MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL01

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011879	CA	3	6	1129	1134	50 %	0 %	0 %	50 %	219882543
2	NC_011879	TC	3	6	1265	1270	0 %	50 %	0 %	50 %	219882543
3	NC_011879	CG	3	6	1326	1331	0 %	0 %	50 %	50 %	219882543
4	NC_011879	CG	3	6	1397	1402	0 %	0 %	50 %	50 %	219882543
5	NC_011879	GA	3	6	1594	1599	50 %	0 %	50 %	0 %	219882544
6	NC_011879	CA	3	6	3471	3476	50 %	0 %	0 %	50 %	219882548
7	NC_011879	GA	3	6	3563	3568	50 %	0 %	50 %	0 %	219882548
8	NC_011879	GC	3	6	4452	4457	0 %	0 %	50 %	50 %	219882550
9	NC_011879	GC	3	6	7592	7597	0 %	0 %	50 %	50 %	219882552
10	NC_011879	AC	3	6	9449	9454	50 %	0 %	0 %	50 %	219882553
11	NC_011879	TG	3	6	9850	9855	0 %	50 %	50 %	0 %	219882554
12	NC_011879	CG	3	6	10032	10037	0 %	0 %	50 %	50 %	219882554
13	NC_011879	TC	3	6	10325	10330	0 %	50 %	0 %	50 %	219882555
14	NC_011879	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	219882555
15	NC_011879	GT	3	6	12166	12171	0 %	50 %	50 %	0 %	219882558
16	NC_011879	CA	3	6	13207	13212	50 %	0 %	0 %	50 %	219882559
17	NC_011879	CG	4	8	13616	13623	0 %	0 %	50 %	50 %	219882561
18	NC_011879	CA	3	6	14169	14174	50 %	0 %	0 %	50 %	219882562
19	NC_011879	GC	3	6	16571	16576	0 %	0 %	50 %	50 %	219882565
20	NC_011879	GC	3	6	16913	16918	0 %	0 %	50 %	50 %	219882565
21	NC_011879	CA	3	6	17755	17760	50 %	0 %	0 %	50 %	219882567
22	NC_011879	AG	3	6	18286	18291	50 %	0 %	50 %	0 %	219882568
23	NC_011879	CG	3	6	19373	19378	0 %	0 %	50 %	50 %	219882570
24	NC_011879	GC	3	6	21239	21244	0 %	0 %	50 %	50 %	219882574
25	NC_011879	GC	3	6	23916	23921	0 %	0 %	50 %	50 %	219882577
26	NC_011879	CG	3	6	25116	25121	0 %	0 %	50 %	50 %	219882579
27	NC_011879	CA	3	6	34914	34919	50 %	0 %	0 %	50 %	219882589
28	NC_011879	GC	3	6	36420	36425	0 %	0 %	50 %	50 %	219882592
29	NC_011879	GC	3	6	37150	37155	0 %	0 %	50 %	50 %	219882593
30	NC_011879	GT	3	6	38109	38114	0 %	50 %	50 %	0 %	219882594
31	NC_011879	GC	3	6	39585	39590	0 %	0 %	50 %	50 %	219882597
32	NC_011879	AG	3	6	40100	40105	50 %	0 %	50 %	0 %	219882597
33	NC_011879	CG	3	6	42397	42402	0 %	0 %	50 %	50 %	219882600
34	NC_011879	GA	3	6	49720	49725	50 %	0 %	50 %	0 %	219882609
35	NC_011879	GC	3	6	50682	50687	0 %	0 %	50 %	50 %	219882611
36	NC_011879	CG	3	6	51015	51020	0 %	0 %	50 %	50 %	219882611
37	NC_011879	CG	3	6	51372	51377	0 %	0 %	50 %	50 %	219882611
38	NC_011879	GA	3	6	55131	55136	50 %	0 %	50 %	0 %	219882619
39	NC_011879	GC	3	6	56414	56419	0 %	0 %	50 %	50 %	219882621
40	NC_011879	CG	3	6	57952	57957	0 %	0 %	50 %	50 %	219882623
41	NC_011879	GA	3	6	60126	60131	50 %	0 %	50 %	0 %	219882626
