MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL02

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011881	CGGG	2	8	1028	1035	0 %	0 %	75 %	25 %	219883260
2	NC_011881	GGCT	2	8	1204	1211	0 %	25 %	50 %	25 %	219883260
3	NC_011881	CCAG	2	8	1429	1436	25 %	0 %	25 %	50 %	219883260
4	NC_011881	GTTC	2	8	2684	2691	0 %	50 %	25 %	25 %	219883261
5	NC_011881	TGCC	2	8	2842	2849	0 %	25 %	25 %	50 %	219883262
6	NC_011881	TCCA	2	8	3080	3087	25 %	25 %	0 %	50 %	219883262
7	NC_011881	GATC	2	8	4031	4038	25 %	25 %	25 %	25 %	219883263
8	NC_011881	CTGG	2	8	4644	4651	0 %	25 %	50 %	25 %	219883264
9	NC_011881	GTCC	2	8	4857	4864	0 %	25 %	25 %	50 %	219883264
10	NC_011881	TCGG	2	8	5087	5094	0 %	25 %	50 %	25 %	219883264
11	NC_011881	CGTT	2	8	5113	5120	0 %	50 %	25 %	25 %	219883264
12	NC_011881	GTGC	2	8	5283	5290	0 %	25 %	50 %	25 %	219883264
13	NC_011881	GGAA	2	8	6195	6202	50 %	0 %	50 %	0 %	219883266
14	NC_011881	ACCA	2	8	6587	6594	50 %	0 %	0 %	50 %	219883266
15	NC_011881	GGCC	2	8	6819	6826	0 %	0 %	50 %	50 %	219883266
16	NC_011881	AAGG	2	8	6834	6841	50 %	0 %	50 %	0 %	219883266
17	NC_011881	GCAA	3	12	8740	8751	50 %	0 %	25 %	25 %	219883267
18	NC_011881	CAAT	2	8	9137	9144	50 %	25 %	0 %	25 %	219883267
19	NC_011881	GATT	2	8	9737	9744	25 %	50 %	25 %	0 %	219883267
20	NC_011881	GCCG	2	8	9751	9758	0 %	0 %	50 %	50 %	219883267
21	NC_011881	GCGG	2	8	10470	10477	0 %	0 %	75 %	25 %	219883267
22	NC_011881	AGGC	2	8	11049	11056	25 %	0 %	50 %	25 %	219883268
23	NC_011881	CTGG	2	8	11346	11353	0 %	25 %	50 %	25 %	219883268
24	NC_011881	GCCA	2	8	11924	11931	25 %	0 %	25 %	50 %	219883268
25	NC_011881	TGGA	2	8	12162	12169	25 %	25 %	50 %	0 %	219883268
26	NC_011881	TTGC	2	8	12253	12260	0 %	50 %	25 %	25 %	219883268
27	NC_011881	GGCC	2	8	12480	12487	0 %	0 %	50 %	50 %	219883268
28	NC_011881	CCTG	2	8	12578	12585	0 %	25 %	25 %	50 %	219883268
29	NC_011881	GCAG	2	8	14162	14169	25 %	0 %	50 %	25 %	219883269
30	NC_011881	ATCC	2	8	14324	14331	25 %	25 %	0 %	50 %	219883269
31	NC_011881	GCCG	2	8	14613	14620	0 %	0 %	50 %	50 %	219883270
32	NC_011881	GATC	2	8	15001	15008	25 %	25 %	25 %	25 %	219883270
33	NC_011881	CAAC	2	8	15852	15859	50 %	0 %	0 %	50 %	219883271
34	NC_011881	AACG	2	8	15908	15915	50 %	0 %	25 %	25 %	219883271
35	NC_011881	CGCA	2	8	16621	16628	25 %	0 %	25 %	50 %	219883272
36	NC_011881	TGTC	2	8	16885	16892	0 %	50 %	25 %	25 %	219883272
37	NC_011881	GTTC	2	8	16900	16907	0 %	50 %	25 %	25 %	219883272
38	NC_011881	CTTG	2	8	17194	17201	0 %	50 %	25 %	25 %	219883272
39	NC_011881	ACGG	2	8	17803	17810	25 %	0 %	50 %	25 %	219883274
40	NC_011881	GGGT	2	8	17839	17846	0 %	25 %	75 %	0 %	219883274
41	NC_011881	ACGG	2	8	19577	19584	25 %	0 %	50 %	25 %	219883275
42	NC_011881	GGGC	2	8	19699	19706	0 %	0 %	75 %	25 %	219883275
43	NC_011881	GCGG	2	8	20226	20233	0 %	0 %	75 %	25 %	219883276
44	NC_011881	CCGG	2	8	20624	20631	0 %	0 %	50 %	50 %	219883277
45	NC_011881	CGCC	2	8	21018	21025	0 %	0 %	25 %	75 %	219883277
46	NC_011881	CCGG	2	8	21656	21663	0 %	0 %	50 %	50 %	219883277
