MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	TC	3	6	726	731	0 %	50 %	0 %	50 %	219883097
2	NC_011880	GC	3	6	1296	1301	0 %	0 %	50 %	50 %	219883097
3	NC_011880	TC	3	6	2293	2298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011880	TA	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	219883098
5	NC_011880	AT	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011880	GA	3	6	4626	4631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011880	AG	3	6	4684	4689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011880	GC	3	6	6614	6619	0 %	0 %	50 %	50 %	219883103
9	NC_011880	GA	3	6	7717	7722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011880	CT	3	6	7726	7731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011880	AC	3	6	7948	7953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011880	AT	3	6	8880	8885	50 %	50 %	0 %	0 %	219883105
13	NC_011880	CT	3	6	9344	9349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011880	TG	3	6	10573	10578	0 %	50 %	50 %	0 %	219883108
15	NC_011880	AC	3	6	11370	11375	50 %	0 %	0 %	50 %	219883109
16	NC_011880	CT	3	6	12097	12102	0 %	50 %	0 %	50 %	219883110
17	NC_011880	TC	3	6	13879	13884	0 %	50 %	0 %	50 %	219883111
18	NC_011880	AT	3	6	14541	14546	50 %	50 %	0 %	0 %	219883112
19	NC_011880	TG	3	6	16181	16186	0 %	50 %	50 %	0 %	219883112
20	NC_011880	TC	3	6	16247	16252	0 %	50 %	0 %	50 %	219883112
21	NC_011880	TC	3	6	18190	18195	0 %	50 %	0 %	50 %	219883113
22	NC_011880	GA	3	6	18723	18728	50 %	0 %	50 %	0 %	219883113
23	NC_011880	TG	3	6	18809	18814	0 %	50 %	50 %	0 %	219883113
24	NC_011880	AT	3	6	18920	18925	50 %	50 %	0 %	0 %	219883113
25	NC_011880	CT	3	6	19401	19406	0 %	50 %	0 %	50 %	219883113
26	NC_011880	AC	3	6	19965	19970	50 %	0 %	0 %	50 %	219883114
27	NC_011880	CA	3	6	23301	23306	50 %	0 %	0 %	50 %	219883116
28	NC_011880	GA	3	6	24461	24466	50 %	0 %	50 %	0 %	219883117
29	NC_011880	AT	3	6	27058	27063	50 %	50 %	0 %	0 %	219883119
30	NC_011880	GT	3	6	28273	28278	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
31	NC_011880	GT	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	219883120
32	NC_011880	TC	3	6	28811	28816	0 %	50 %	0 %	50 %	219883120
33	NC_011880	CA	3	6	30168	30173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011880	TG	3	6	31181	31186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011880	TC	3	6	31461	31466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011880	TC	3	6	31757	31762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011880	TC	3	6	31892	31897	0 %	50 %	0 %	50 %	219883123
38	NC_011880	TC	3	6	33966	33971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011880	GC	3	6	35015	35020	0 %	0 %	50 %	50 %	219883126
40	NC_011880	GT	3	6	35667	35672	0 %	50 %	50 %	0 %	219883126
41	NC_011880	GA	3	6	36597	36602	50 %	0 %	50 %	0 %	219883127
42	NC_011880	GT	3	6	37921	37926	0 %	50 %	50 %	0 %	219883128
43	NC_011880	TG	3	6	41637	41642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011880	TG	3	6	42972	42977	0 %	50 %	50 %	0 %	219883133
45	NC_011880	TA	3	6	43264	43269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011880	TG	3	6	43591	43596	0 %	50 %	50 %	0 %	219883134
