MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL01

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011879	CGAACC	2	12	9278	9289	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219882553
2	NC_011879	CTTCGC	2	12	12923	12934	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219882559
3	NC_011879	CGACAC	2	12	17128	17139	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219882566
4	NC_011879	GCGATC	2	12	20476	20487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882572
5	NC_011879	CTGACA	2	12	20707	20718	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219882573
6	NC_011879	CTGGCG	2	12	21699	21710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882574
7	NC_011879	CGCCCA	2	12	26781	26792	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	219882582
8	NC_011879	TTGCCG	2	12	33738	33749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882588
9	NC_011879	GCGGCC	2	12	38590	38601	0 %	0 %	50 %	50 %	219882595
10	NC_011879	CCCCTG	2	12	39801	39812	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219882597
11	NC_011879	AGGGAG	2	12	42330	42341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219882599
12	NC_011879	AAGGAA	2	12	43058	43069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882601
13	NC_011879	GCCGTG	2	12	45582	45593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882603
14	NC_011879	CCCGCG	2	12	46151	46162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219882604
15	NC_011879	TGACGA	2	12	47631	47642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882606
16	NC_011879	CCGCGC	2	12	48817	48828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219882608
17	NC_011879	CTGGGC	2	12	50672	50683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882611
18	NC_011879	GCAAGT	2	12	53143	53154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882615
19	NC_011879	AGGAGA	2	12	54068	54079	50 %	0 %	50 %	0 %	219882616
20	NC_011879	CCTGCC	2	12	54373	54384	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219882617
21	NC_011879	TCGGTG	2	12	58776	58787	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219882624
22	NC_011879	TCCTGG	2	12	60402	60413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882626
23	NC_011879	CTGGAC	2	12	65640	65651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882636
24	NC_011879	GGCCGC	2	12	68249	68260	0 %	0 %	50 %	50 %	219882640
25	NC_011879	CTACGG	2	12	73423	73434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882645
26	NC_011879	GTACGA	2	12	76409	76420	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882647
27	NC_011879	CCGCAC	2	12	78883	78894	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	219882648
28	NC_011879	ATCGAG	2	12	80691	80702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882650
29	NC_011879	ACGCGG	2	12	80923	80934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882650
30	NC_011879	CTTCGC	2	12	80954	80965	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219882650
31	NC_011879	AGGACC	2	12	83237	83248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882653
32	NC_011879	AGTACC	2	12	83495	83506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219882653
33	NC_011879	GTGCTC	2	12	85177	85188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882655
34	NC_011879	GGTACG	2	12	85674	85685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219882656
35	NC_011879	GGTCTT	2	12	93207	93218	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219882666
36	NC_011879	GTCGGC	2	12	94793	94804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882668
37	NC_011879	CGCCTG	2	12	98399	98410	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882671
38	NC_011879	ACTGGA	2	12	99153	99164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882673
39	NC_011879	CGCCAA	2	12	105004	105015	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219882682
40	NC_011879	GGACCG	2	12	106804	106815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882684
41	NC_011879	GGGCCA	2	12	107633	107644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882685
42	NC_011879	CTACGA	2	12	114736	114747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219882700
43	NC_011879	AGGTCA	2	12	119283	119294	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882706
44	NC_011879	GCTGCG	2	12	122145	122156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882709
45	NC_011879	GTCAGG	2	12	122207	122218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219882709
46	NC_011879	TCAACG	2	12	122601	122612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219882709
47	NC_011879	GTCCTC	2	12	122990	123001	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219882709
48	NC_011879	GCTGTT	2	12	125823	125834	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219882712
49	NC_011879	GTCCTC	2	12	126187	126198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219882713
50	NC_011879	GATCCT	2	12	127691	127702	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219882717
51	NC_011879	TCCCAG	2	12	128775	128786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219882719
52	NC_011879	GGTCAT	2	12	132145	132156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219882722
53	NC_011879	GCGCAT	2	12	132199	132210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882722
54	NC_011879	GGCCAA	2	12	132526	132537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882722
55	NC_011879	GGTCGA	2	12	132706	132717	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219882722
56	NC_011879	GGCCAG	2	12	133902	133913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882724
57	NC_011879	ATCGAA	2	12	134833	134844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219882725
58	NC_011879	CGCCGG	3	18	137934	137951	0 %	0 %	50 %	50 %	219882729
59	NC_011879	GTCCGC	2	12	138853	138864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882731
60	NC_011879	CCGCAA	2	12	139759	139770	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219882732
61	NC_011879	GGTGGC	2	12	140843	140854	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	219882734
62	NC_011879	TGGCCC	2	12	146342	146353	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882742
63	NC_011879	CTGGTC	2	12	148261	148272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882744
64	NC_011879	CGACCA	2	12	152146	152157	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219882748
65	NC_011879	AGCTGC	2	12	152813	152824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882749
66	NC_011879	GTGAAC	2	12	153623	153634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882750
