MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL01

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011879	GCTG	2	8	7	14	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011879	TCCC	2	8	3437	3444	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_011879	GCCC	2	8	13310	13317	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_011879	GGGC	2	8	17654	17661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011879	CCTT	2	8	19945	19952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011879	GGGC	2	8	24585	24592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011879	CAGG	2	8	25931	25938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011879	TTTA	2	8	27727	27734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011879	GGGC	2	8	29341	29348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011879	CACG	2	8	30131	30138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011879	AAGC	2	8	30618	30625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011879	GTCA	2	8	31037	31044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011879	GCCT	2	8	31079	31086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011879	CCGC	2	8	31491	31498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_011879	GGGC	2	8	31559	31566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011879	GCCG	2	8	31681	31688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011879	GCCC	2	8	31937	31944	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_011879	TCCC	2	8	32518	32525	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_011879	CTGG	2	8	32920	32927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011879	GTCT	2	8	34323	34330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011879	GGCC	2	8	41232	41239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011879	CCGG	2	8	45696	45703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011879	GAAG	2	8	49228	49235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011879	ACCA	2	8	50052	50059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011879	GGAA	2	8	54196	54203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011879	CTGC	2	8	59351	59358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011879	AGGC	2	8	59404	59411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011879	CCCT	2	8	62529	62536	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_011879	CGCC	2	8	62671	62678	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_011879	CCGG	2	8	62687	62694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011879	CCAG	2	8	62745	62752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011879	GGCT	2	8	63967	63974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011879	TTCC	2	8	64881	64888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011879	CGGC	2	8	65423	65430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011879	GACC	2	8	65807	65814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011879	GAAA	2	8	67289	67296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011879	GAAG	2	8	69644	69651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011879	CGCA	2	8	73972	73979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011879	AGCC	2	8	74083	74090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011879	AGCG	2	8	81385	81392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011879	AGCT	2	8	81436	81443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011879	TCGG	2	8	81483	81490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011879	AGTC	2	8	81715	81722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011879	GGGC	2	8	86539	86546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011879	GCTT	2	8	92448	92455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011879	GCCG	2	8	93913	93920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011879	CGCA	2	8	95188	95195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011879	TTGC	2	8	99457	99464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011879	CAGT	2	8	99472	99479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011879	GGAT	2	8	99609	99616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011879	GTCC	2	8	100285	100292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011879	AGAA	2	8	100296	100303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011879	GCTC	2	8	104631	104638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011879	CACC	2	8	104724	104731	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_011879	TCCC	2	8	104753	104760	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_011879	GTTG	2	8	111598	111605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011879	CAGC	2	8	112278	112285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011879	GAAA	2	8	112827	112834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011879	CCCA	2	8	120425	120432	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_011879	CACG	2	8	120473	120480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011879	CAAA	2	8	127852	127859	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011879	GAAG	2	8	136449	136456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011879	CTTC	2	8	136491	136498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011879	GGCC	2	8	137648	137655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011879	CGGA	2	8	138466	138473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011879	GACG	2	8	138546	138553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011879	CTGC	2	8	139954	139961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011879	GGGC	2	8	141192	141199	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011879	GCCC	2	8	142788	142795	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011879	ACCT	2	8	142894	142901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011879	CCCG	3	12	147001	147012	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_011879	CGAA	2	8	151765	151772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011879	GGCT	2	8	159144	159151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011879	CCGG	2	8	160097	160104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011879	CGCC	2	8	161992	161999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_011879	GAAC	2	8	164679	164686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011879	ACAA	2	8	171189	171196	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011879	AGCA	2	8	172821	172828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011879	CGGC	2	8	175458	175465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011879	CTTT	2	8	185632	185639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011879	TCCA	2	8	191450	191457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011879	GTCG	2	8	193720	193727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011879	TCAC	2	8	196804	196811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011879	CGGA	2	8	197424	197431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011879	CCCG	2	8	197948	197955	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_011879	CCGG	2	8	199752	199759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011879	GGTT	2	8	204213	204220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011879	CTGT	2	8	209886	209893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011879	CCAC	2	8	212264	212271	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_011879	CCAC	2	8	213818	213825	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_011879	TGGC	2	8	214353	214360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011879	AGGA	2	8	217133	217140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011879	CTGT	2	8	218964	218971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011879	GGCA	2	8	223536	223543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011879	CGGG	2	8	226236	226243	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011879	TCCG	2	8	226255	226262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011879	CAGG	2	8	226913	226920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011879	CCCG	2	8	227856	227863	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_011879	ACGA	2	8	234958	234965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011879	CGGC	2	8	240625	240632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011879	CGGC	2	8	240693	240700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011879	GGTG	2	8	240701	240708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011879	GTGG	2	8	240771	240778	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011879	GTCC	2	8	242152	242159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011879	GGTC	2	8	249267	249274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011879	CAGG	2	8	261799	261806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011879	TCGG	2	8	266418	266425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011879	GAAG	2	8	275599	275606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011879	GCTG	2	8	283026	283033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011879	CGGT	2	8	283746	283753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011879	GTGA	2	8	283777	283784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011879	TGCG	2	8	284136	284143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011879	CCGG	2	8	286836	286843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011879	GGCC	2	8	295141	295148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011879	GGCC	2	8	297746	297753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011879	GGGC	2	8	299614	299621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011879	CCGT	2	8	308394	308401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011879	ATGT	2	8	309539	309546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011879	AGAC	2	8	309663	309670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011879	CGGC	2	8	309711	309718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011879	GCGG	2	8	321146	321153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011879	TTAC	2	8	321173	321180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011879	GGCT	2	8	322551	322558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011879	ACCG	2	8	335204	335211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011879	CGCA	2	8	338151	338158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011879	CGCC	2	8	344565	344572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_011879	GCCT	2	8	352738	352745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011879	GGGC	2	8	375032	375039	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011879	GCCA	2	8	380873	380880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011879	CGCC	2	8	382639	382646	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_011879	GCCC	2	8	392337	392344	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011879	CTCG	2	8	393389	393396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011879	CAAT	2	8	393747	393754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011879	CGGG	2	8	394241	394248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011879	CGTG	2	8	394397	394404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011879	GCCC	2	8	394658	394665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_011879	GATG	2	8	395037	395044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011879	CCTC	2	8	409516	409523	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_011879	GCAC	2	8	409553	409560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011879	GCAG	2	8	411135	411142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011879	AGGC	2	8	412051	412058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011879	GGCC	2	8	412116	412123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011879	GGCC	2	8	416934	416941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011879	TTCA	2	8	416945	416952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011879	CCGG	2	8	417930	417937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011879	GGCC	2	8	426089	426096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011879	CCGT	2	8	426813	426820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.