MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 2843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011852	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	219870280
2	NC_011852	AT	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011852	AT	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011852	TC	3	6	2253	2258	0 %	50 %	0 %	50 %	219870281
5	NC_011852	CA	3	6	5218	5223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011852	CT	3	6	6458	6463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011852	TC	3	6	6965	6970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011852	GT	3	6	8418	8423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011852	AT	3	6	9416	9421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011852	TA	3	6	9602	9607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011852	AT	3	6	10474	10479	50 %	50 %	0 %	0 %	219870283
12	NC_011852	AC	3	6	11278	11283	50 %	0 %	0 %	50 %	219870283
13	NC_011852	GA	3	6	12195	12200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011852	CA	3	6	12769	12774	50 %	0 %	0 %	50 %	219870286
15	NC_011852	AC	3	6	13323	13328	50 %	0 %	0 %	50 %	219870287
16	NC_011852	AG	3	6	14852	14857	50 %	0 %	50 %	0 %	219870288
17	NC_011852	TG	3	6	16253	16258	0 %	50 %	50 %	0 %	219870289
18	NC_011852	CT	3	6	17139	17144	0 %	50 %	0 %	50 %	219870290
19	NC_011852	TC	3	6	17184	17189	0 %	50 %	0 %	50 %	219870290
20	NC_011852	TA	3	6	19970	19975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011852	TA	3	6	19992	19997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011852	AC	3	6	20079	20084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011852	GT	3	6	20088	20093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011852	AT	3	6	20456	20461	50 %	50 %	0 %	0 %	219870293
25	NC_011852	AT	4	8	20913	20920	50 %	50 %	0 %	0 %	219870293
26	NC_011852	TG	3	6	21071	21076	0 %	50 %	50 %	0 %	219870293
27	NC_011852	AT	4	8	21274	21281	50 %	50 %	0 %	0 %	219870294
28	NC_011852	CT	3	6	21518	21523	0 %	50 %	0 %	50 %	219870294
29	NC_011852	AT	3	6	21542	21547	50 %	50 %	0 %	0 %	219870294
30	NC_011852	AT	3	6	22383	22388	50 %	50 %	0 %	0 %	219870295
31	NC_011852	AG	3	6	22451	22456	50 %	0 %	50 %	0 %	219870295
32	NC_011852	AG	3	6	22466	22471	50 %	0 %	50 %	0 %	219870295
33	NC_011852	GT	3	6	23598	23603	0 %	50 %	50 %	0 %	219870296
34	NC_011852	TC	3	6	23734	23739	0 %	50 %	0 %	50 %	219870296
35	NC_011852	TA	3	6	25228	25233	50 %	50 %	0 %	0 %	219870296
36	NC_011852	TC	3	6	26978	26983	0 %	50 %	0 %	50 %	219870298
37	NC_011852	TC	4	8	27270	27277	0 %	50 %	0 %	50 %	219870298
38	NC_011852	AT	3	6	28967	28972	50 %	50 %	0 %	0 %	219870300
39	NC_011852	GT	3	6	29512	29517	0 %	50 %	50 %	0 %	219870300
40	NC_011852	GA	3	6	29700	29705	50 %	0 %	50 %	0 %	219870300
41	NC_011852	CT	3	6	29770	29775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011852	AG	3	6	29806	29811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011852	CG	3	6	30827	30832	0 %	0 %	50 %	50 %	219870303
44	NC_011852	AC	3	6	33198	33203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011852	GT	3	6	33207	33212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011852	AC	3	6	33265	33270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011852	GT	4	8	34200	34207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011852	AG	3	6	34374	34379	50 %	0 %	50 %	0 %	219870306
49	NC_011852	AT	3	6	34538	34543	50 %	50 %	0 %	0 %	219870306
