MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	ATACA	2	10	461	470	60 %	20 %	0 %	20 %	219684029
2	NC_011836	AATAA	2	10	529	538	80 %	20 %	0 %	0 %	219684029
3	NC_011836	TGGCT	2	10	1698	1707	0 %	40 %	40 %	20 %	219684029
4	NC_011836	CAGAC	2	10	1982	1991	40 %	0 %	20 %	40 %	219684029
5	NC_011836	TGAAA	2	10	2268	2277	60 %	20 %	20 %	0 %	219684029
6	NC_011836	GAGAA	2	10	2639	2648	60 %	0 %	40 %	0 %	219684029
7	NC_011836	AGTAA	2	10	2812	2821	60 %	20 %	20 %	0 %	219684029
8	NC_011836	CAAAA	2	10	3435	3444	80 %	0 %	0 %	20 %	219684029
9	NC_011836	TAACT	2	10	4254	4263	40 %	40 %	0 %	20 %	219684029
10	NC_011836	CAAAA	2	10	4642	4651	80 %	0 %	0 %	20 %	219684029
11	NC_011836	CTGGA	2	10	4742	4751	20 %	20 %	40 %	20 %	219684029
12	NC_011836	CAATT	2	10	6440	6449	40 %	40 %	0 %	20 %	219684029
13	NC_011836	ATAGT	2	10	7505	7514	40 %	40 %	20 %	0 %	219684029
14	NC_011836	CATTA	2	10	7738	7747	40 %	40 %	0 %	20 %	219684030
15	NC_011836	ACAAG	2	10	9028	9037	60 %	0 %	20 %	20 %	219684031
16	NC_011836	TGATT	2	10	9884	9893	20 %	60 %	20 %	0 %	219684032
17	NC_011836	CATGA	2	10	10512	10521	40 %	20 %	20 %	20 %	219684032
18	NC_011836	GGGAA	2	10	11923	11932	40 %	0 %	60 %	0 %	219684032
19	NC_011836	TACTT	2	10	13827	13836	20 %	60 %	0 %	20 %	219684035
20	NC_011836	AAACC	2	10	14593	14602	60 %	0 %	0 %	40 %	219684036
21	NC_011836	GTATT	2	10	18504	18513	20 %	60 %	20 %	0 %	219684040
22	NC_011836	ATAAA	2	10	21422	21431	80 %	20 %	0 %	0 %	219684043
23	NC_011836	TTTAT	2	10	22086	22095	20 %	80 %	0 %	0 %	219684044
24	NC_011836	AGACA	2	10	24717	24726	60 %	0 %	20 %	20 %	219684047
25	NC_011836	TTATT	2	10	25060	25069	20 %	80 %	0 %	0 %	219684048
26	NC_011836	CCGTA	2	10	25233	25242	20 %	20 %	20 %	40 %	219684048
27	NC_011836	AGAAA	2	10	26051	26060	80 %	0 %	20 %	0 %	219684048
28	NC_011836	TTCTT	2	10	27810	27819	0 %	80 %	0 %	20 %	219684050
29	NC_011836	AAGTT	2	10	29099	29108	40 %	40 %	20 %	0 %	219684051
30	NC_011836	AAAAT	2	10	29556	29565	80 %	20 %	0 %	0 %	219684053
31	NC_011836	ATTTA	2	10	32213	32222	40 %	60 %	0 %	0 %	219684056
32	NC_011836	CCTAA	2	10	32295	32304	40 %	20 %	0 %	40 %	219684056
33	NC_011836	GACAA	2	10	34264	34273	60 %	0 %	20 %	20 %	219684057
34	NC_011836	AGATA	2	10	35495	35504	60 %	20 %	20 %	0 %	219684057
35	NC_011836	GAAAA	2	10	35937	35946	80 %	0 %	20 %	0 %	219684057
36	NC_011836	AGGTG	2	10	37790	37799	20 %	20 %	60 %	0 %	219684058
37	NC_011836	AGTGC	2	10	41431	41440	20 %	20 %	40 %	20 %	219684064
38	NC_011836	GGTAT	2	10	42762	42771	20 %	40 %	40 %	0 %	219684066
39	NC_011836	AAAAT	3	15	43678	43692	80 %	20 %	0 %	0 %	219684068
40	NC_011836	AAAAG	2	10	44076	44085	80 %	0 %	20 %	0 %	219684068
41	NC_011836	CAAGG	2	10	47069	47078	40 %	0 %	40 %	20 %	219684069
42	NC_011836	AAAGA	2	10	48143	48152	80 %	0 %	20 %	0 %	219684070
43	NC_011836	GATTT	2	10	50017	50026	20 %	60 %	20 %	0 %	219684073
44	NC_011836	TTAAA	2	10	50639	50648	60 %	40 %	0 %	0 %	219684073
45	NC_011836	TTTAT	2	10	51613	51622	20 %	80 %	0 %	0 %	219684073
46	NC_011836	TGACT	2	10	51699	51708	20 %	40 %	20 %	20 %	219684073
47	NC_011836	AAGGA	2	10	53336	53345	60 %	0 %	40 %	0 %	219684074
48	NC_011836	TGAAA	2	10	54121	54130	60 %	20 %	20 %	0 %	219684075
49	NC_011836	CAGAA	2	10	54300	54309	60 %	0 %	20 %	20 %	219684076
50	NC_011836	GTTTT	2	10	55215	55224	0 %	80 %	20 %	0 %	219684076
51	NC_011836	ATATT	2	10	56790	56799	40 %	60 %	0 %	0 %	219684080
52	NC_011836	ACAGC	2	10	57465	57474	40 %	0 %	20 %	40 %	219684081
53	NC_011836	TTTTA	2	10	58598	58607	20 %	80 %	0 %	0 %	219684083
54	NC_011836	TGATT	2	10	58817	58826	20 %	60 %	20 %	0 %	219684083

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.