MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola BCc plasmid pLeu-BCc

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011878	ATT	2	6	16	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
2	NC_011878	ACT	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
3	NC_011878	TCT	2	6	322	327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219882536
4	NC_011878	AAT	2	6	351	356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882536
5	NC_011878	TAT	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
6	NC_011878	ACT	2	6	490	495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
7	NC_011878	TAC	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
8	NC_011878	ATT	2	6	592	597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
9	NC_011878	TGC	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882536
10	NC_011878	AGA	2	6	723	728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882536
11	NC_011878	TTA	2	6	731	736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
12	NC_011878	TCA	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
13	NC_011878	ATT	2	6	937	942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
14	NC_011878	ATT	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
15	NC_011878	AGC	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882536
16	NC_011878	CAT	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882536
17	NC_011878	CAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219882536
18	NC_011878	AGA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882536
19	NC_011878	ACC	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219882536
20	NC_011878	ATT	2	6	1402	1407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
21	NC_011878	ATT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882536
22	NC_011878	TAA	2	6	1521	1526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882536
23	NC_011878	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882537
24	NC_011878	TAT	2	6	1735	1740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
25	NC_011878	TAT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
26	NC_011878	TTA	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
27	NC_011878	ATT	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
28	NC_011878	ATT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
29	NC_011878	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882537
30	NC_011878	AAT	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882537
31	NC_011878	GAA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882538
32	NC_011878	TTC	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219882538
33	NC_011878	AAG	2	6	2840	2845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882538
34	NC_011878	TTA	2	6	2864	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
35	NC_011878	GGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219882538
36	NC_011878	CAG	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219882538
37	NC_011878	AAC	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219882538
38	NC_011878	TTA	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
39	NC_011878	TGA	2	6	3543	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219882538
40	NC_011878	ATT	2	6	3615	3620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
41	NC_011878	GGT	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219882538
42	NC_011878	ATT	3	9	3699	3707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882538
43	NC_011878	TAA	2	6	3866	3871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882538
44	NC_011878	ACT	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882539
45	NC_011878	ATT	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882539
46	NC_011878	CAA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219882539
47	NC_011878	TAA	2	6	4132	4137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882539
48	NC_011878	GTT	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219882539
49	NC_011878	TAC	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219882539
50	NC_011878	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882539
51	NC_011878	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219882539
52	NC_011878	TAA	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882539
53	NC_011878	ATT	2	6	4569	4574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882539
54	NC_011878	ATT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882539
55	NC_011878	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882539
56	NC_011878	TGT	2	6	4955	4960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219882539
57	NC_011878	ATA	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882539
58	NC_011878	AAG	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882539
59	NC_011878	GTT	2	6	5092	5097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219882539
60	NC_011878	GAA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219882539
61	NC_011878	GCT	2	6	5223	5228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219882539
62	NC_011878	ACA	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219882540
63	NC_011878	ATT	3	9	5384	5392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882540
64	NC_011878	TTA	2	6	5534	5539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882540
65	NC_011878	TTC	2	6	5563	5568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219882540
66	NC_011878	TAA	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882540
67	NC_011878	ATA	2	6	5661	5666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882540
68	NC_011878	ATT	3	9	5668	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882540
69	NC_011878	ATT	2	6	5707	5712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219882540
70	NC_011878	ATA	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219882540

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.