MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 2248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	TCG	2	6	4	9	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011880	ATA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883097
3	NC_011880	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
4	NC_011880	CAG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
5	NC_011880	TGA	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
6	NC_011880	GAG	2	6	672	677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883097
7	NC_011880	CCT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883097
8	NC_011880	TCC	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883097
9	NC_011880	CCA	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883097
10	NC_011880	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
11	NC_011880	TGC	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883097
12	NC_011880	CTG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883097
13	NC_011880	GCA	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
14	NC_011880	GAC	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
15	NC_011880	GAA	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883097
16	NC_011880	TAG	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
17	NC_011880	TCA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
18	NC_011880	CGC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883097
19	NC_011880	AGA	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883097
20	NC_011880	CAT	2	6	2072	2077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
21	NC_011880	ATC	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
22	NC_011880	AAT	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883097
23	NC_011880	GCA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011880	TCT	2	6	2349	2354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011880	ATC	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883098
26	NC_011880	ATT	2	6	2879	2884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883098
27	NC_011880	GGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011880	TGG	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011880	ATC	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011880	TCC	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011880	AAC	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011880	TTG	2	6	3242	3247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011880	CTG	2	6	3386	3391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011880	GGT	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011880	TCC	2	6	3443	3448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011880	AGT	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011880	GCA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011880	GTT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011880	GGA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011880	TAA	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011880	CAC	3	9	4182	4190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883099
42	NC_011880	TCC	2	6	4258	4263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883099
43	NC_011880	TTC	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883099
44	NC_011880	CCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883100
45	NC_011880	TCC	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011880	TGT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011880	GCA	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011880	CCG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011880	ACC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883101
50	NC_011880	AAG	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883101
51	NC_011880	GGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011880	CAC	3	9	5357	5365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883102
53	NC_011880	GCA	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883102
54	NC_011880	TAC	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883102
55	NC_011880	TCG	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883102
56	NC_011880	AGA	3	9	5524	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883102
57	NC_011880	TAG	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011880	CTG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011880	TGA	2	6	5997	6002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011880	TGC	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011880	AGC	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011880	AGG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011880	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883103
64	NC_011880	TGC	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
65	NC_011880	GAC	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883103
66	NC_011880	ATG	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883103
67	NC_011880	GAG	3	9	6579	6587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883103
68	NC_011880	GCG	2	6	6651	6656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
69	NC_011880	TGG	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
70	NC_011880	CTT	2	6	6812	6817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883103
71	NC_011880	CTG	2	6	6961	6966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
72	NC_011880	TGC	2	6	6977	6982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
73	NC_011880	GCT	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
74	NC_011880	TCG	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
75	NC_011880	AAC	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883103
76	NC_011880	TGG	2	6	7280	7285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
77	NC_011880	GGC	2	6	7370	7375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
78	NC_011880	GCG	2	6	7380	7385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
79	NC_011880	GGC	2	6	7398	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
80	NC_011880	TGG	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
81	NC_011880	AGC	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883103
82	NC_011880	AAG	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883103
83	NC_011880	TCG	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
84	NC_011880	GTA	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011880	TGT	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011880	AGG	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011880	CAT	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011880	AAG	2	6	8175	8180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883104
89	NC_011880	AGG	2	6	8311	8316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883104
90	NC_011880	TAC	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883104
91	NC_011880	CCA	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883104
92	NC_011880	TAT	2	6	8641	8646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883104
93	NC_011880	TAT	2	6	8759	8764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883104
94	NC_011880	GTT	2	6	8853	8858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011880	TTC	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883105
96	NC_011880	TCC	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011880	CAG	2	6	9319	9324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011880	TGA	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883106
99	NC_011880	GCG	2	6	9486	9491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883106
100	NC_011880	CCG	2	6	9608	9613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011880	GCC	2	6	9663	9668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883107
102	NC_011880	CAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883107
103	NC_011880	CCG	2	6	9754	9759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883107
104	NC_011880	GCG	2	6	9805	9810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883107
105	NC_011880	GGT	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883107
106	NC_011880	GCA	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883107
107	NC_011880	ACT	2	6	10107	10112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883107
108	NC_011880	ATG	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883107
109	NC_011880	CAG	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883108
110	NC_011880	GCC	3	9	10198	10206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883108
111	NC_011880	CCG	2	6	10220	10225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883108
112	NC_011880	GAT	2	6	10350	10355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
113	NC_011880	GAC	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883108
114	NC_011880	GAA	2	6	10564	10569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883108
115	NC_011880	TCC	2	6	10584	10589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883108
116	NC_011880	ATG	2	6	10631	10636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
117	NC_011880	GCT	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883108
118	NC_011880	TCA	2	6	10700	10705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883108
119	NC_011880	TGG	2	6	10733	10738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883108
120	NC_011880	CTC	2	6	10756	10761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883108
121	NC_011880	AAG	2	6	10782	10787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883108
122	NC_011880	ATG	2	6	10796	10801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
123	NC_011880	CTT	2	6	10848	10853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011880	TTA	2	6	10888	10893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011880	AAG	2	6	10909	10914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011880	CCG	2	6	11056	11061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883109
127	NC_011880	GTT	2	6	11067	11072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883109
128	NC_011880	TGG	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883109
129	NC_011880	CAC	2	6	11201	11206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883109
130	NC_011880	ATA	2	6	11248	11253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883109
131	NC_011880	TCC	2	6	11329	11334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883109
132	NC_011880	AGC	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883109
133	NC_011880	CAA	2	6	11490	11495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883109
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251	NC_011880	AAT	2	6	19607	19612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_011880	TTA	2	6	19692	19697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_011880	CAG	2	6	20070	20075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883114
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257	NC_011880	ACT	2	6	20354	20359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883114
258	NC_011880	GTT	2	6	20475	20480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883114
259	NC_011880	GCC	2	6	20493	20498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883114
260	NC_011880	GCT	2	6	20621	20626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883114
261	NC_011880	CTG	2	6	20791	20796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883114
262	NC_011880	GTA	2	6	20821	20826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883114
263	NC_011880	ATC	2	6	20884	20889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883114
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270	NC_011880	TCC	2	6	21483	21488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883115
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274	NC_011880	CTG	2	6	21657	21662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883115
275	NC_011880	TGT	2	6	21712	21717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883115
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279	NC_011880	CAT	2	6	21921	21926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883115
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287	NC_011880	CTC	2	6	22577	22582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_011880	GTT	2	6	22590	22595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011880	TCA	2	6	22610	22615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_011880	AGC	2	6	22704	22709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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308	NC_011880	TAA	2	6	23873	23878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_011880	GAA	2	6	23909	23914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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375	NC_011880	TTG	2	6	29614	29619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_011880	TCC	2	6	29955	29960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
380	NC_011880	TTG	2	6	29978	29983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
381	NC_011880	GAC	2	6	30027	30032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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383	NC_011880	GCG	2	6	30377	30382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_011880	GCG	2	6	30505	30510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_011880	TGT	2	6	30654	30659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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