MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016

Total Repeats: 1598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011837	GTAACA	2	12	377	388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219853344
2	NC_011837	TAAAAA	2	12	2097	2108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219853345
3	NC_011837	AAATTA	2	12	2753	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853346
4	NC_011837	TGAAGT	2	12	4830	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853349
5	NC_011837	CAGATG	2	12	5924	5935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853349
6	NC_011837	TAAAAA	2	12	6048	6059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219853349
7	NC_011837	ATGCTA	2	12	7281	7292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219853350
8	NC_011837	ACAGGC	2	12	7609	7620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853350
9	NC_011837	GATGAG	2	12	8621	8632	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219853350
10	NC_011837	AGAATT	2	12	14836	14847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853351
11	NC_011837	AAACAA	2	12	27673	27684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	219853361
12	NC_011837	TTTTCA	2	12	34106	34117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219853367
13	NC_011837	CCAATG	2	12	35630	35641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219853368
14	NC_011837	AAAATA	2	12	37276	37287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219853369
15	NC_011837	CAAAAC	2	12	46259	46270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853377
16	NC_011837	CAATAT	2	12	58492	58503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219853389
17	NC_011837	ATGTTG	2	12	61588	61599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219853393
18	NC_011837	ACTTTC	2	12	65222	65233	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219853396
19	NC_011837	CTTTTT	2	12	66676	66687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219853398
20	NC_011837	AAATAC	2	12	77069	77080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219853407
21	NC_011837	AGATGT	2	12	83789	83800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853413
22	NC_011837	AAAGGT	2	12	84734	84745	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219853413
23	NC_011837	TACTAA	2	12	84929	84940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219853413
24	NC_011837	TAGATA	2	12	93128	93139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853421
25	NC_011837	TAAATG	2	12	96015	96026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853425
26	NC_011837	CTTGAT	2	12	96518	96529	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219853426
27	NC_011837	GTATTT	2	12	102769	102780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	219853433
28	NC_011837	TATAGG	2	12	108287	108298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853439
29	NC_011837	CAGTGC	3	18	109845	109862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219853440
30	NC_011837	TTTTTA	2	12	110230	110241	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219853440
31	NC_011837	ATTTTT	2	12	112119	112130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219853440
32	NC_011837	TATATT	2	12	113215	113226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853441
33	NC_011837	TTTATA	2	12	116883	116894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853445
34	NC_011837	CTTCTA	2	12	119240	119251	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219853448
35	NC_011837	ATCTAA	2	12	119385	119396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219853448
36	NC_011837	AAAGAT	2	12	122125	122136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219853449
37	NC_011837	ATATTT	2	12	126455	126466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853453
38	NC_011837	GATACA	2	12	128135	128146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219853454
39	NC_011837	AAAGAT	2	12	129183	129194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219853455
40	NC_011837	TCTTTT	2	12	131795	131806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219853459
41	NC_011837	TTTATC	2	12	132277	132288	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219853459
42	NC_011837	GCCTAT	2	12	134551	134562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219853461
43	NC_011837	AGATAG	2	12	140863	140874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219853467
44	NC_011837	CAGAAT	2	12	141009	141020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219853467
45	NC_011837	GGACTT	2	12	141083	141094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219853467
46	NC_011837	ATAGAA	2	12	142423	142434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219853468
47	NC_011837	TATAGA	2	12	142837	142848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853469
48	NC_011837	ATTTTA	2	12	144472	144483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853470
49	NC_011837	GATGTA	2	12	145420	145431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853470
50	NC_011837	AGTGGC	2	12	145824	145835	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219853470
51	NC_011837	ATAAAT	2	12	150123	150134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853473
52	NC_011837	AAAAGA	2	12	154364	154375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219853480
53	NC_011837	AAAAAG	2	12	154486	154497	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219853480
54	NC_011837	TAGAAT	2	12	156492	156503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853481
55	NC_011837	GATATA	2	12	157682	157693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853481
56	NC_011837	ATAGCT	2	12	158476	158487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219853482
57	NC_011837	AGATTT	2	12	159760	159771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219853483
58	NC_011837	AAAGTT	2	12	159914	159925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853483
59	NC_011837	GTTTAT	2	12	160496	160507	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	219853484
60	NC_011837	AGAAAA	2	12	161879	161890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219853484
61	NC_011837	TAATAT	2	12	164573	164584	50 %	50 %	0 %	0 %	219853488
62	NC_011837	AGATGA	2	12	165649	165660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219853489