47	NC_011881	CGGC	2	8	21710	21717	0 %	0 %	50 %	50 %	219883277
48	NC_011881	ACGA	2	8	21902	21909	50 %	0 %	25 %	25 %	219883278
49	NC_011881	CCCG	2	8	22226	22233	0 %	0 %	25 %	75 %	219883278
50	NC_011881	CGGC	2	8	23030	23037	0 %	0 %	50 %	50 %	219883279
51	NC_011881	CCGG	2	8	23257	23264	0 %	0 %	50 %	50 %	219883279
52	NC_011881	CCGC	2	8	24086	24093	0 %	0 %	25 %	75 %	219883280
53	NC_011881	CGCA	2	8	24190	24197	25 %	0 %	25 %	50 %	219883280
54	NC_011881	ACCG	2	8	24574	24581	25 %	0 %	25 %	50 %	219883280
55	NC_011881	GCCG	2	8	25590	25597	0 %	0 %	50 %	50 %	219883282
56	NC_011881	GCCC	2	8	25634	25641	0 %	0 %	25 %	75 %	219883282
57	NC_011881	GCCC	3	12	26885	26896	0 %	0 %	25 %	75 %	219883282
58	NC_011881	GGCC	2	8	26978	26985	0 %	0 %	50 %	50 %	219883282
59	NC_011881	AGGC	2	8	27161	27168	25 %	0 %	50 %	25 %	219883282
60	NC_011881	CGAC	2	8	27204	27211	25 %	0 %	25 %	50 %	219883282
61	NC_011881	TGAG	2	8	27329	27336	25 %	25 %	50 %	0 %	219883282
62	NC_011881	GGAC	2	8	27358	27365	25 %	0 %	50 %	25 %	219883283
63	NC_011881	AGCC	2	8	27750	27757	25 %	0 %	25 %	50 %	219883283
64	NC_011881	GATC	2	8	28484	28491	25 %	25 %	25 %	25 %	219883284
65	NC_011881	CGGC	2	8	29177	29184	0 %	0 %	50 %	50 %	219883284
66	NC_011881	GCCG	2	8	29304	29311	0 %	0 %	50 %	50 %	219883284
67	NC_011881	CTGC	2	8	29397	29404	0 %	25 %	25 %	50 %	219883284
68	NC_011881	GTGG	2	8	30397	30404	0 %	25 %	75 %	0 %	219883286
69	NC_011881	CCCG	2	8	31031	31038	0 %	0 %	25 %	75 %	219883286
70	NC_011881	CCGA	2	8	31587	31594	25 %	0 %	25 %	50 %	219883287
71	NC_011881	GGCG	2	8	31850	31857	0 %	0 %	75 %	25 %	219883287
72	NC_011881	CCGG	2	8	31872	31879	0 %	0 %	50 %	50 %	219883287
73	NC_011881	ACGG	2	8	31937	31944	25 %	0 %	50 %	25 %	219883287
74	NC_011881	GCCG	2	8	32533	32540	0 %	0 %	50 %	50 %	219883289
75	NC_011881	GCGG	2	8	33635	33642	0 %	0 %	75 %	25 %	219883290
76	NC_011881	CTTC	2	8	34039	34046	0 %	50 %	0 %	50 %	219883291
77	NC_011881	GGCG	2	8	34500	34507	0 %	0 %	75 %	25 %	219883291
78	NC_011881	CGCC	2	8	34935	34942	0 %	0 %	25 %	75 %	219883292
79	NC_011881	GTCG	3	12	35324	35335	0 %	25 %	50 %	25 %	219883293
80	NC_011881	TCGG	2	8	35415	35422	0 %	25 %	50 %	25 %	219883293
81	NC_011881	TCCG	2	8	36146	36153	0 %	25 %	25 %	50 %	219883293
82	NC_011881	AGGT	2	8	36184	36191	25 %	25 %	50 %	0 %	219883293
83	NC_011881	GGCC	2	8	37083	37090	0 %	0 %	50 %	50 %	219883294
84	NC_011881	GCGG	2	8	37710	37717	0 %	0 %	75 %	25 %	219883295
85	NC_011881	TGAC	2	8	37875	37882	25 %	25 %	25 %	25 %	219883295
86	NC_011881	GCCG	2	8	38093	38100	0 %	0 %	50 %	50 %	219883296
87	NC_011881	AACC	2	8	39079	39086	50 %	0 %	0 %	50 %	219883297
88	NC_011881	GCCG	2	8	39646	39653	0 %	0 %	50 %	50 %	219883298
89	NC_011881	GCAT	2	8	40296	40303	25 %	25 %	25 %	25 %	219883298
90	NC_011881	CGAA	2	8	42484	42491	50 %	0 %	25 %	25 %	219883301
91	NC_011881	CCGA	2	8	43558	43565	25 %	0 %	25 %	50 %	219883302
92	NC_011881	ACCG	2	8	43952	43959	25 %	0 %	25 %	50 %	219883303
93	NC_011881	GCCA	2	8	45065	45072	25 %	0 %	25 %	50 %	219883304
94	NC_011881	AGCC	2	8	45145	45152	25 %	0 %	25 %	50 %	219883304