67	NC_011879	CAGGCC	2	12	153910	153921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219882750
68	NC_011879	GGTGAC	2	12	156509	156520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219882752
69	NC_011879	GCTGGT	2	12	160460	160471	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219882756
70	NC_011879	GGGACA	2	12	160934	160945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219882756
71	NC_011879	GGTCCG	2	12	161563	161574	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882757
72	NC_011879	CCGGTC	2	12	162067	162078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882758
73	NC_011879	CGACGG	2	12	164223	164234	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882762
74	NC_011879	TGACGT	2	12	167967	167978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219882765
75	NC_011879	GAACAA	2	12	170126	170137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	219882767
76	NC_011879	GCGGCC	2	12	172483	172494	0 %	0 %	50 %	50 %	219882770
77	NC_011879	ACCCCC	2	12	176327	176338	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	219882775
78	NC_011879	AACCGG	2	12	178536	178547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882776
79	NC_011879	CGGCTC	2	12	183787	183798	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882779
80	NC_011879	CGGCTT	2	12	184743	184754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882780
81	NC_011879	TTGACT	2	12	194589	194600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219882791
82	NC_011879	CGTGGA	2	12	195178	195189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219882791
83	NC_011879	TCAGCC	11	66	199328	199393	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219882795
84	NC_011879	GCCTGG	2	12	200712	200723	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882797
85	NC_011879	CTCGTC	2	12	202582	202593	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219882800
86	NC_011879	TGTCGA	2	12	204403	204414	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219882803
87	NC_011879	GTCACC	2	12	204838	204849	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219882804
88	NC_011879	TCGAAG	2	12	206154	206165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882806
89	NC_011879	GCCGGT	2	12	207007	207018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882807
90	NC_011879	AGGGCC	2	12	207515	207526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882807
91	NC_011879	GGTGTC	2	12	208402	208413	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219882809
92	NC_011879	CTCGGC	2	12	214241	214252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882816
93	NC_011879	AGCTCG	2	12	216433	216444	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882818
94	NC_011879	CGTCCC	2	12	219392	219403	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219882821
95	NC_011879	TCCAAG	2	12	221061	221072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219882823
96	NC_011879	GGCCCT	2	12	226154	226165	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882828
97	NC_011879	GGCGTC	2	12	226517	226528	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882829
98	NC_011879	CTTTGG	2	12	226531	226542	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219882829
99	NC_011879	CCCAGA	2	12	230330	230341	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219882834
100	NC_011879	CGTCGA	2	12	231309	231320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882835
101	NC_011879	CGTCAG	2	12	231375	231386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882835
102	NC_011879	CGATGC	2	12	236784	236795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882839
103	NC_011879	GCGGTC	2	12	237008	237019	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882839
104	NC_011879	CATCTC	2	12	247605	247616	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219882854
105	NC_011879	GGGGCC	2	12	249704	249715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219882860
106	NC_011879	TGCTCC	2	12	252710	252721	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219882866
107	NC_011879	AGCTCG	2	12	254442	254453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882869
108	NC_011879	CAGGAC	2	12	257568	257579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882873
109	NC_011879	GCCGTC	2	12	261480	261491	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882879
110	NC_011879	CGGCGA	2	12	265654	265665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882887
111	NC_011879	GTCGTT	2	12	266511	266522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219882889
112	NC_011879	GATGGT	2	12	268374	268385	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219882893
113	NC_011879	CAGCGG	2	12	273090	273101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882903
114	NC_011879	GGACAA	2	12	274038	274049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219882905
115	NC_011879	CTGCCG	2	12	274884	274895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882907
116	NC_011879	CTTCAC	2	12	276613	276624	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219882910
117	NC_011879	CCGGGT	2	12	278078	278089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882911
118	NC_011879	GTCCAG	2	12	279079	279090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882914
119	NC_011879	CCGGTC	2	12	282987	282998	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882920
120	NC_011879	CGGCCC	2	12	290714	290725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219882934
121	NC_011879	CAGGCG	2	12	291291	291302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219882936
122	NC_011879	GTCGGC	2	12	292845	292856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882940
123	NC_011879	GCGGAA	2	12	293383	293394	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219882942
124	NC_011879	TCCAGG	2	12	294593	294604	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219882945
125	NC_011879	TCGGCC	2	12	296622	296633	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882949
126	NC_011879	TCAGCT	2	12	297314	297325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219882951
127	NC_011879	GGCGCG	2	12	298241	298252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219882952
128	NC_011879	CGTCGG	2	12	299389	299400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219882952
129	NC_011879	CGTTCC	2	12	299475	299486	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219882952
130	NC_011879	CGGTCC	2	12	300578	300589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219882954
131	NC_011879	GATCTG	2	12	302909	302920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219882958
132	NC_011879	GGGTGC	2	12	303803	303814	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	219882959
