MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011852	AT	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011852	AT	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011852	CA	3	6	5218	5223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011852	CT	3	6	6458	6463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011852	TC	3	6	6965	6970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011852	GT	3	6	8418	8423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011852	AT	3	6	9416	9421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011852	TA	3	6	9602	9607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011852	GA	3	6	12195	12200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011852	TA	3	6	19970	19975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011852	TA	3	6	19992	19997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011852	AC	3	6	20079	20084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011852	GT	3	6	20088	20093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011852	CT	3	6	29770	29775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011852	AG	3	6	29806	29811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011852	AC	3	6	33198	33203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011852	GT	3	6	33207	33212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011852	AC	3	6	33265	33270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011852	GT	4	8	34200	34207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011852	GA	3	6	43286	43291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011852	AT	3	6	45100	45105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011852	AT	3	6	46930	46935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011852	AC	3	6	47064	47069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011852	AT	3	6	47089	47094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011852	TA	3	6	54090	54095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011852	AT	3	6	58048	58053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011852	AT	3	6	60073	60078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011852	TG	3	6	60146	60151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011852	GT	3	6	60247	60252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011852	TA	3	6	64202	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011852	TA	3	6	66030	66035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011852	TC	3	6	66725	66730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011852	TG	3	6	67684	67689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011852	GT	3	6	68930	68935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011852	AG	3	6	69761	69766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011852	AC	3	6	71645	71650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011852	GT	3	6	71654	71659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011852	AC	3	6	71678	71683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011852	GT	3	6	71687	71692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011852	TA	3	6	72348	72353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011852	AC	3	6	73009	73014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011852	GA	3	6	76075	76080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011852	TA	3	6	76109	76114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011852	TA	4	8	77146	77153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011852	GT	3	6	79915	79920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011852	TC	4	8	80372	80379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011852	TA	3	6	100266	100271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011852	GT	3	6	102065	102070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011852	TA	3	6	104622	104627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011852	AG	3	6	108951	108956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011852	GT	3	6	118515	118520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011852	TA	3	6	118692	118697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011852	AT	3	6	118911	118916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011852	AC	3	6	126974	126979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011852	GT	3	6	126983	126988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011852	AC	3	6	127032	127037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011852	GT	3	6	127041	127046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011852	AC	3	6	140963	140968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011852	GT	3	6	140972	140977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011852	AC	3	6	141024	141029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011852	GT	3	6	141033	141038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011852	GT	3	6	142186	142191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011852	TA	3	6	151670	151675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011852	AT	3	6	153896	153901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011852	AT	3	6	155096	155101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011852	TC	3	6	156154	156159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011852	TA	3	6	156925	156930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011852	AT	3	6	160111	160116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011852	AT	3	6	160321	160326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011852	AT	3	6	160848	160853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011852	CT	3	6	161205	161210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011852	TA	3	6	162450	162455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011852	CT	4	8	164050	164057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011852	AG	3	6	164123	164128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011852	GA	3	6	167390	167395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011852	AT	3	6	173459	173464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011852	TA	3	6	176261	176266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011852	TA	3	6	177354	177359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011852	AT	3	6	178346	178351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011852	TA	3	6	179894	179899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011852	CT	3	6	179902	179907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011852	AG	3	6	179912	179917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011852	GA	3	6	180272	180277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011852	AT	3	6	190864	190869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011852	AG	3	6	192921	192926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011852	TC	3	6	212078	212083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011852	AG	3	6	212405	212410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011852	GA	3	6	219077	219082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011852	AT	3	6	222652	222657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011852	TG	3	6	222754	222759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011852	AT	3	6	222932	222937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011852	AG	3	6	223393	223398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011852	GA	3	6	224997	225002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011852	AG	3	6	225504	225509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011852	GA	3	6	226365	226370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011852	GT	3	6	227076	227081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011852	AG	4	8	227272	227279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011852	TG	3	6	227592	227597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011852	TC	3	6	234312	234317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011852	TG	3	6	234838	234843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011852	AT	3	6	238148	238153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011852	TA	3	6	249165	249170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011852	TA	3	6	259961	259966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011852	CT	3	6	260573	260578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011852	TA	3	6	260641	260646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011852	TA	3	6	260664	260669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011852	CT	4	8	265471	265478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011852	TC	4	8	265510	265517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011852	GA	3	6	265528	265533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011852	TA	3	6	268377	268382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011852	AT	3	6	285409	285414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011852	AT	3	6	292938	292943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011852	TC	4	8	294686	294693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011852	AG	3	6	294816	294821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011852	CT	3	6	299178	299183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011852	AC	3	6	307247	307252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011852	GT	3	6	307256	307261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011852	TA	3	6	307334	307339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011852	AC	3	6	307387	307392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011852	GT	3	6	307396	307401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011852	AT	3	6	308258	308263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011852	CA	4	8	308396	308403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011852	AG	3	6	309328	309333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011852	TC	3	6	316515	316520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011852	AG	3	6	316739	316744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011852	AC	3	6	320171	320176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011852	GT	3	6	320180	320185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011852	AC	3	6	320392	320397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011852	GT	3	6	320401	320406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011852	AT	3	6	328441	328446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011852	AT	3	6	330482	330487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011852	AT	3	6	331688	331693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011852	AT	3	6	331705	331710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011852	TA	3	6	336170	336175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011852	TA	3	6	336269	336274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011852	TC	3	6	339283	339288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011852	GA	3	6	339319	339324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011852	GA	3	6	340968	340973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011852	AT	3	6	341009	341014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011852	AT	3	6	343261	343266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011852	TA	3	6	350348	350353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011852	TA	4	8	359258	359265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011852	AT	3	6	362481	362486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011852	TA	3	6	362633	362638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011852	GA	3	6	363330	363335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011852	AC	3	6	365628	365633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011852	GT	3	6	365637	365642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011852	AC	3	6	365664	365669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011852	GT	3	6	365673	365678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011852	AT	3	6	365737	365742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011852	AT	3	6	367918	367923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011852	TA	3	6	371058	371063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011852	AC	3	6	371147	371152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011852	GT	3	6	371156	371161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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