95	NC_011881	CACC	2	8	45782	45789	25 %	0 %	0 %	75 %	219883305
96	NC_011881	CCAA	2	8	46236	46243	50 %	0 %	0 %	50 %	219883305
97	NC_011881	GATG	2	8	46559	46566	25 %	25 %	50 %	0 %	219883305
98	NC_011881	CGGG	2	8	47138	47145	0 %	0 %	75 %	25 %	219883306
99	NC_011881	TGTT	2	8	47392	47399	0 %	75 %	25 %	0 %	219883306
100	NC_011881	GCCG	2	8	49693	49700	0 %	0 %	50 %	50 %	219883306
101	NC_011881	CCGG	2	8	50281	50288	0 %	0 %	50 %	50 %	219883306
102	NC_011881	TGCG	2	8	50421	50428	0 %	25 %	50 %	25 %	219883306
103	NC_011881	GGCG	2	8	50820	50827	0 %	0 %	75 %	25 %	219883306
104	NC_011881	ACCT	2	8	51873	51880	25 %	25 %	0 %	50 %	219883308
105	NC_011881	GCCT	2	8	52039	52046	0 %	25 %	25 %	50 %	219883308
106	NC_011881	CACC	2	8	52372	52379	25 %	0 %	0 %	75 %	219883309
107	NC_011881	GCTG	2	8	52857	52864	0 %	25 %	50 %	25 %	219883309
108	NC_011881	TATC	2	8	53608	53615	25 %	50 %	0 %	25 %	219883310
109	NC_011881	GCCA	2	8	53912	53919	25 %	0 %	25 %	50 %	219883310
110	NC_011881	TGTT	2	8	56168	56175	0 %	75 %	25 %	0 %	219883311
111	NC_011881	GTTC	2	8	56299	56306	0 %	50 %	25 %	25 %	219883311
112	NC_011881	GCCG	2	8	56797	56804	0 %	0 %	50 %	50 %	219883311
113	NC_011881	GTAG	2	8	57056	57063	25 %	25 %	50 %	0 %	219883311
114	NC_011881	GAGC	2	8	57523	57530	25 %	0 %	50 %	25 %	219883312
115	NC_011881	GTCC	2	8	57749	57756	0 %	25 %	25 %	50 %	219883313
116	NC_011881	TGGT	2	8	58206	58213	0 %	50 %	50 %	0 %	219883313
117	NC_011881	GGCC	2	8	58761	58768	0 %	0 %	50 %	50 %	219883314
118	NC_011881	TTGG	2	8	58799	58806	0 %	50 %	50 %	0 %	219883314
119	NC_011881	GTTC	2	8	59369	59376	0 %	50 %	25 %	25 %	219883314
120	NC_011881	CCAG	2	8	59379	59386	25 %	0 %	25 %	50 %	219883314
121	NC_011881	GCTT	2	8	59489	59496	0 %	50 %	25 %	25 %	219883315
122	NC_011881	AGTG	2	8	59774	59781	25 %	25 %	50 %	0 %	219883315
123	NC_011881	TTCG	2	8	60133	60140	0 %	50 %	25 %	25 %	219883315
124	NC_011881	CGGT	2	8	60218	60225	0 %	25 %	50 %	25 %	219883315
125	NC_011881	GTCG	2	8	62132	62139	0 %	25 %	50 %	25 %	219883317
126	NC_011881	GAAG	2	8	62198	62205	50 %	0 %	50 %	0 %	219883317
127	NC_011881	CCCA	2	8	62322	62329	25 %	0 %	0 %	75 %	219883317
128	NC_011881	GCCC	2	8	62585	62592	0 %	0 %	25 %	75 %	219883318
129	NC_011881	GCTG	2	8	62631	62638	0 %	25 %	50 %	25 %	219883318
130	NC_011881	CGCC	2	8	63173	63180	0 %	0 %	25 %	75 %	219883319
131	NC_011881	GAAG	2	8	63416	63423	50 %	0 %	50 %	0 %	219883319
132	NC_011881	CAGC	2	8	63584	63591	25 %	0 %	25 %	50 %	219883319
133	NC_011881	CGGA	2	8	63747	63754	25 %	0 %	50 %	25 %	219883319
134	NC_011881	CCGC	2	8	63997	64004	0 %	0 %	25 %	75 %	219883319
135	NC_011881	TGGC	2	8	64350	64357	0 %	25 %	50 %	25 %	219883319
136	NC_011881	ACCA	2	8	65011	65018	50 %	0 %	0 %	50 %	219883320
137	NC_011881	CTTC	2	8	65440	65447	0 %	50 %	0 %	50 %	219883322
138	NC_011881	GAGC	2	8	65762	65769	25 %	0 %	50 %	25 %	219883322
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140	NC_011881	GCGA	2	8	66220	66227	25 %	0 %	50 %	25 %	219883323
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.