42	NC_011879	CG	3	6	60852	60857	0 %	0 %	50 %	50 %	219882626
43	NC_011879	GT	3	6	61966	61971	0 %	50 %	50 %	0 %	219882629
44	NC_011879	CA	3	6	63160	63165	50 %	0 %	0 %	50 %	219882632
45	NC_011879	GC	3	6	63168	63173	0 %	0 %	50 %	50 %	219882632
46	NC_011879	TC	3	6	69835	69840	0 %	50 %	0 %	50 %	219882642
47	NC_011879	GC	3	6	71250	71255	0 %	0 %	50 %	50 %	219882642
48	NC_011879	CA	3	6	74189	74194	50 %	0 %	0 %	50 %	219882646
49	NC_011879	TC	3	6	75050	75055	0 %	50 %	0 %	50 %	219882646
50	NC_011879	CA	3	6	75424	75429	50 %	0 %	0 %	50 %	219882646
51	NC_011879	AC	3	6	76122	76127	50 %	0 %	0 %	50 %	219882646
52	NC_011879	AC	3	6	76183	76188	50 %	0 %	0 %	50 %	219882646
53	NC_011879	GA	3	6	77358	77363	50 %	0 %	50 %	0 %	219882648
54	NC_011879	CG	3	6	77991	77996	0 %	0 %	50 %	50 %	219882648
55	NC_011879	TC	3	6	79993	79998	0 %	50 %	0 %	50 %	219882649
56	NC_011879	CG	3	6	80060	80065	0 %	0 %	50 %	50 %	219882649
57	NC_011879	CA	3	6	80476	80481	50 %	0 %	0 %	50 %	219882650
58	NC_011879	GC	3	6	80948	80953	0 %	0 %	50 %	50 %	219882650
59	NC_011879	GA	3	6	83215	83220	50 %	0 %	50 %	0 %	219882653
60	NC_011879	AG	3	6	83773	83778	50 %	0 %	50 %	0 %	219882653
61	NC_011879	GC	3	6	84802	84807	0 %	0 %	50 %	50 %	219882655
62	NC_011879	CG	3	6	86887	86892	0 %	0 %	50 %	50 %	219882657
63	NC_011879	GC	3	6	87079	87084	0 %	0 %	50 %	50 %	219882657
64	NC_011879	AC	3	6	87132	87137	50 %	0 %	0 %	50 %	219882657
65	NC_011879	GC	3	6	89834	89839	0 %	0 %	50 %	50 %	219882661
66	NC_011879	CG	3	6	89889	89894	0 %	0 %	50 %	50 %	219882661
67	NC_011879	GA	3	6	90032	90037	50 %	0 %	50 %	0 %	219882661
68	NC_011879	AC	3	6	90152	90157	50 %	0 %	0 %	50 %	219882661
69	NC_011879	AG	3	6	91444	91449	50 %	0 %	50 %	0 %	219882663
70	NC_011879	GC	3	6	94433	94438	0 %	0 %	50 %	50 %	219882667
71	NC_011879	CG	3	6	95698	95703	0 %	0 %	50 %	50 %	219882669
72	NC_011879	CG	3	6	96741	96746	0 %	0 %	50 %	50 %	219882670
73	NC_011879	GC	3	6	97537	97542	0 %	0 %	50 %	50 %	219882671
74	NC_011879	AC	3	6	100492	100497	50 %	0 %	0 %	50 %	219882676
75	NC_011879	GC	3	6	100851	100856	0 %	0 %	50 %	50 %	219882676
76	NC_011879	AG	3	6	102170	102175	50 %	0 %	50 %	0 %	219882678
77	NC_011879	CT	3	6	102437	102442	0 %	50 %	0 %	50 %	219882678
78	NC_011879	CG	3	6	102644	102649	0 %	0 %	50 %	50 %	219882678
79	NC_011879	GC	3	6	103051	103056	0 %	0 %	50 %	50 %	219882678
80	NC_011879	GC	3	6	105325	105330	0 %	0 %	50 %	50 %	219882682
81	NC_011879	GC	3	6	106904	106909	0 %	0 %	50 %	50 %	219882684
82	NC_011879	TC	3	6	108149	108154	0 %	50 %	0 %	50 %	219882685
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84	NC_011879	CA	3	6	108743	108748	50 %	0 %	0 %	50 %	219882687