47	NC_011880	CG	3	6	45408	45413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011880	GC	3	6	45586	45591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011880	GA	3	6	45676	45681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011880	CA	3	6	46117	46122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011880	TC	3	6	46483	46488	0 %	50 %	0 %	50 %	219883135
52	NC_011880	CT	3	6	47508	47513	0 %	50 %	0 %	50 %	219883136
53	NC_011880	TA	3	6	48156	48161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011880	AT	3	6	52037	52042	50 %	50 %	0 %	0 %	219883142
55	NC_011880	GC	3	6	52609	52614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011880	AG	3	6	55737	55742	50 %	0 %	50 %	0 %	219883145
57	NC_011880	AT	3	6	57144	57149	50 %	50 %	0 %	0 %	219883146
58	NC_011880	CT	3	6	57775	57780	0 %	50 %	0 %	50 %	219883146
59	NC_011880	GA	3	6	57982	57987	50 %	0 %	50 %	0 %	219883146
60	NC_011880	AT	3	6	61010	61015	50 %	50 %	0 %	0 %	219883147
61	NC_011880	CT	3	6	61081	61086	0 %	50 %	0 %	50 %	219883147
62	NC_011880	CT	3	6	61484	61489	0 %	50 %	0 %	50 %	219883147
63	NC_011880	AG	3	6	61866	61871	50 %	0 %	50 %	0 %	219883147
64	NC_011880	GA	3	6	62747	62752	50 %	0 %	50 %	0 %	219883148
65	NC_011880	GA	3	6	62805	62810	50 %	0 %	50 %	0 %	219883148
66	NC_011880	GA	3	6	64348	64353	50 %	0 %	50 %	0 %	219883149
67	NC_011880	GA	3	6	65460	65465	50 %	0 %	50 %	0 %	219883149
68	NC_011880	TA	3	6	66815	66820	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
69	NC_011880	AG	3	6	67033	67038	50 %	0 %	50 %	0 %	219883150
70	NC_011880	CA	3	6	67883	67888	50 %	0 %	0 %	50 %	219883150
71	NC_011880	GA	3	6	68204	68209	50 %	0 %	50 %	0 %	219883150
72	NC_011880	TC	3	6	68650	68655	0 %	50 %	0 %	50 %	219883150
73	NC_011880	AT	3	6	68706	68711	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
74	NC_011880	CT	3	6	68759	68764	0 %	50 %	0 %	50 %	219883150
75	NC_011880	AT	3	6	69181	69186	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
76	NC_011880	TA	3	6	70587	70592	50 %	50 %	0 %	0 %	219883150
77	NC_011880	CT	3	6	71284	71289	0 %	50 %	0 %	50 %	219883150
78	NC_011880	AT	3	6	74781	74786	50 %	50 %	0 %	0 %	219883151
79	NC_011880	CA	3	6	74843	74848	50 %	0 %	0 %	50 %	219883151
80	NC_011880	CT	3	6	75487	75492	0 %	50 %	0 %	50 %	219883151
81	NC_011880	GT	3	6	76118	76123	0 %	50 %	50 %	0 %	219883151
82	NC_011880	CA	3	6	80627	80632	50 %	0 %	0 %	50 %	219883155
83	NC_011880	AG	3	6	82846	82851	50 %	0 %	50 %	0 %	219883155
84	NC_011880	AC	3	6	83570	83575	50 %	0 %	0 %	50 %	219883156
85	NC_011880	TG	3	6	83847	83852	0 %	50 %	50 %	0 %	219883156
86	NC_011880	AT	3	6	85208	85213	50 %	50 %	0 %	0 %	219883157
87	NC_011880	TA	3	6	85388	85393	50 %	50 %	0 %	0 %	219883157
88	NC_011880	AT	3	6	85567	85572	50 %	50 %	0 %	0 %	219883157
89	NC_011880	CT	3	6	86638	86643	0 %	50 %	0 %	50 %	219883159
90	NC_011880	CA	3	6	90201	90206	50 %	0 %	0 %	50 %	219883161
91	NC_011880	TC	3	6	91187	91192	0 %	50 %	0 %	50 %	219883162
92	NC_011880	GA	3	6	92509	92514	50 %	0 %	50 %	0 %	219883162
93	NC_011880	GT	3	6	94113	94118	0 %	50 %	50 %	0 %	219883164
94	NC_011880	CG	3	6	94176	94181	0 %	0 %	50 %	50 %	219883164
95	NC_011880	TC	3	6	95009	95014	0 %	50 %	0 %	50 %	219883164
96	NC_011880	TG	3	6	96525	96530	0 %	50 %	50 %	0 %	219883165
97	NC_011880	CT	3	6	96591	96596	0 %	50 %	0 %	50 %	219883165
