %	40 %	219883306
43	NC_011881	CAGAT	2	10	48688	48697	40 %	20 %	20 %	20 %	219883306
44	NC_011881	GTCCG	2	10	51906	51915	0 %	20 %	40 %	40 %	219883308
45	NC_011881	CGTCG	2	10	55555	55564	0 %	20 %	40 %	40 %	219883311
46	NC_011881	GCTCC	2	10	58352	58361	0 %	20 %	20 %	60 %	219883313
47	NC_011881	GCGGT	2	10	59181	59190	0 %	20 %	60 %	20 %	219883314
48	NC_011881	GGTCG	2	10	59938	59947	0 %	20 %	60 %	20 %	219883315
49	NC_011881	CCGGC	2	10	62703	62712	0 %	0 %	40 %	60 %	219883318
50	NC_011881	CCGTC	2	10	63074	63083	0 %	20 %	20 %	60 %	219883319
51	NC_011881	GGGCA	2	10	65456	65465	20 %	0 %	60 %	20 %	219883322
52	NC_011881	GGAGC	2	10	66060	66069	20 %	0 %	60 %	20 %	219883322
53	NC_011881	GGCCG	2	10	68910	68919	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011881	CTCCG	2	10	69922	69931	0 %	20 %	20 %	60 %	219883325
55	NC_011881	CCCGG	2	10	72221	72230	0 %	0 %	40 %	60 %	219883327
56	NC_011881	TCCTC	2	10	74644	74653	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_011881	ACCTG	2	10	75722	75731	20 %	20 %	20 %	40 %	219883330
58	NC_011881	GGCTC	2	10	75850	75859	0 %	20 %	40 %	40 %	219883330
59	NC_011881	GCGGT	2	10	76525	76534	0 %	20 %	60 %	20 %	219883330
60	NC_011881	ATGAA	2	10	78702	78711	60 %	20 %	20 %	0 %	219883332
61	NC_011881	CTTCG	2	10	79865	79874	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011881	TGACT	2	10	81822	81831	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011881	GCGCG	2	10	90802	90811	0 %	0 %	60 %	40 %	219883342
64	NC_011881	TTCTC	2	10	94191	94200	0 %	60 %	0 %	40 %	219883344
65	NC_011881	CTGCC	2	10	95956	95965	0 %	20 %	20 %	60 %	219883347
66	NC_011881	GAAGG	2	10	99771	99780	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011881	CCCAG	2	10	102149	102158	20 %	0 %	20 %	60 %	219883353
68	NC_011881	GCGGT	2	10	102545	102554	0 %	20 %	60 %	20 %	219883353
69	NC_011881	ACTCC	2	10	106660	106669	20 %	20 %	0 %	60 %	219883357
70	NC_011881	CGATG	2	10	112336	112345	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011881	GCTCG	2	10	112665	112674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011881	TGGAT	2	10	117260	117269	20 %	40 %	40 %	0 %	219883367
73	NC_011881	TGAAC	2	10	118444	118453	40 %	20 %	20 %	20 %	219883368
74	NC_011881	CTCAC	2	10	119535	119544	20 %	20 %	0 %	60 %	219883369
75	NC_011881	CCTGG	2	10	120665	120674	0 %	20 %	40 %	40 %	219883371
76	NC_011881	GGTCT	2	10	120958	120967	0 %	40 %	40 %	20 %	219883371
77	NC_011881	AGGAC	2	10	122747	122756	40 %	0 %	40 %	20 %	219883372
78	NC_011881	GCCTT	2	10	124669	124678	0 %	40 %	20 %	40 %	219883374
79	NC_011881	CACGC	2	10	128324	128333	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_011881	AGGAC	2	10	128497	128506	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011881	CGCTG	2	10	135301	135310	0 %	20 %	40 %	40 %	219883382
82	NC_011881	CCGGG	2	10	135424	135433	0 %	0 %	60 %	40 %	219883382
83	NC_011881	GGCCC	2	10	139585	139594	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_011881	TCCCC	2	10	139665	139674	0 %	20 %	0 %	80 %	219883388
85	NC_011881	CAGCG	2	10	150172	150181	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011881	CCGGG	2	10	151726	151735	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.