MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	ATCTTC	2	12	4477	4488	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219883100
2	NC_011880	CTTTTA	2	12	8254	8265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219883104
3	NC_011880	TCTTGG	2	12	12522	12533	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219883111
4	NC_011880	TGACCA	2	12	13222	13233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219883111
5	NC_011880	TGGAAG	2	12	13885	13896	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219883111
6	NC_011880	CTGGGT	2	12	20593	20604	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219883114
7	NC_011880	CCCTCG	2	12	22507	22518	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219883115
8	NC_011880	AAGGGA	2	12	23735	23746	50 %	0 %	50 %	0 %	219883116
9	NC_011880	ATCTGC	2	12	23861	23872	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011880	AGGAGA	2	12	27671	27682	50 %	0 %	50 %	0 %	219883120
11	NC_011880	AGCAAG	2	12	28151	28162	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219883120
12	NC_011880	ACAGGG	2	12	29097	29108	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219883121
13	NC_011880	GCCTGG	2	12	29749	29760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883122
14	NC_011880	CTCCAA	2	12	32157	32168	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	219883123
15	NC_011880	TCCTGT	2	12	32767	32778	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219883124
16	NC_011880	GGAGAT	2	12	35273	35284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219883126
17	NC_011880	TTACCG	2	12	36882	36893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883127
18	NC_011880	TAAGGA	2	12	40216	40227	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219883131
19	NC_011880	GGCTCA	2	12	46287	46298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011880	AGGGGC	2	12	47241	47252	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219883136
21	NC_011880	GGGTAA	2	12	48803	48814	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011880	GTCCCT	2	12	58210	58221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219883146
23	NC_011880	CACCCC	2	12	59243	59254	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	219883146
24	NC_011880	ATTCCA	2	12	63496	63507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883149
25	NC_011880	AAGCGT	2	12	64661	64672	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883149
26	NC_011880	CTAAGG	2	12	68974	68985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883150
27	NC_011880	TATCAT	2	12	69380	69391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	219883150
28	NC_011880	ATCTTC	2	12	69579	69590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219883150
29	NC_011880	AGGAAA	2	12	74045	74056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883151
30	NC_011880	TCTAAA	2	12	74454	74465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219883151
31	NC_011880	ATTTGA	2	12	74651	74662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219883151
32	NC_011880	TGATCC	2	12	77019	77030	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883151
33	NC_011880	GATACC	2	12	77967	77978	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011880	GCCTGA	2	12	79235	79246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883154
35	NC_011880	GAAGCC	2	12	83229	83240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883156
36	NC_011880	TGAAGC	2	12	83693	83704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883156
37	NC_011880	CCCATC	2	12	84469	84480	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	219883156
38	NC_011880	GCAACA	2	12	88201	88212	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	219883159
39	NC_011880	CCGATG	2	12	88254	88265	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883159
40	NC_011880	TGCAGG	2	12	95486	95497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219883165
41	NC_011880	TCCCCA	2	12	105290	105301	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	219883176
42	NC_011880	CTTAGA	2	12	106132	106143	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219883176
43	NC_011880	GCATAG	2	12	109301	109312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883185
44	NC_011880	CTGAGC	2	12	109540	109551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883185
45	NC_011880	CCACTG	2	12	111442	111453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883186
46	NC_011880	CTATGG	2	12	111868	111879	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219883186
47	NC_011880	TCGGCA	2	12	117849	117860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883188
48	NC_011880	TGGCTG	2	12	128484	128495	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219883194
49	NC_011880	AGGGCA	2	12	129914	129925	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219883196
50	NC_011880	ACTGTC	2	12	131651	131662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883198
51	NC_011880	GTCCTT	2	12	133408	133419	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219883199
52	NC_011880	TGGGGT	2	12	133747	133758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011880	TTGATC	2	12	134370	134381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219883200
54	NC_011880	TGAGCC	2	12	139093	139104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883204
55	NC_011880	GTGATT	2	12	139639	139650	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219883204
56	NC_011880	AGGGGC	2	12	139977	139988	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219883205
57	NC_011880	GCTGGT	2	12	141656	141667	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219883206
58	NC_011880	GGGTTG	2	12	144546	144557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883209
59	NC_011880	CTGCAT	2	12	144679	144690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883209
60	NC_011880	GGGATT	2	12	145072	145083	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219883209
61	NC_011880	AGCTAT	2	12	145881	145892	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219883210
62	NC_011880	CCAGAT	2	12	147571	147582	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219883211
63	NC_011880	CACCTG	2	12	152755	152766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883215
64	NC_011880	CAGAAG	2	12	159703	159714	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219883219
65	NC_011880	ATCTGC	2	12	164689	164700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883222
66	NC_011880	ACACAG	2	12	168891	168902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	219883226
67	NC_011880	ACTTTC	2	12	171963	171974	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219883229
68	NC_011880	ATGCTT	2	12	182671	182682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011880	CTCCAA	2	12	185323	185334	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	219883240
70	NC_011880	TCGCTC	2	12	186025	186036	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011880	TACAAT	2	12	188566	188577	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011880	GCTTAG	2	12	196048	196059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011880	CATCGC	2	12	196619	196630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883256

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.