MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011837	TTAAAT	2	12	8945	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011837	TTTAAC	2	12	29875	29886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011837	CATTTA	2	12	31701	31712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011837	CAACTA	2	12	43392	43403	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011837	TATAAA	2	12	43723	43734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011837	TTTTAA	2	12	46589	46600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011837	TAATCT	2	12	50479	50490	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011837	AATTTT	2	12	78091	78102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011837	TTAATT	2	12	87655	87666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011837	TTATTT	2	12	101812	101823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011837	TATATG	2	12	105074	105085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011837	GTATTA	2	12	134780	134791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011837	AACAAT	2	12	151897	151908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011837	ATTTTA	2	12	152120	152131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011837	ATATAA	2	12	155376	155387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011837	GACATT	2	12	173808	173819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011837	AATTAA	2	12	191291	191302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011837	TTTAAT	2	12	194609	194620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011837	ATATAA	2	12	264751	264762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011837	AATAGT	2	12	267581	267592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011837	AACTAA	2	12	291036	291047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011837	ATTTCT	2	12	292264	292275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011837	TATGAA	2	12	292449	292460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011837	TATTTT	2	12	298599	298610	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011837	AAAACT	2	12	299437	299448	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011837	AGATGG	2	12	299521	299532	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011837	CGTCTT	2	12	301933	301944	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011837	ACAATG	2	12	325512	325523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011837	ATTTAA	2	12	331451	331462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011837	CAAAAA	2	12	348023	348034	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011837	TATATT	2	12	374457	374468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011837	GAAAAT	2	12	380728	380739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011837	CTATGT	2	12	384482	384493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011837	TCTGAT	2	12	384506	384517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011837	AATGAA	2	12	386299	386310	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011837	AATATA	2	12	394343	394354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011837	AATATA	2	12	400643	400654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011837	TTATAT	2	12	405402	405413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011837	TTAATT	2	12	413323	413334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011837	ATATAA	2	12	425811	425822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011837	TAATTT	2	12	437210	437221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011837	AAATTT	2	12	442826	442837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011837	TCTATA	2	12	450916	450927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011837	AGCAAA	2	12	454086	454097	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011837	CAAAAT	2	12	454156	454167	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011837	AGTAAA	2	12	462971	462982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011837	ATAAAG	2	12	463570	463581	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011837	CATTAG	2	12	463655	463666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011837	TTGAGA	2	12	464823	464834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011837	ACCTCC	2	12	466333	466344	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011837	ATGATA	2	12	467301	467312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011837	TAAATA	2	12	475221	475232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011837	TGTTAT	2	12	479730	479741	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011837	TGTAAT	2	12	506015	506026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011837	AATATT	2	12	510479	510490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011837	ATTATA	2	12	518783	518794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011837	ATTTTT	2	12	527283	527294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011837	TACAGG	2	12	546574	546585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011837	ATGATA	2	12	546869	546880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011837	AGTAAA	2	12	548486	548497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011837	ATAATT	2	12	548647	548658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011837	ATATTT	2	12	548946	548957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011837	TACTAG	2	12	553556	553567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011837	GCAATT	2	12	553823	553834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011837	TGTGTT	2	12	557350	557361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011837	TTTAAA	2	12	557603	557614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011837	TTATAA	2	12	557846	557857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011837	AAATAC	2	12	558429	558440	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011837	TAATAC	2	12	564775	564786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011837	TCGTTT	2	12	574153	574164	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011837	TTAATT	2	12	603660	603671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011837	AAAAAT	2	12	603711	603722	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011837	ATATTA	2	12	619671	619682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011837	TTATAA	2	12	640969	640980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011837	TTGTAA	2	12	646987	646998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011837	TAATTA	2	12	658225	658236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011837	GACTAT	2	12	677025	677036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011837	ATAGTA	2	12	686305	686316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011837	ATTTTA	2	12	691727	691738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011837	TGTATT	2	12	727984	727995	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011837	ATGTGA	2	12	734940	734951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011837	AAATGT	2	12	747405	747416	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011837	TATTTT	2	12	776933	776944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011837	TAAAAA	2	12	790557	790568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011837	ATTTAT	2	12	796565	796576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011837	ATTTAA	2	12	797859	797870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011837	ATTTTA	2	12	824806	824817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011837	TATGGA	2	12	860300	860311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011837	ATTTTT	2	12	874291	874302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011837	TAATAT	2	12	886506	886517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011837	ACTATG	2	12	910856	910867	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011837	AATAAA	2	12	931465	931476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011837	AATATA	2	12	943460	943471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011837	TAAATT	2	12	954247	954258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011837	ATTTAA	2	12	954937	954948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011837	TAAAAA	2	12	982209	982220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011837	GTTTTT	2	12	1013981	1013992	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011837	TAATTT	2	12	1024688	1024699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011837	AACAAA	2	12	1033755	1033766	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011837	TATTTT	2	12	1045340	1045351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011837	AATGTA	2	12	1069284	1069295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011837	TGCAAA	2	12	1070682	1070693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011837	AGTTAT	2	12	1073185	1073196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011837	AAAATT	2	12	1087429	1087440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011837	AAATAT	2	12	1092069	1092080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011837	AACTTA	2	12	1100994	1101005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011837	ATTGAT	2	12	1120636	1120647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011837	AAGTTT	2	12	1170499	1170510	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011837	AATATA	2	12	1176858	1176869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011837	AATTAA	2	12	1185686	1185697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011837	ATAGGC	2	12	1215751	1215762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011837	ATATGT	2	12	1236633	1236644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011837	GAATTT	2	12	1252432	1252443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011837	TAAAAA	2	12	1260375	1260386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011837	TTTTTA	2	12	1328736	1328747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011837	TAAAAA	2	12	1342099	1342110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011837	TGTTAA	2	12	1362580	1362591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011837	TTTAAA	2	12	1362707	1362718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011837	GTATAT	2	12	1365008	1365019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011837	TTTTAT	2	12	1373763	1373774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011837	ATGAAT	2	12	1375410	1375421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011837	AAAATA	2	12	1378493	1378504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011837	TTAATT	2	12	1385252	1385263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011837	TTTAAA	2	12	1434011	1434022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011837	AAAGTA	2	12	1434052	1434063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011837	GTTATT	2	12	1447909	1447920	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011837	AAAAAC	2	12	1482947	1482958	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011837	TAGTTA	2	12	1507375	1507386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011837	GATAGA	2	12	1524014	1524025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011837	ATAAAT	2	12	1525265	1525276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011837	AATAAA	2	12	1544354	1544365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011837	ATGAGG	2	12	1552404	1552415	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011837	TATTTT	2	12	1554404	1554415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011837	AAAGTA	2	12	1605165	1605176	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011837	ATTTTT	2	12	1611813	1611824	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011837	TTTTAG	2	12	1613606	1613617	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011837	ATTTTT	2	12	1618118	1618129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_011837	ATTTTA	2	12	1627616	1627627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011837	TTTTTA	2	12	1633778	1633789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_011837	TGTTAT	2	12	1788229	1788240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_011837	TTTAAA	2	12	1893668	1893679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011837	TAAAAT	2	12	1900068	1900079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.