MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 1862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	ATA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883097
2	NC_011880	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
3	NC_011880	CAG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
4	NC_011880	TGA	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
5	NC_011880	GAG	2	6	672	677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883097
6	NC_011880	CCT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883097
7	NC_011880	TCC	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883097
8	NC_011880	CCA	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883097
9	NC_011880	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
10	NC_011880	TGC	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883097
11	NC_011880	CTG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883097
12	NC_011880	GCA	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
13	NC_011880	GAC	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
14	NC_011880	GAA	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883097
15	NC_011880	TAG	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
16	NC_011880	TCA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
17	NC_011880	CGC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883097
18	NC_011880	AGA	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883097
19	NC_011880	CAT	2	6	2072	2077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
20	NC_011880	ATC	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
21	NC_011880	AAT	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883097
22	NC_011880	ATC	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883098
23	NC_011880	ATT	2	6	2879	2884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883098
24	NC_011880	CAC	3	9	4182	4190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883099
25	NC_011880	TCC	2	6	4258	4263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883099
26	NC_011880	TTC	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883099
27	NC_011880	CCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883100
28	NC_011880	ACC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883101
29	NC_011880	AAG	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883101
30	NC_011880	CAC	3	9	5357	5365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883102
31	NC_011880	GCA	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883102
32	NC_011880	TAC	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883102
33	NC_011880	TCG	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883102
34	NC_011880	AGA	3	9	5524	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883102
35	NC_011880	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883103
36	NC_011880	TGC	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
37	NC_011880	GAC	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883103
38	NC_011880	ATG	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883103
39	NC_011880	GAG	3	9	6579	6587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883103
40	NC_011880	GCG	2	6	6651	6656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
41	NC_011880	TGG	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
42	NC_011880	CTT	2	6	6812	6817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883103
43	NC_011880	CTG	2	6	6961	6966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
44	NC_011880	TGC	2	6	6977	6982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
45	NC_011880	GCT	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
46	NC_011880	TCG	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
47	NC_011880	AAC	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883103
48	NC_011880	TGG	2	6	7280	7285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
49	NC_011880	GGC	2	6	7370	7375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
50	NC_011880	GCG	2	6	7380	7385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
51	NC_011880	GGC	2	6	7398	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
52	NC_011880	TGG	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
53	NC_011880	AGC	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883103
54	NC_011880	AAG	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883103
55	NC_011880	TCG	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
56	NC_011880	AAG	2	6	8175	8180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883104
57	NC_011880	AGG	2	6	8311	8316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883104
58	NC_011880	TAC	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883104
59	NC_011880	CCA	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883104
60	NC_011880	TAT	2	6	8641	8646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883104
61	NC_011880	TAT	2	6	8759	8764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883104
62	NC_011880	TTC	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883105
63	NC_011880	TGA	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883106
64	NC_011880	GCG	2	6	9486	9491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883106
65	NC_011880	GCC	2	6	9663	9668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883107
66	NC_011880	CAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883107
67	NC_011880	CCG	2	6	9754	9759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883107
68	NC_011880	GCG	2	6	9805	9810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883107
69	NC_011880	GGT	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883107
70	NC_011880	GCA	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883107
71	NC_011880	ACT	2	6	10107	10112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883107
72	NC_011880	ATG	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883107
73	NC_011880	CAG	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883108
74	NC_011880	GCC	3	9	10198	10206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883108
75	NC_011880	CCG	2	6	10220	10225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883108
76	NC_011880	GAT	2	6	10350	10355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
77	NC_011880	GAC	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883108
78	NC_011880	GAA	2	6	10564	10569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883108
79	NC_011880	TCC	2	6	10584	10589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883108
80	NC_011880	ATG	2	6	10631	10636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
81	NC_011880	GCT	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883108
82	NC_011880	TCA	2	6	10700	10705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883108
83	NC_011880	TGG	2	6	10733	10738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883108
84	NC_011880	CTC	2	6	10756	10761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883108
85	NC_011880	AAG	2	6	10782	10787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883108
86	NC_011880	ATG	2	6	10796	10801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
87	NC_011880	CCG	2	6	11056	11061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883109
88	NC_011880	GTT	2	6	11067	11072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883109
89	NC_011880	TGG	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883109
90	NC_011880	CAC	2	6	11201	11206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883109
91	NC_011880	ATA	2	6	11248	11253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883109
92	NC_011880	TCC	2	6	11329	11334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883109
93	NC_011880	AGC	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883109
94	NC_011880	CAA	2	6	11490	11495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883109
95	NC_011880	AGC	2	6	11502	11507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883109
96	NC_011880	AAC	2	6	11542	11547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883109
97	NC_011880	CAG	2	6	11565	11570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883109
98	NC_011880	CAA	2	6	11577	11582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883109
99	NC_011880	AGC	2	6	11892	11897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883110
100	NC_011880	CAA	2	6	11914	11919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883110
101	NC_011880	TCA	2	6	12119	12124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883110
102	NC_011880	CGC	2	6	12156	12161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883110
103	NC_011880	GCT	2	6	12197	12202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883110
104	NC_011880	TGC	2	6	12252	12257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883110
105	NC_011880	TCT	2	6	12355	12360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883111
106	NC_011880	CAT	2	6	12419	12424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883111
107	NC_011880	GTT	2	6	12475	12480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883111
108	NC_011880	AGC	2	6	12500	12505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883111
109	NC_011880	GTT	2	6	12571	12576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883111
110	NC_011880	TGG	2	6	12726	12731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883111
111	NC_011880	GGC	2	6	12742	12747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883111
112	NC_011880	CAT	2	6	12812	12817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883111
113	NC_011880	CTG	3	9	12959	12967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883111
114	NC_011880	TCC	2	6	13068	13073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883111
115	NC_011880	CTG	2	6	13087	13092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883111
116	NC_011880	ATC	2	6	13139	13144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883111
117	NC_011880	GGT	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883111
118	NC_011880	AAG	2	6	13281	13286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883111
119	NC_011880	GGA	2	6	13442	13447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883111
120	NC_011880	GAG	2	6	13765	13770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883111
121	NC_011880	CCA	2	6	13774	13779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883111
122	NC_011880	TAC	2	6	13846	13851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883111
123	NC_011880	GAT	2	6	13945	13950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883111
124	NC_011880	ATC	2	6	14006	14011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883111
125	NC_011880	TGC	2	6	14187	14192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883111
126	NC_011880	AGC	2	6	14234	14239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883111
127	NC_011880	CTC	2	6	14318	14323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883111
128	NC_011880	TGT	2	6	14612	14617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883112
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377	NC_011880	CTT	2	6	37867	37872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883128
378	NC_011880	GAA	2	6	38218	38223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883129
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381	NC_011880	GAT	2	6	38390	38395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883130
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383	NC_011880	GAT	2	6	38580	38585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883130
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484	NC_011880	GCC	2	6	55936	55941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883145
485	NC_011880	GCA	2	6	56055	56060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883145
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499	NC_011880	CCA	2	6	57427	57432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883146
500	NC_011880	GGC	2	6	57433	57438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883146

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