85	NC_011879	CA	3	6	109563	109568	50 %	0 %	0 %	50 %	219882689
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87	NC_011879	GA	3	6	110238	110243	50 %	0 %	50 %	0 %	219882691
88	NC_011879	AC	3	6	110492	110497	50 %	0 %	0 %	50 %	219882691
89	NC_011879	CA	3	6	111144	111149	50 %	0 %	0 %	50 %	219882693
90	NC_011879	CG	3	6	111487	111492	0 %	0 %	50 %	50 %	219882693
91	NC_011879	GC	3	6	112212	112217	0 %	0 %	50 %	50 %	219882694
92	NC_011879	AC	3	6	113230	113235	50 %	0 %	0 %	50 %	219882696
93	NC_011879	AC	3	6	115757	115762	50 %	0 %	0 %	50 %	219882701
94	NC_011879	GC	3	6	116053	116058	0 %	0 %	50 %	50 %	219882701
95	NC_011879	CA	3	6	116967	116972	50 %	0 %	0 %	50 %	219882704
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101	NC_011879	CG	3	6	119666	119671	0 %	0 %	50 %	50 %	219882706
102	NC_011879	CG	3	6	120082	120087	0 %	0 %	50 %	50 %	219882706
103	NC_011879	TG	3	6	121707	121712	0 %	50 %	50 %	0 %	219882708
104	NC_011879	GA	3	6	123660	123665	50 %	0 %	50 %	0 %	219882710
105	NC_011879	CG	3	6	124209	124214	0 %	0 %	50 %	50 %	219882710
106	NC_011879	GC	3	6	124239	124244	0 %	0 %	50 %	50 %	219882710
107	NC_011879	CG	3	6	124529	124534	0 %	0 %	50 %	50 %	219882710
108	NC_011879	CG	3	6	125924	125929	0 %	0 %	50 %	50 %	219882712
109	NC_011879	GC	3	6	126697	126702	0 %	0 %	50 %	50 %	219882714
110	NC_011879	AC	3	6	127121	127126	50 %	0 %	0 %	50 %	219882716
111	NC_011879	GC	3	6	128111	128116	0 %	0 %	50 %	50 %	219882718
112	NC_011879	CG	3	6	128618	128623	0 %	0 %	50 %	50 %	219882719
113	NC_011879	CG	3	6	130074	130079	0 %	0 %	50 %	50 %	219882720
114	NC_011879	CA	3	6	131850	131855	50 %	0 %	0 %	50 %	219882722
115	NC_011879	CG	3	6	131918	131923	0 %	0 %	50 %	50 %	219882722
116	NC_011879	GT	3	6	133723	133728	0 %	50 %	50 %	0 %	219882724
117	NC_011879	GC	3	6	135788	135793	0 %	0 %	50 %	50 %	219882726
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119	NC_011879	GC	3	6	136883	136888	0 %	0 %	50 %	50 %	219882727
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121	NC_011879	CG	3	6	142544	142549	0 %	0 %	50 %	50 %	219882737
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123	NC_011879	GT	3	6	143829	143834	0 %	50 %	50 %	0 %	219882738
124	NC_011879	GC	3	6	144546	144551	0 %	0 %	50 %	50 %	219882739
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126	NC_011879	CA	3	6	145721	145726	50 %	0 %	0 %	50 %	219882742
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128	NC_011879	CA	3	6	146645	146650	50 %	0 %	0 %	50 %	219882742
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.