63	NC_011837	AAGAGA	2	12	167232	167243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853490
64	NC_011837	TGGAAT	2	12	168638	168649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853491
65	NC_011837	GATATT	2	12	178516	178527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219853493
66	NC_011837	GGAGCT	2	12	184317	184328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219853499
67	NC_011837	AAAGAA	2	12	184734	184745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219853499
68	NC_011837	GGAAAA	2	12	185385	185396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853499
69	NC_011837	TATAAT	2	12	185417	185428	50 %	50 %	0 %	0 %	219853499
70	NC_011837	TCTAAA	2	12	187172	187183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219853500
71	NC_011837	AGAAAA	2	12	187422	187433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219853501
72	NC_011837	AGTTAT	2	12	187764	187775	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219853501
73	NC_011837	TGAAAT	2	12	188016	188027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853501
74	NC_011837	AGCTAG	2	12	188406	188417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853501
75	NC_011837	ATAGAT	2	12	191873	191884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853505
76	NC_011837	TAAATA	2	12	192147	192158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853505
77	NC_011837	AAGGAA	2	12	193928	193939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853507
78	NC_011837	TTTGAT	2	12	199081	199092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	219853515
79	NC_011837	CAGTAG	2	12	200302	200313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853517
80	NC_011837	AGGATT	2	12	200432	200443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853517
81	NC_011837	TGGATA	2	12	201066	201077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853518
82	NC_011837	TAAAGG	2	12	201135	201146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219853518
83	NC_011837	ATTGAA	2	12	201842	201853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853518
84	NC_011837	TAAATA	2	12	201888	201899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853518
85	NC_011837	CAGCAC	2	12	208752	208763	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219853521
86	NC_011837	AATAAC	2	12	209944	209955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219853523
87	NC_011837	AATAAG	2	12	213449	213460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219853525
88	NC_011837	TAGGTG	2	12	220593	220604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219853540
89	NC_011837	TAGTTG	2	12	221748	221759	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219853543
90	NC_011837	TGTAGG	2	12	221776	221787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219853543
91	NC_011837	TAGAAG	2	12	222315	222326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219853544
92	NC_011837	AAACAG	2	12	225935	225946	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	219853550
93	NC_011837	TAGAAA	2	12	227638	227649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219853554
94	NC_011837	TATATT	2	12	231014	231025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853558
95	NC_011837	GTAATA	2	12	232680	232691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853560
96	NC_011837	CTGTTT	2	12	234612	234623	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219853563
97	NC_011837	CTGGCA	2	12	241315	241326	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219853569
98	NC_011837	AACCAT	2	12	241819	241830	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219853569
99	NC_011837	ACAGGA	2	12	246036	246047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	219853574
100	NC_011837	GATAAT	2	12	246752	246763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219853575
101	NC_011837	CGTCCT	2	12	249323	249334	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219853579
102	NC_011837	GCTCCG	2	12	249545	249556	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219853579
103	NC_011837	CCGTTC	2	12	249821	249832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219853579
104	NC_011837	TACCTG	2	12	251000	251011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219853580
105	NC_011837	CGGCAA	2	12	261173	261184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853589
106	NC_011837	GCGATA	2	12	262030	262041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853590
107	NC_011837	CTGTTC	2	12	262587	262598	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219853590
108	NC_011837	ATGGAT	2	12	265417	265428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853592
109	NC_011837	ATGGAT	2	12	265814	265825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853593
110	NC_011837	TGGATG	2	12	267938	267949	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219853595
111	NC_011837	AAATAA	2	12	270672	270683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219853597
112	NC_011837	AAAAAC	2	12	273412	273423	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	219853601
113	NC_011837	TAAAAT	2	12	273955	273966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853601
114	NC_011837	AGAAAA	2	12	273982	273993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219853601
115	NC_011837	ATAAAA	2	12	274716	274727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219853601
116	NC_011837	AGGGCA	2	12	275309	275320	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219853602
117	NC_011837	TACTGG	2	12	280906	280917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219853608
118	NC_011837	AAAAGC	2	12	281309	281320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	219853609
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465	NC_011837	CCATGC	2	12	1124012	1124023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219854334
466	NC_011837	ATAATT	2	12	1124918	1124929	50 %	50 %	0 %	0 %	219854334
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468	NC_011837	AAAGAA	2	12	1127308	1127319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219854335
469	NC_011837	GCTACA	2	12	1129002	1129013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219854337
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497	NC_011837	ATGCAG	3	18	1196459	1196476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219854392
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