MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016

Total Repeats: 4049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011837	AAATC	2	10	929	938	60 %	20 %	0 %	20 %	219853344
2	NC_011837	TATTT	2	10	2082	2091	20 %	80 %	0 %	0 %	219853345
3	NC_011837	ATGGT	2	10	2849	2858	20 %	40 %	40 %	0 %	219853346
4	NC_011837	AATTT	2	10	4121	4130	40 %	60 %	0 %	0 %	219853347
5	NC_011837	ATAAA	2	10	4691	4700	80 %	20 %	0 %	0 %	219853349
6	NC_011837	CAATA	2	10	5206	5215	60 %	20 %	0 %	20 %	219853349
7	NC_011837	AAAAC	2	10	5446	5455	80 %	0 %	0 %	20 %	219853349
8	NC_011837	TAAGA	2	10	5892	5901	60 %	20 %	20 %	0 %	219853349
9	NC_011837	ATATT	2	10	6500	6509	40 %	60 %	0 %	0 %	219853350
10	NC_011837	ATTTT	2	10	8018	8027	20 %	80 %	0 %	0 %	219853350
11	NC_011837	AGGAG	2	10	9980	9989	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011837	TCGTG	2	10	10389	10398	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011837	GGGAG	2	10	11937	11946	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011837	TAAGT	2	10	12463	12472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011837	AGGAT	2	10	12881	12890	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011837	CAAGA	2	10	14187	14196	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011837	TTCTT	2	10	14676	14685	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011837	ATATC	2	10	19415	19424	40 %	40 %	0 %	20 %	219853354
19	NC_011837	AAGAG	2	10	19765	19774	60 %	0 %	40 %	0 %	219853354
20	NC_011837	AAAAT	2	10	20569	20578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011837	ATCGT	2	10	23887	23896	20 %	40 %	20 %	20 %	219853358
22	NC_011837	CAGAA	2	10	24310	24319	60 %	0 %	20 %	20 %	219853358
23	NC_011837	TTGTA	2	10	25119	25128	20 %	60 %	20 %	0 %	219853359
24	NC_011837	CAAAT	2	10	26403	26412	60 %	20 %	0 %	20 %	219853360
25	NC_011837	ATAAA	2	10	28035	28044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011837	TAGGT	2	10	28416	28425	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011837	TTCCA	2	10	29447	29456	20 %	40 %	0 %	40 %	219853362
28	NC_011837	AGAAA	2	10	29845	29854	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011837	GATTT	2	10	33365	33374	20 %	60 %	20 %	0 %	219853366
30	NC_011837	CTACC	2	10	33850	33859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_011837	ATTAT	2	10	34410	34419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011837	AAGTA	2	10	34437	34446	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011837	AAAAG	2	10	35143	35152	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011837	TTTTA	2	10	37560	37569	20 %	80 %	0 %	0 %	219853370
35	NC_011837	TTTAT	2	10	38002	38011	20 %	80 %	0 %	0 %	219853370
36	NC_011837	TTATA	2	10	38145	38154	40 %	60 %	0 %	0 %	219853370
37	NC_011837	ATTTA	2	10	40113	40122	40 %	60 %	0 %	0 %	219853372
38	NC_011837	TAAAA	2	10	40893	40902	80 %	20 %	0 %	0 %	219853373
39	NC_011837	ATATC	2	10	46139	46148	40 %	40 %	0 %	20 %	219853377
40	NC_011837	ATTTC	2	10	47160	47169	20 %	60 %	0 %	20 %	219853378
41	NC_011837	ACTTT	2	10	47622	47631	20 %	60 %	0 %	20 %	219853378
42	NC_011837	CAATA	2	10	47964	47973	60 %	20 %	0 %	20 %	219853379
43	NC_011837	TTTTC	2	10	49300	49309	0 %	80 %	0 %	20 %	219853380
44	NC_011837	ATCTT	2	10	51088	51097	20 %	60 %	0 %	20 %	219853382
45	NC_011837	TTATT	2	10	51186	51195	20 %	80 %	0 %	0 %	219853382
46	NC_011837	TTGTT	2	10	51955	51964	0 %	80 %	20 %	0 %	219853382
