MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL01

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011879	GCTGA	2	10	3710	3719	20 %	20 %	40 %	20 %	219882548
2	NC_011879	ACACC	2	10	4719	4728	40 %	0 %	0 %	60 %	219882550
3	NC_011879	GCCAG	2	10	5499	5508	20 %	0 %	40 %	40 %	219882551
4	NC_011879	CGGGC	2	10	7759	7768	0 %	0 %	60 %	40 %	219882552
5	NC_011879	CCGCA	2	10	8489	8498	20 %	0 %	20 %	60 %	219882553
6	NC_011879	GACCG	2	10	9856	9865	20 %	0 %	40 %	40 %	219882554
7	NC_011879	CAGGA	2	10	15408	15417	40 %	0 %	40 %	20 %	219882564
8	NC_011879	CCGAG	2	10	18252	18261	20 %	0 %	40 %	40 %	219882568
9	NC_011879	GACCG	2	10	18389	18398	20 %	0 %	40 %	40 %	219882568
10	NC_011879	GGAAC	2	10	19956	19965	40 %	0 %	40 %	20 %	219882571
11	NC_011879	CCGCA	2	10	20669	20678	20 %	0 %	20 %	60 %	219882573
12	NC_011879	CGCGC	2	10	20889	20898	0 %	0 %	40 %	60 %	219882573
13	NC_011879	ACTGG	2	10	21945	21954	20 %	20 %	40 %	20 %	219882575
14	NC_011879	TCCGG	2	10	22309	22318	0 %	20 %	40 %	40 %	219882575
15	NC_011879	CCGGG	2	10	22366	22375	0 %	0 %	60 %	40 %	219882575
16	NC_011879	CCAGC	2	10	22690	22699	20 %	0 %	20 %	60 %	219882576
17	NC_011879	AGGAC	2	10	25136	25145	40 %	0 %	40 %	20 %	219882579
18	NC_011879	CAGGG	2	10	27303	27312	20 %	0 %	60 %	20 %	219882582
19	NC_011879	CGCGG	2	10	29938	29947	0 %	0 %	60 %	40 %	219882585
20	NC_011879	CACTT	2	10	35865	35874	20 %	40 %	0 %	40 %	219882592
21	NC_011879	TCCGG	2	10	35911	35920	0 %	20 %	40 %	40 %	219882592
22	NC_011879	CGGAC	2	10	36057	36066	20 %	0 %	40 %	40 %	219882592
23	NC_011879	AAGGC	2	10	37285	37294	40 %	0 %	40 %	20 %	219882593
24	NC_011879	CTCGG	2	10	39472	39481	0 %	20 %	40 %	40 %	219882596
25	NC_011879	CGGTT	2	10	40729	40738	0 %	40 %	40 %	20 %	219882598
26	NC_011879	CCCGC	2	10	41356	41365	0 %	0 %	20 %	80 %	219882599
27	NC_011879	CCCAG	2	10	41620	41629	20 %	0 %	20 %	60 %	219882599
28	NC_011879	GGCGC	2	10	42500	42509	0 %	0 %	60 %	40 %	219882600
29	NC_011879	TCGGA	2	10	43100	43109	20 %	20 %	40 %	20 %	219882601
30	NC_011879	GCGGA	2	10	45523	45532	20 %	0 %	60 %	20 %	219882603
31	NC_011879	CAGCA	2	10	46275	46284	40 %	0 %	20 %	40 %	219882604
32	NC_011879	GGAAC	2	10	47999	48008	40 %	0 %	40 %	20 %	219882607
33	NC_011879	CGGCA	2	10	48054	48063	20 %	0 %	40 %	40 %	219882607
34	NC_011879	GGCTG	2	10	53710	53719	0 %	20 %	60 %	20 %	219882616
35	NC_011879	TCCGC	2	10	53798	53807	0 %	20 %	20 %	60 %	219882616
36	NC_011879	AAAGA	2	10	54789	54798	80 %	0 %	20 %	0 %	219882618
37	NC_011879	AACGC	2	10	54817	54826	40 %	0 %	20 %	40 %	219882618
38	NC_011879	ACTCG	2	10	59593	59602	20 %	20 %	20 %	40 %	219882626
39	NC_011879	GACCT	2	10	60293	60302	20 %	20 %	20 %	40 %	219882626
40	NC_011879	GCTCA	2	10	62070	62079	20 %	20 %	20 %	40 %	219882629
41	NC_011879	TCTGG	2	10	63082	63091	0 %	40 %	40 %	20 %	219882631
42	NC_011879	GACCA	2	10	63201	63210	40 %	0 %	20 %	40 %	219882632
