MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL02

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011881	CGGC	2	8	662	669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011881	TGGG	2	8	733	740	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011881	TGGG	3	12	1795	1806	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011881	GCCG	2	8	2109	2116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011881	CGGC	2	8	2304	2311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011881	CACC	2	8	2366	2373	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_011881	TGGG	3	12	3216	3227	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011881	GCCG	2	8	3531	3538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011881	CGGA	2	8	3749	3756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011881	TCTT	2	8	3838	3845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011881	GTTT	2	8	7045	7052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011881	CTCG	2	8	17683	17690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011881	TCGT	2	8	18991	18998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011881	CGGC	2	8	19927	19934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011881	AGGG	2	8	24809	24816	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011881	ATTC	2	8	32776	32783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011881	TTCC	2	8	36673	36680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011881	CGGG	2	8	36826	36833	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011881	GCGG	2	8	38261	38268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011881	CAAT	2	8	38620	38627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011881	CGGC	2	8	38945	38952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011881	TTCC	2	8	42115	42122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011881	GCCC	2	8	42143	42150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_011881	CAAG	2	8	42231	42238	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011881	CGGC	2	8	43672	43679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011881	GCTC	2	8	43707	43714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011881	ACCA	2	8	43866	43873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011881	TGTA	2	8	45566	45573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011881	CATC	2	8	45594	45601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011881	GTTG	2	8	46619	46626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011881	GCGA	2	8	52314	52321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011881	GTCC	2	8	52326	52333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011881	CCCT	2	8	54254	54261	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_011881	ACTA	2	8	54359	54366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011881	CGTT	2	8	54776	54783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011881	TGGC	2	8	54797	54804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011881	AAGT	2	8	55116	55123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011881	CCAC	2	8	57207	57214	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_011881	TGGG	2	8	57215	57222	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011881	TCCG	2	8	61035	61042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011881	AAAG	2	8	68859	68866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011881	CGGC	2	8	73326	73333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011881	GAGT	2	8	73529	73536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011881	GCCG	2	8	77744	77751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011881	ACCC	2	8	77766	77773	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_011881	CTTG	2	8	79035	79042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011881	GGCT	2	8	79280	79287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011881	GGGA	2	8	81833	81840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011881	TTGT	2	8	81913	81920	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011881	CAGG	2	8	88229	88236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011881	TGCC	2	8	89417	89424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011881	GTTC	2	8	96105	96112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011881	GGGC	2	8	97048	97055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011881	TCCC	2	8	97074	97081	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_011881	GAAG	2	8	97134	97141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011881	CTGC	2	8	100166	100173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011881	GCGT	2	8	101616	101623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011881	GGAG	2	8	105874	105881	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011881	CTCC	2	8	105901	105908	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_011881	AGAA	2	8	107256	107263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011881	ATCT	2	8	107384	107391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011881	TGCT	3	12	108633	108644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011881	CAGC	2	8	108661	108668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011881	TCCA	2	8	111637	111644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011881	GCCG	2	8	111721	111728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011881	CCAA	2	8	112692	112699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011881	TTGC	2	8	113110	113117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011881	GCAA	2	8	113969	113976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011881	GCCA	2	8	114095	114102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011881	GTTT	2	8	115026	115033	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011881	CACG	2	8	115048	115055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011881	ATCG	2	8	120375	120382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011881	GCAG	2	8	123023	123030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011881	TGGA	2	8	126731	126738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011881	GCTT	2	8	126762	126769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011881	ACGT	2	8	128337	128344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011881	CGAG	2	8	128488	128495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011881	TTCT	2	8	128639	128646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011881	TCAA	2	8	131251	131258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011881	TGGC	2	8	136090	136097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011881	CGGG	2	8	139577	139584	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011881	GCGG	2	8	143072	143079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011881	CCGC	2	8	143334	143341	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_011881	GGGA	2	8	146038	146045	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011881	TTGG	2	8	146071	146078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011881	GGGA	2	8	146808	146815	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011881	TCCC	2	8	146830	146837	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_011881	TCGT	2	8	155246	155253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011881	TGAA	2	8	155293	155300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011881	TCTG	2	8	155751	155758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011881	TGGA	2	8	156053	156060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011881	CGGG	2	8	156724	156731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011881	CCCG	2	8	156735	156742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_011881	GCCG	2	8	158453	158460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.