47	NC_011837	ATTAT	2	10	52307	52316	40 %	60 %	0 %	0 %	219853383
48	NC_011837	AGATA	2	10	52421	52430	60 %	20 %	20 %	0 %	219853383
49	NC_011837	TGAGT	2	10	54508	54517	20 %	40 %	40 %	0 %	219853385
50	NC_011837	TTTTA	2	10	55023	55032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011837	TATTT	2	10	55033	55042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011837	TTTAG	2	10	55863	55872	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011837	ACTTT	2	10	56819	56828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011837	GTCAA	2	10	56833	56842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011837	TAAAA	2	10	57430	57439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011837	AATAT	2	10	57770	57779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011837	CAAAA	2	10	57989	57998	80 %	0 %	0 %	20 %	219853389
58	NC_011837	AGAAA	2	10	59061	59070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011837	TTGGA	2	10	59130	59139	20 %	40 %	40 %	0 %	219853390
60	NC_011837	ACACA	2	10	59772	59781	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_011837	GTTGT	2	10	60426	60435	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011837	CACGG	2	10	64447	64456	20 %	0 %	40 %	40 %	219853395
63	NC_011837	TTCCT	2	10	64504	64513	0 %	60 %	0 %	40 %	219853395
64	NC_011837	GTAAA	2	10	66534	66543	60 %	20 %	20 %	0 %	219853398
65	NC_011837	TTGTA	2	10	66920	66929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011837	TATAT	2	10	67146	67155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011837	GCAGA	2	10	67233	67242	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011837	TCCAA	2	10	69216	69225	40 %	20 %	0 %	40 %	219853400
69	NC_011837	CCACC	2	10	69753	69762	20 %	0 %	0 %	80 %	219853400
70	NC_011837	AAGTT	2	10	71663	71672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011837	TTAAT	2	10	72164	72173	40 %	60 %	0 %	0 %	219853401
72	NC_011837	AAAAC	2	10	72948	72957	80 %	0 %	0 %	20 %	219853402
73	NC_011837	TCTGT	2	10	73097	73106	0 %	60 %	20 %	20 %	219853402
74	NC_011837	AAAAC	2	10	73418	73427	80 %	0 %	0 %	20 %	219853403
75	NC_011837	ATATA	2	10	73755	73764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011837	TGAAA	2	10	75408	75417	60 %	20 %	20 %	0 %	219853405
77	NC_011837	GTATA	2	10	76112	76121	40 %	40 %	20 %	0 %	219853406
78	NC_011837	TAATG	2	10	78237	78246	40 %	40 %	20 %	0 %	219853408
79	NC_011837	GTTAA	2	10	80411	80420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011837	ATTTA	2	10	81750	81759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011837	ATAAA	2	10	82609	82618	80 %	20 %	0 %	0 %	219853412
82	NC_011837	TCAAT	2	10	82887	82896	40 %	40 %	0 %	20 %	219853412
83	NC_011837	AAGTT	2	10	83482	83491	40 %	40 %	20 %	0 %	219853412
84	NC_011837	TAGGG	2	10	83843	83852	20 %	20 %	60 %	0 %	219853413
85	NC_011837	AGCTC	2	10	84023	84032	20 %	20 %	20 %	40 %	219853413
86	NC_011837	TGGAT	2	10	85661	85670	20 %	40 %	40 %	0 %	219853414
87	NC_011837	ATTAT	2	10	86568	86577	40 %	60 %	0 %	0 %	219853415
88	NC_011837	AAAAG	2	10	87245	87254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011837	TATAA	2	10	89179	89188	60 %	40 %	0 %	0 %	219853417
90	NC_011837	AACAA	2	10	90963	90972	80 %	0 %	0 %	20 %	219853419
91	NC_011837	TAGCA	2	10	94737	94746	40 %	20 %	20 %	20 %	219853424
92	NC_011837	AGTAC	2	10	95284	95293	40 %	20 %	20 %	20 %	219853424
93	NC_011837	CAGGT	2	10	95931	95940	20 %	20 %	40 %	20 %	219853425
