MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	TCG	2	6	4	9	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011880	GCA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011880	TCT	2	6	2349	2354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011880	GGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011880	TGG	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011880	ATC	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011880	TCC	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011880	AAC	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011880	TTG	2	6	3242	3247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011880	CTG	2	6	3386	3391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011880	GGT	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011880	TCC	2	6	3443	3448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011880	AGT	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011880	GCA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011880	GTT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011880	GGA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011880	TAA	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011880	TCC	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011880	TGT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011880	GCA	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011880	CCG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011880	GGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011880	TAG	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011880	CTG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011880	TGA	2	6	5997	6002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011880	TGC	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011880	AGC	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011880	AGG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011880	GTA	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011880	TGT	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011880	AGG	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011880	CAT	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011880	GTT	2	6	8853	8858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011880	TCC	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011880	CAG	2	6	9319	9324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011880	CCG	2	6	9608	9613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011880	CTT	2	6	10848	10853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011880	TTA	2	6	10888	10893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011880	AAG	2	6	10909	10914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011880	ATT	2	6	14428	14433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011880	GAT	2	6	19575	19580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011880	AAT	2	6	19588	19593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011880	AAT	2	6	19607	19612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011880	TTA	2	6	19692	19697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011880	CTC	2	6	22577	22582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011880	GTT	2	6	22590	22595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011880	TCA	2	6	22610	22615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011880	AGC	2	6	22704	22709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011880	TGT	2	6	23783	23788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011880	TCC	2	6	23806	23811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011880	TAA	2	6	23873	23878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011880	GAA	2	6	23909	23914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011880	ATA	2	6	23924	23929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011880	ATC	2	6	23933	23938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011880	AAT	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011880	TTG	2	6	29614	29619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011880	TCC	2	6	29955	29960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011880	TTG	2	6	29978	29983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011880	GAC	2	6	30027	30032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011880	GTT	2	6	30132	30137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011880	GCG	2	6	30377	30382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011880	GCG	2	6	30505	30510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011880	TGT	2	6	30654	30659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011880	GCC	2	6	30806	30811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011880	TAA	2	6	30898	30903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011880	TGG	2	6	31209	31214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011880	GTC	2	6	31277	31282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011880	CAT	2	6	31304	31309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011880	GAT	2	6	31469	31474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011880	GCC	2	6	31508	31513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011880	GGC	2	6	31528	31533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011880	ACC	2	6	31682	31687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011880	CTG	3	9	31737	31745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011880	GTC	2	6	32520	32525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011880	GTC	2	6	32539	32544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011880	TCC	2	6	33987	33992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011880	TAC	3	9	34091	34099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011880	GCA	2	6	34163	34168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011880	CAG	2	6	34203	34208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011880	TCT	2	6	34276	34281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011880	AGC	2	6	34338	34343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011880	CTT	2	6	41683	41688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011880	GAC	2	6	42293	42298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011880	TAC	2	6	43318	43323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011880	TGT	2	6	44426	44431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011880	TCA	2	6	44442	44447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011880	AAC	2	6	44518	44523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011880	GCG	2	6	44586	44591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011880	GTC	2	6	44677	44682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011880	TGC	2	6	44868	44873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011880	CTG	2	6	44933	44938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011880	CTA	2	6	45008	45013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011880	CTA	2	6	45060	45065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011880	TTA	2	6	45081	45086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011880	AGT	2	6	45145	45150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011880	TGA	2	6	45274	45279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011880	AAC	2	6	45319	45324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011880	TTC	2	6	45769	45774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011880	CAC	2	6	45837	45842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011880	GAG	2	6	45970	45975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011880	TCC	2	6	46080	46085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011880	AGC	2	6	46237	46242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011880	CTT	2	6	46397	46402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011880	TCG	2	6	48099	48104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011880	GCT	2	6	48208	48213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011880	AAC	2	6	48273	48278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011880	GTT	2	6	48362	48367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011880	GCA	2	6	48431	48436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011880	AGG	2	6	48512	48517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011880	TAA	2	6	48581	48586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011880	TTA	2	6	48592	48597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011880	GAT	2	6	48738	48743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011880	TCT	2	6	48869	48874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011880	CTG	2	6	49026	49031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011880	CAG	2	6	49224	49229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011880	ACT	2	6	49391	49396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011880	GGC	2	6	49745	49750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011880	CAG	2	6	49889	49894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011880	CTT	2	6	50122	50127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011880	AGT	2	6	50491	50496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011880	TGC	2	6	50769	50774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011880	CAT	2	6	50837	50842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011880	TGG	2	6	50851	50856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011880	TGC	2	6	51502	51507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011880	GGC	2	6	51570	51575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011880	CTC	2	6	52691	52696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011880	TGC	2	6	52822	52827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011880	TGG	2	6	52962	52967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011880	AAT	2	6	53014	53019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011880	CGA	2	6	53047	53052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011880	AGC	2	6	53126	53131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011880	CCA	2	6	53268	53273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011880	CCA	2	6	53391	53396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011880	CAA	2	6	53476	53481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011880	ACG	2	6	53534	53539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011880	TCC	2	6	53549	53554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011880	GCT	2	6	54065	54070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011880	CGA	2	6	54199	54204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011880	TTG	2	6	62622	62627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011880	TAA	2	6	62984	62989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_011880	TTG	2	6	86291	86296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_011880	GGA	2	6	98937	98942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_011880	ACT	2	6	99252	99257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_011880	TCT	2	6	100517	100522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.