50	NC_011852	GA	3	6	34676	34681	50 %	0 %	50 %	0 %	219870306
51	NC_011852	TC	3	6	34753	34758	0 %	50 %	0 %	50 %	219870307
52	NC_011852	AT	3	6	35510	35515	50 %	50 %	0 %	0 %	219870307
53	NC_011852	AT	3	6	37846	37851	50 %	50 %	0 %	0 %	219870308
54	NC_011852	CT	3	6	38204	38209	0 %	50 %	0 %	50 %	219870309
55	NC_011852	CA	3	6	38479	38484	50 %	0 %	0 %	50 %	219870309
56	NC_011852	AT	3	6	38736	38741	50 %	50 %	0 %	0 %	219870309
57	NC_011852	AC	3	6	39796	39801	50 %	0 %	0 %	50 %	219870309
58	NC_011852	TC	3	6	42290	42295	0 %	50 %	0 %	50 %	219870310
59	NC_011852	GA	3	6	43286	43291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011852	GT	3	6	43477	43482	0 %	50 %	50 %	0 %	219870312
61	NC_011852	TG	3	6	44298	44303	0 %	50 %	50 %	0 %	219870312
62	NC_011852	AT	3	6	45100	45105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011852	AT	3	6	46930	46935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011852	AC	3	6	47064	47069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011852	AT	3	6	47089	47094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011852	TG	3	6	49448	49453	0 %	50 %	50 %	0 %	219870317
67	NC_011852	TC	3	6	49521	49526	0 %	50 %	0 %	50 %	219870317
68	NC_011852	AG	3	6	49543	49548	50 %	0 %	50 %	0 %	219870317
69	NC_011852	CT	3	6	50835	50840	0 %	50 %	0 %	50 %	219870319
70	NC_011852	AT	3	6	51567	51572	50 %	50 %	0 %	0 %	219870319
71	NC_011852	AG	3	6	51901	51906	50 %	0 %	50 %	0 %	219870319
72	NC_011852	TA	3	6	52123	52128	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
73	NC_011852	AT	3	6	52146	52151	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
74	NC_011852	TA	3	6	52185	52190	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
75	NC_011852	TA	3	6	52249	52254	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
76	NC_011852	AG	4	8	52626	52633	50 %	0 %	50 %	0 %	219870320
77	NC_011852	TA	3	6	52656	52661	50 %	50 %	0 %	0 %	219870320
78	NC_011852	TA	3	6	52910	52915	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
79	NC_011852	AT	3	6	53055	53060	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
80	NC_011852	TA	3	6	53064	53069	50 %	50 %	0 %	0 %	219870321
81	NC_011852	GA	3	6	53122	53127	50 %	0 %	50 %	0 %	219870321
82	NC_011852	TA	3	6	54090	54095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011852	AG	3	6	54147	54152	50 %	0 %	50 %	0 %	219870322
84	NC_011852	AT	3	6	54291	54296	50 %	50 %	0 %	0 %	219870322
85	NC_011852	CT	3	6	54711	54716	0 %	50 %	0 %	50 %	219870322
86	NC_011852	AT	4	8	54733	54740	50 %	50 %	0 %	0 %	219870322
87	NC_011852	AT	3	6	55417	55422	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
88	NC_011852	AT	3	6	55443	55448	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
89	NC_011852	TA	3	6	55593	55598	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
90	NC_011852	TA	3	6	55953	55958	50 %	50 %	0 %	0 %	219870323
91	NC_011852	AT	3	6	56111	56116	50 %	50 %	0 %	0 %	219870324
92	NC_011852	AT	3	6	58048	58053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011852	AT	4	8	58131	58138	50 %	50 %	0 %	0 %	219870326
94	NC_011852	AT	3	6	58146	58151	50 %	50 %	0 %	0 %	219870326
95	NC_011852	TG	3	6	58182	58187	0 %	50 %	50 %	0 %	219870326
96	NC_011852	GA	3	6	58761	58766	50 %	0 %	50 %	0 %	219870326
97	NC_011852	AT	3	6	60073	60078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011852	TG	3	6	60146	60151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011852	GT	3	6	60247	60252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011852	GA	3	6	60420	60425	50 %	0 %	50 %	0 %	219870327