94	NC_011837	AAAGA	2	10	96985	96994	80 %	0 %	20 %	0 %	219853426
95	NC_011837	AAGAG	2	10	97694	97703	60 %	0 %	40 %	0 %	219853427
96	NC_011837	GAGTT	2	10	98484	98493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011837	TAAAT	2	10	99908	99917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011837	ATTTT	2	10	103318	103327	20 %	80 %	0 %	0 %	219853433
99	NC_011837	GCAAA	3	15	103455	103469	60 %	0 %	20 %	20 %	219853433
100	NC_011837	TTCAG	2	10	106070	106079	20 %	40 %	20 %	20 %	219853437
101	NC_011837	GATAA	2	10	106955	106964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011837	ATTAT	2	10	108622	108631	40 %	60 %	0 %	0 %	219853439
103	NC_011837	ATTTT	2	10	109360	109369	20 %	80 %	0 %	0 %	219853439
104	NC_011837	TAATT	2	10	109588	109597	40 %	60 %	0 %	0 %	219853440
105	NC_011837	TTACT	2	10	109613	109622	20 %	60 %	0 %	20 %	219853440
106	NC_011837	TAATA	2	10	110741	110750	60 %	40 %	0 %	0 %	219853440
107	NC_011837	TTTTG	2	10	111564	111573	0 %	80 %	20 %	0 %	219853440
108	NC_011837	TTTCT	2	10	111704	111713	0 %	80 %	0 %	20 %	219853440
109	NC_011837	TCATT	2	10	111881	111890	20 %	60 %	0 %	20 %	219853440
110	NC_011837	TTTCT	2	10	112368	112377	0 %	80 %	0 %	20 %	219853440
111	NC_011837	TTTCT	2	10	114525	114534	0 %	80 %	0 %	20 %	219853442
112	NC_011837	TTTTA	2	10	114959	114968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011837	ATAGC	2	10	116093	116102	40 %	20 %	20 %	20 %	219853444
114	NC_011837	TATAT	2	10	116260	116269	40 %	60 %	0 %	0 %	219853444
115	NC_011837	TATTT	2	10	117521	117530	20 %	80 %	0 %	0 %	219853445
116	NC_011837	ATTTA	2	10	117790	117799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011837	ATGCC	2	10	120140	120149	20 %	20 %	20 %	40 %	219853448
118	NC_011837	TCACA	2	10	120797	120806	40 %	20 %	0 %	40 %	219853448
119	NC_011837	AATTT	2	10	121142	121151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011837	TATAT	2	10	121372	121381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011837	GTAGG	2	10	122263	122272	20 %	20 %	60 %	0 %	219853450
122	NC_011837	AGAAT	2	10	122292	122301	60 %	20 %	20 %	0 %	219853450
123	NC_011837	AGTTC	2	10	122553	122562	20 %	40 %	20 %	20 %	219853450
124	NC_011837	GATAT	2	10	122584	122593	40 %	40 %	20 %	0 %	219853450
125	NC_011837	AAATA	2	10	122594	122603	80 %	20 %	0 %	0 %	219853450
126	NC_011837	TCTAA	2	10	122965	122974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011837	ATAAA	2	10	124177	124186	80 %	20 %	0 %	0 %	219853451
128	NC_011837	TAATT	2	10	124472	124481	40 %	60 %	0 %	0 %	219853451
129	NC_011837	TAAAA	2	10	125934	125943	80 %	20 %	0 %	0 %	219853453
130	NC_011837	AGAAA	2	10	125996	126005	80 %	0 %	20 %	0 %	219853453
131	NC_011837	CTTTT	2	10	126323	126332	0 %	80 %	0 %	20 %	219853453
132	NC_011837	AATTT	2	10	126759	126768	40 %	60 %	0 %	0 %	219853453
133	NC_011837	TATAA	2	10	128508	128517	60 %	40 %	0 %	0 %	219853455
134	NC_011837	TGATA	2	10	128894	128903	40 %	40 %	20 %	0 %	219853455
135	NC_011837	ACATT	2	10	130450	130459	40 %	40 %	0 %	20 %	219853458
136	NC_011837	CTTTT	2	10	131440	131449	0 %	80 %	0 %	20 %	219853459
137	NC_011837	CATAG	2	10	133385	133394	40 %	20 %	20 %	20 %	219853461
138	NC_011837	AGAGA	2	10	135132	135141	60 %	0 %	40 %	0 %	219853462
139	NC_011837	CAAGA	2	10	137946	137955	60 %	0 %	20 %	20 %	219853465
140	NC_011837	ATGAT	2	10	138324	138333	40 %	40 %	20 %	0 %	219853465
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