MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	TGGGA	2	10	7616	7625	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011880	GGCTC	2	10	7644	7653	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011880	TGACT	2	10	7762	7771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011880	GCACT	2	10	7817	7826	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011880	ATCCC	2	10	23897	23906	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_011880	GAGTG	2	10	42534	42543	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011880	AGCAG	2	10	46314	46323	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011880	TGGGT	2	10	48295	48304	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011880	CCTAA	2	10	50400	50409	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011880	TTATT	2	10	86260	86269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011880	ACTCA	2	10	103939	103948	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011880	AGATT	2	10	110649	110658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011880	GCTTC	2	10	130717	130726	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011880	TGAGG	2	10	131315	131324	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011880	GCTTC	2	10	132909	132918	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011880	AGTTA	2	10	133818	133827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011880	TAAAT	2	10	160175	160184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011880	ACTCT	2	10	163614	163623	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011880	ATTGC	2	10	171196	171205	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011880	GGATG	2	10	177983	177992	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011880	GGCAT	2	10	181810	181819	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011880	GTCCA	2	10	182839	182848	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011880	CTGAA	2	10	186373	186382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011880	CTCAT	2	10	189092	189101	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011880	CCATT	2	10	189250	189259	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011880	TTGAT	2	10	189661	189670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011880	ATGAG	2	10	191643	191652	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011880	CTCAT	2	10	192582	192591	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.