101	NC_011852	AT	3	6	60817	60822	50 %	50 %	0 %	0 %	219870327
102	NC_011852	AT	3	6	61500	61505	50 %	50 %	0 %	0 %	219870328
103	NC_011852	CT	3	6	62309	62314	0 %	50 %	0 %	50 %	219870329
104	NC_011852	AG	3	6	62560	62565	50 %	0 %	50 %	0 %	219870329
105	NC_011852	GA	3	6	62604	62609	50 %	0 %	50 %	0 %	219870329
106	NC_011852	TA	3	6	64202	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011852	AT	3	6	64802	64807	50 %	50 %	0 %	0 %	219870331
108	NC_011852	TA	3	6	66030	66035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011852	TC	3	6	66725	66730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011852	CT	3	6	67221	67226	0 %	50 %	0 %	50 %	219870334
111	NC_011852	TG	3	6	67684	67689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011852	TA	3	6	68713	68718	50 %	50 %	0 %	0 %	219870335
113	NC_011852	GT	3	6	68930	68935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011852	GA	3	6	69063	69068	50 %	0 %	50 %	0 %	219870336
115	NC_011852	AG	3	6	69761	69766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011852	CA	3	6	71171	71176	50 %	0 %	0 %	50 %	219870337
117	NC_011852	AC	3	6	71645	71650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011852	GT	3	6	71654	71659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011852	AC	3	6	71678	71683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011852	GT	3	6	71687	71692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011852	TA	3	6	72348	72353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011852	AC	3	6	73009	73014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011852	CG	3	6	75885	75890	0 %	0 %	50 %	50 %	219870342
124	NC_011852	GA	3	6	76075	76080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011852	TA	3	6	76109	76114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011852	AG	3	6	76500	76505	50 %	0 %	50 %	0 %	219870343
127	NC_011852	TA	4	8	77146	77153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011852	CT	3	6	77212	77217	0 %	50 %	0 %	50 %	219870344
129	NC_011852	AC	3	6	77720	77725	50 %	0 %	0 %	50 %	219870344
130	NC_011852	TA	3	6	78607	78612	50 %	50 %	0 %	0 %	219870344
131	NC_011852	TG	3	6	79803	79808	0 %	50 %	50 %	0 %	219870345
132	NC_011852	AT	3	6	79845	79850	50 %	50 %	0 %	0 %	219870345
133	NC_011852	GT	3	6	79915	79920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011852	CT	3	6	80099	80104	0 %	50 %	0 %	50 %	219870346
135	NC_011852	TC	4	8	80372	80379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011852	GT	3	6	80466	80471	0 %	50 %	50 %	0 %	219870347
137	NC_011852	CG	3	6	80509	80514	0 %	0 %	50 %	50 %	219870347
138	NC_011852	TG	3	6	80742	80747	0 %	50 %	50 %	0 %	219870347
139	NC_011852	AT	3	6	81289	81294	50 %	50 %	0 %	0 %	219870348
140	NC_011852	GT	3	6	83258	83263	0 %	50 %	50 %	0 %	219870350
141	NC_011852	AC	3	6	84883	84888	50 %	0 %	0 %	50 %	219870352
142	NC_011852	GT	3	6	87145	87150	0 %	50 %	50 %	0 %	219870355
143	NC_011852	TC	3	6	87437	87442	0 %	50 %	0 %	50 %	219870355
144	NC_011852	GA	3	6	89524	89529	50 %	0 %	50 %	0 %	219870357
145	NC_011852	GT	3	6	90006	90011	0 %	50 %	50 %	0 %	219870358
146	NC_011852	AG	3	6	90478	90483	50 %	0 %	50 %	0 %	219870358
147	NC_011852	TA	3	6	90717	90722	50 %	50 %	0 %	0 %	219870358
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