98	NC_011880	AT	3	6	96716	96721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011880	AC	5	10	97645	97654	50 %	0 %	0 %	50 %	219883167
100	NC_011880	CA	3	6	98875	98880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011880	TA	3	6	99201	99206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011880	GT	3	6	99360	99365	0 %	50 %	50 %	0 %	219883168
103	NC_011880	AG	3	6	99578	99583	50 %	0 %	50 %	0 %	219883168
104	NC_011880	CA	3	6	104857	104862	50 %	0 %	0 %	50 %	219883175
105	NC_011880	AG	3	6	106050	106055	50 %	0 %	50 %	0 %	219883176
106	NC_011880	AG	4	8	106900	106907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011880	GA	3	6	107204	107209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011880	CT	3	6	107603	107608	0 %	50 %	0 %	50 %	219883181
109	NC_011880	GA	3	6	107686	107691	50 %	0 %	50 %	0 %	219883181
110	NC_011880	GA	3	6	109737	109742	50 %	0 %	50 %	0 %	219883185
111	NC_011880	GA	3	6	109874	109879	50 %	0 %	50 %	0 %	219883185
112	NC_011880	GA	3	6	109885	109890	50 %	0 %	50 %	0 %	219883185
113	NC_011880	CA	3	6	110502	110507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011880	AG	3	6	110612	110617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011880	CA	3	6	110921	110926	50 %	0 %	0 %	50 %	219883186
116	NC_011880	TG	3	6	111452	111457	0 %	50 %	50 %	0 %	219883186
117	NC_011880	AG	3	6	113444	113449	50 %	0 %	50 %	0 %	219883186
118	NC_011880	CT	3	6	114180	114185	0 %	50 %	0 %	50 %	219883186
119	NC_011880	TC	3	6	114346	114351	0 %	50 %	0 %	50 %	219883186
120	NC_011880	GA	3	6	114577	114582	50 %	0 %	50 %	0 %	219883186
121	NC_011880	AG	3	6	115778	115783	50 %	0 %	50 %	0 %	219883186
122	NC_011880	GA	3	6	116670	116675	50 %	0 %	50 %	0 %	219883188
123	NC_011880	CT	3	6	118316	118321	0 %	50 %	0 %	50 %	219883188
124	NC_011880	GT	3	6	118966	118971	0 %	50 %	50 %	0 %	219883188
125	NC_011880	AG	3	6	120000	120005	50 %	0 %	50 %	0 %	219883188
126	NC_011880	AG	3	6	120720	120725	50 %	0 %	50 %	0 %	219883188
127	NC_011880	GA	4	8	121225	121232	50 %	0 %	50 %	0 %	219883188
128	NC_011880	AG	3	6	121431	121436	50 %	0 %	50 %	0 %	219883188
129	NC_011880	GA	3	6	123874	123879	50 %	0 %	50 %	0 %	219883190
130	NC_011880	AG	3	6	124161	124166	50 %	0 %	50 %	0 %	219883190
131	NC_011880	GC	3	6	124968	124973	0 %	0 %	50 %	50 %	219883191
132	NC_011880	AG	3	6	125442	125447	50 %	0 %	50 %	0 %	219883191
133	NC_011880	TG	3	6	125598	125603	0 %	50 %	50 %	0 %	219883191
134	NC_011880	AG	3	6	125712	125717	50 %	0 %	50 %	0 %	219883191
135	NC_011880	GA	4	8	125721	125728	50 %	0 %	50 %	0 %	219883191
136	NC_011880	GA	3	6	127836	127841	50 %	0 %	50 %	0 %	219883193
137	NC_011880	CT	3	6	128468	128473	0 %	50 %	0 %	50 %	219883194
138	NC_011880	GA	3	6	128996	129001	50 %	0 %	50 %	0 %	219883194
139	NC_011880	GT	3	6	129376	129381	0 %	50 %	50 %	0 %	219883195
140	NC_011880	TC	3	6	130665	130670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011880	TA	3	6	130926	130931	50 %	50 %	0 %	0 %	219883197
142	NC_011880	TC	3	6	131091	131096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011880	GA	3	6	132435	132440	50 %	0 %	50 %	0 %	219883198
144	NC_011880	TC	3	6	132857	132862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.