MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	AGCTGG	2	12	1821	1832	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219684029
2	NC_011836	CACAGC	2	12	3681	3692	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219684029
3	NC_011836	ATTTGA	2	12	9442	9453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219684031
4	NC_011836	ATGGTG	2	12	11941	11952	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219684032
5	NC_011836	ACAATC	2	12	12152	12163	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219684032
6	NC_011836	GCTAAA	2	12	14146	14157	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219684036
7	NC_011836	AGATAT	2	12	18035	18046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219684040
8	NC_011836	AGGTGG	2	12	18728	18739	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	219684040
9	NC_011836	AAATGC	2	12	18809	18820	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219684040
10	NC_011836	ATAAAA	2	12	19368	19379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219684041
11	NC_011836	AATTTA	2	12	20323	20334	50 %	50 %	0 %	0 %	219684042
12	NC_011836	AAGTTA	2	12	20575	20586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219684042
13	NC_011836	TGGTAA	2	12	20981	20992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219684042
14	NC_011836	AAAATA	2	12	31077	31088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219684055
15	NC_011836	TAAAAA	2	12	35783	35794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219684057
16	NC_011836	TAAAAA	2	12	36917	36928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219684057
17	NC_011836	TAAAAC	2	12	37454	37465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219684058
18	NC_011836	AAACTA	2	12	38233	38244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219684060
19	NC_011836	TAAAAT	2	12	42620	42631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219684066
20	NC_011836	CAATAA	2	12	43742	43753	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219684068
21	NC_011836	CAAAAA	2	12	53362	53373	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	219684074
22	NC_011836	CGATAC	2	12	53457	53468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219684075
23	NC_011836	AAAGCA	2	12	54386	54397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	219684076
24	NC_011836	TAATGA	2	12	55933	55944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219684078
25	NC_011836	TAGAAA	2	12	56774	56785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219684080

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.