133	NC_011879	TTGGCC	2	12	304717	304728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882959
134	NC_011879	GAACTC	2	12	308316	308327	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219882964
135	NC_011879	GACGAT	2	12	308487	308498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882965
136	NC_011879	GGCCGG	2	12	308985	308996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219882966
137	NC_011879	GAGGGC	2	12	309050	309061	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219882966
138	NC_011879	GTAGTT	2	12	309080	309091	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219882966
139	NC_011879	AAGCCG	2	12	313858	313869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882977
140	NC_011879	CGATGA	2	12	314335	314346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219882979
141	NC_011879	CGGTGA	2	12	315221	315232	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219882981
142	NC_011879	GTGCGG	2	12	316014	316025	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	219882983
143	NC_011879	GGGGGA	2	12	317221	317232	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	219882985
144	NC_011879	ACAGCC	2	12	323166	323177	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219882988
145	NC_011879	CCGACG	2	12	323321	323332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219882988
146	NC_011879	AGATGG	2	12	329017	329028	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219882996
147	NC_011879	AGGACG	2	12	329970	329981	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219882997
148	NC_011879	GCTGAT	2	12	330435	330446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219882998
149	NC_011879	TGTCAG	2	12	330756	330767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219882998
150	NC_011879	CCGGCG	2	12	332879	332890	0 %	0 %	50 %	50 %	219883000
151	NC_011879	CGATGA	2	12	333438	333449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219883000
152	NC_011879	CAAGGG	2	12	333609	333620	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219883000
153	NC_011879	GGCAAG	2	12	333979	333990	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219883000
154	NC_011879	GCCCGC	2	12	334147	334158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883000
155	NC_011879	ATGTCC	2	12	334333	334344	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883000
156	NC_011879	CGAGGA	2	12	335761	335772	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219883001
157	NC_011879	CCTGGC	2	12	335863	335874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219883001
158	NC_011879	CCAAGG	2	12	338361	338372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883003
159	NC_011879	CACCGC	2	12	338605	338616	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	219883003
160	NC_011879	CAGGTC	2	12	339283	339294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883004
161	NC_011879	CTTCGA	2	12	340649	340660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219883005
162	NC_011879	GCGGTC	2	12	340719	340730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883005
163	NC_011879	CCAACC	2	12	341068	341079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883005
164	NC_011879	GACCTG	2	12	343110	343121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883007
165	NC_011879	GTTGTC	2	12	353783	353794	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	219883019
166	NC_011879	CTGGAG	2	12	354956	354967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219883019
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170	NC_011879	GGCGCC	2	12	362171	362182	0 %	0 %	50 %	50 %	219883027
171	NC_011879	CAAGGC	2	12	362198	362209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883027
172	NC_011879	TCGATG	2	12	364395	364406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219883030
173	NC_011879	GACGGT	2	12	365348	365359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219883030
174	NC_011879	GCCTTG	2	12	366761	366772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883032
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177	NC_011879	GTCCTT	2	12	368664	368675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219883035
178	NC_011879	GGCGCT	2	12	369191	369202	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883035
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182	NC_011879	GATGCT	2	12	372646	372657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219883036
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184	NC_011879	GATGTC	2	12	373854	373865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219883037
185	NC_011879	GTCAGC	2	12	376202	376213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219883040
186	NC_011879	GCCACC	2	12	383426	383437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	219883046
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188	NC_011879	CTCACC	2	12	389480	389491	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	219883051
189	NC_011879	CCGACG	2	12	390083	390094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219883051
190	NC_011879	CCCTCG	2	12	393445	393456	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219883055
191	NC_011879	ACAAGG	2	12	396032	396043	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219883060
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193	NC_011879	GGTGAT	2	12	397655	397666	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219883062
194	NC_011879	TGAACA	2	12	398487	398498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219883064
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196	NC_011879	CAGCGG	2	12	404761	404772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219883069
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198	NC_011879	GACTAC	2	12	406800	406811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219883074
199	NC_011879	TGCGGC	2	12	406847	406858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219883074
200	NC_011879	CGCCGG	3	18	407806	407823	0 %	0 %	50 %	50 %	219883075
201	NC_011879	GTCGGA	2	12	412508	412519	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219883080
202	NC_011879	ACCGTC	2	12	413279	413290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219883081
203	NC_011879	GCACGA	2	12	413904	413915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883082
204	NC_011879	GCCTCG	2	12	414212	414223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219883082
205	NC_011879	GGGCTG	2	12	426259	426270	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	219883094

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.