43	NC_011879	CGATG	2	10	63638	63647	20 %	20 %	40 %	20 %	219882632
44	NC_011879	TTCCT	2	10	64982	64991	0 %	60 %	0 %	40 %	219882635
45	NC_011879	GGCTT	2	10	66537	66546	0 %	40 %	40 %	20 %	219882638
46	NC_011879	GCGCA	2	10	69502	69511	20 %	0 %	40 %	40 %	219882641
47	NC_011879	GAAAA	2	10	69724	69733	80 %	0 %	20 %	0 %	219882642
48	NC_011879	TCCGC	2	10	72173	72182	0 %	20 %	20 %	60 %	219882643
49	NC_011879	TTCTC	2	10	72491	72500	0 %	60 %	0 %	40 %	219882643
50	NC_011879	CTGGC	2	10	72604	72613	0 %	20 %	40 %	40 %	219882643
51	NC_011879	CCATG	2	10	73786	73795	20 %	20 %	20 %	40 %	219882645
52	NC_011879	GACCA	2	10	75416	75425	40 %	0 %	20 %	40 %	219882646
53	NC_011879	GCTGT	2	10	76063	76072	0 %	40 %	40 %	20 %	219882646
54	NC_011879	CAGTC	2	10	79052	79061	20 %	20 %	20 %	40 %	219882648
55	NC_011879	CTGGG	2	10	82144	82153	0 %	20 %	60 %	20 %	219882651
56	NC_011879	TGCCG	2	10	82295	82304	0 %	20 %	40 %	40 %	219882652
57	NC_011879	ATCGA	2	10	82734	82743	40 %	20 %	20 %	20 %	219882652
58	NC_011879	CTACG	2	10	82821	82830	20 %	20 %	20 %	40 %	219882652
59	NC_011879	CCGGT	2	10	86841	86850	0 %	20 %	40 %	40 %	219882657
60	NC_011879	TCAGT	2	10	87689	87698	20 %	40 %	20 %	20 %	219882658
61	NC_011879	CGTCC	2	10	90628	90637	0 %	20 %	20 %	60 %	219882662
62	NC_011879	CGCGC	2	10	91629	91638	0 %	0 %	40 %	60 %	219882663
63	NC_011879	CTCTC	2	10	94046	94055	0 %	40 %	0 %	60 %	219882667
64	NC_011879	CCGGT	2	10	94130	94139	0 %	20 %	40 %	40 %	219882667
65	NC_011879	CGGCC	2	10	96201	96210	0 %	0 %	40 %	60 %	219882670
66	NC_011879	GCCTC	2	10	96335	96344	0 %	20 %	20 %	60 %	219882670
67	NC_011879	CGGGC	2	10	97294	97303	0 %	0 %	60 %	40 %	219882671
68	NC_011879	CCGAG	2	10	100372	100381	20 %	0 %	40 %	40 %	219882676
69	NC_011879	CCTGG	2	10	103876	103885	0 %	20 %	40 %	40 %	219882679
70	NC_011879	CCGAC	2	10	108899	108908	20 %	0 %	20 %	60 %	219882687
71	NC_011879	ACGCT	2	10	110037	110046	20 %	20 %	20 %	40 %	219882691
72	NC_011879	CAGCC	2	10	112438	112447	20 %	0 %	20 %	60 %	219882695
73	NC_011879	ACCGT	2	10	112843	112852	20 %	20 %	20 %	40 %	219882696
74	NC_011879	TCGGT	2	10	114222	114231	0 %	40 %	40 %	20 %	219882699
75	NC_011879	ACAGC	2	10	116288	116297	40 %	0 %	20 %	40 %	219882702
76	NC_011879	GCCCG	2	10	118399	118408	0 %	0 %	40 %	60 %	219882706
77	NC_011879	GCCAG	2	10	118708	118717	20 %	0 %	40 %	40 %	219882706
78	NC_011879	AGCGC	2	10	119008	119017	20 %	0 %	40 %	40 %	219882706
79	NC_011879	CGCAG	2	10	119078	119087	20 %	0 %	40 %	40 %	219882706
80	NC_011879	GTGAT	2	10	119250	119259	20 %	40 %	40 %	0 %	219882706
81	NC_011879	GTCCG	2	10	120147	120156	0 %	20 %	40 %	40 %	219882706
82	NC_011879	GTGCC	2	10	121104	121113	0 %	20 %	40 %	40 %	219882708
83	NC_011879	CGGCG	2	10	123637	123646	0 %	0 %	60 %	40 %	219882710
84	NC_011879	GCACG	2	10	124357	124366	20 %	0 %	40 %	40 %	219882710
85	NC_011879	ACTGA	2	10	125583	125592	40 %	20 %	20 %	20 %	219882712
86	NC_011879	CGCCT	2	10	125643	125652	0 %	20 %	20 %	60 %	219882712
87	NC_011879	CCTTC	2	10	130442	130451	0 %	40 %	0 %	60 %	219882721
88	NC_011879	CCCAG	2	10	132765	132774	20 %	0 %	20 %	60 %	219882722
89	NC_011879	GCGTG	2	10	133395	133404	0 %	20 %	60 %	20 %	219882724
90	NC_011879	GCCCC	2	10	135138	135147	0 %	0 %	20 %	80 %	219882725
91	NC_011879	CCGCG	2	10	135285	135294	0 %	0 %	40 %	60 %	219882725
92	NC_011879	TCCAG	2	10	135431	135440	20 %	20 %	20 %	40 %	219882725
93	NC_011879	CTGAC	2	10	135814	135823	20 %	20 %	20 %	40 %	219882726
94	NC_011879	CCGGG	2	10	136025	136034	0 %	0 %	60 %	40 %	219882726
95	NC_011879	CGCGG	2	10	142748	142757	0 %	0 %	60 %	40 %	219882737
96	NC_011879	CCTTC	2	10	143925	143934	0 %	40 %	0 %	60 %	219882738
97	NC_011879	GTTCA	2	10	145609	145618	20 %	40 %	20 %	20 %	219882741
98	NC_011879	GGCCA	2	10	146044	146053	20 %	0 %	40 %	40 %	219882742
99	NC_011879	TCGGC	2	10	150050	150059	0 %	20 %	40 %	40 %	219882746
100	NC_011879	GATTC	2	10	151649	151658	20 %	40 %	20 %	20 %	219882747
101	NC_011879	AGCGC	2	10	156208	156217	20 %	0 %	40 %	40 %	219882752
102	NC_011879	GGGCT	2	10	159689	159698	0 %	20 %	60 %	20 %	219882755
103	NC_011879	GCAGG	2	10	159799	159808	20 %	0 %	60 %	20 %	219882755
104	NC_011879	GCGGG	2	10	160378	160387	0 %	0 %	80 %	20 %	219882756
105	NC_011879	TCGTG	2	10	161645	161654	0 %	40 %	40 %	20 %	219882757
106	NC_011879	CGTTC	2	10	162357	162366	0 %	40 %	20 %	40 %	219882758
107	NC_011879	CAGAC	2	10	163729	163738	40 %	0 %	20 %	40 %	219882761
108	NC_011879	GTTGG	2	10	167371	167380	0 %	40 %	60 %	0 %	219882765
109	NC_011879	TCGCC	2	10	167472	167481	0 %	20 %	20 %	60 %	219882765
110	NC_011879	GTCCT	2	10	173390	173399	0 %	40 %	20 %	40 %	219882771
111	NC_011879	ACCAC	2	10	173955	173964	40 %	0 %	0 %	60 %	219882771
112	NC_011879	CTGGT	2	10	175393	175402	0 %	40 %	40 %	20 %	219882773
113	NC_011879	CGCCA	2	10	175662	175671	20 %	0 %	20 %	60 %	219882774
114	NC_011879	CCCCG	2	10	180726	180735	0 %	0 %	20 %	80 %	219882777
115	NC_011879	TGGTC	2	10	181889	181898	0 %	40 %	40 %	20 %	219882777
116	NC_011879	CCCGC	2	10	182427	182436	0 %	0 %	20 %	80 %	219882778
117	NC_011879	GGACG	2	10	183315	183324	20 %	0 %	60 %	20 %	219882778
118	NC_011879	GACGG	2	10	187582	187591	20 %	0 %	60 %	20 %	219882782
119	NC_011879	TGGGT	2	10	189043	189052	0 %	40 %	60 %	0 %	219882784
120	NC_011879	TTCGT	2	10	189383	189392	0 %	60 %	20 %	20 %	219882784
121	NC_011879	CCCCA	2	10	192469	192478	20 %	0 %	0 %	80 %	219882789
122	NC_011879	GCCGT	2	10	201369	201378	0 %	20 %	40 %	40 %	219882798
123	NC_011879	GCAGC	2	10	207352	207361	20 %	0 %	40 %	40 %	219882807
124	NC_011879	GGCTA	2	10	207619	207628	20 %	20 %	40 %	20 %	219882808
125	NC_011879	CCGGT	2	10	207817	207826	0 %	20 %	40 %	40 %	219882808
126	NC_011879	CAGCG	2	10	210407	210416	20 %	0 %	40 %	40 %	219882811
127	NC_011879	TCCGA	2	10	210952	210961	20 %	20 %	20 %	40 %	219882812
128	NC_011879	ACCCG	2	10	211235	211244	20 %	0 %	20 %	60 %	219882812
129	NC_011879	CTGGG	2	10	213899	213908	0 %	20 %	60 %	20 %	219882816
130	NC_011879	GACCT	2	10	215129	215138	20 %	20 %	20 %	40 %	219882817
131	NC_011879	GGAGA	2	10	216760	216769	40 %	0 %	60 %	0 %	219882818
132	NC_011879	CGCAT	2	10	221247	221256	20 %	20 %	20 %	40 %	219882824
133	NC_011879	TCCGA	2	10	221589	221598	20 %	20 %	20 %	40 %	219882824
134	NC_011879	GAGCA	2	10	221698	221707	40 %	0 %	40 %	20 %	219882824
135	NC_011879	GTCCG	2	10	224072	224081	0 %	20 %	40 %	40 %	219882826
136	NC_011879	CGGAG	2	10	224805	224814	20 %	0 %	60 %	20 %	219882827
137	NC_011879	GACGG	2	10	224971	224980	20 %	0 %	60 %	20 %	219882827
138	NC_011879	GCCAT	2	10	225518	225527	20 %	20 %	20 %	40 %	219882827
139	NC_011879	ACCGG	2	10	226724	226733	20 %	0 %	40 %	40 %	219882829
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141	NC_011879	TCCGG	2	10	227313	227322	0 %	20 %	40 %	40 %	219882830
142	NC_011879	CCGGC	2	10	227968	227977	0 %	0 %	40 %	60 %	219882831
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174	NC_011879	GTCCG	2	10	267390	267399	0 %	20 %	40 %	40 %	219882891
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244	NC_011879	CGGGA	2	10	357171	357180	20 %	0 %	60 %	20 %	219883022
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247	NC_011879	TGGAC	2	10	361036	361045	20 %	20 %	40 %	20 %	219883027
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249	NC_011879	GGCCT	2	10	361545	361554	0 %	20 %	40 %	40 %	219883027
250	NC_011879	GGGCG	2	10	361577	361586	0 %	0 %	80 %	20 %	219883027
251	NC_011879	AACCG	2	10	362678	362687	40 %	0 %	20 %	40 %	219883027
252	NC_011879	GGGCG	2	10	363624	363633	0 %	0 %	80 %	20 %	219883029
253	NC_011879	ACTGC	2	10	364232	364241	20 %	20 %	20 %	40 %	219883029
254	NC_011879	CACTG	2	10	364560	364569	20 %	20 %	20 %	40 %	219883030
255	NC_011879	GGGCC	2	10	366163	366172	0 %	0 %	60 %	40 %	219883030
256	NC_011879	CAGGA	2	10	366454	366463	40 %	0 %	40 %	20 %	219883031
257	NC_011879	CGGTG	2	10	366543	366552	0 %	20 %	60 %	20 %	219883031
258	NC_011879	GGGGT	2	10	368695	368704	0 %	20 %	80 %	0 %	219883035
259	NC_011879	CAGCG	2	10	370471	370480	20 %	0 %	40 %	40 %	219883035
260	NC_011879	TTGCG	2	10	375311	375320	0 %	40 %	40 %	20 %	219883038
261	NC_011879	ACCCG	2	10	375786	375795	20 %	0 %	20 %	60 %	219883039
262	NC_011879	GCCGG	2	10	376232	376241	0 %	0 %	60 %	40 %	219883040
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292	NC_011879	CTTGC	2	10	421048	421057	0 %	40 %	20 %	40 %	219883089
293	NC_011879	CGGCA	2	10	421436	421445	20 %	0 %	40 %	40 %	219883089
294	NC_011879	CAGGC	2	10	424507	424516	20 %	0 %	40 %	40 %	219883091

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.