MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	TAA	2	6	13402	13407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011836	AGG	2	6	13591	13596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011836	AAT	2	6	14929	14934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011836	AGG	2	6	15033	15038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011836	AGG	2	6	15539	15544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011836	GAA	2	6	16310	16315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011836	TAC	2	6	16383	16388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011836	GAT	2	6	16414	16419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011836	TAA	2	6	16516	16521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011836	ATT	2	6	16596	16601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011836	GTG	2	6	16625	16630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011836	ATG	2	6	16632	16637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011836	TAA	2	6	16661	16666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011836	GAA	2	6	16680	16685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011836	ATA	2	6	16744	16749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011836	AGA	2	6	17004	17009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011836	ATT	2	6	17010	17015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011836	TTA	2	6	17074	17079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011836	AAT	2	6	17756	17761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011836	TAT	2	6	17827	17832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011836	TTA	2	6	17890	17895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011836	GAT	2	6	18863	18868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011836	TAG	2	6	18880	18885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011836	AGA	2	6	18982	18987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011836	AAC	2	6	19014	19019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011836	AGA	2	6	19024	19029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011836	AAT	2	6	19030	19035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011836	ACA	2	6	19061	19066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011836	AGA	2	6	19072	19077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011836	ATA	2	6	19128	19133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011836	GTA	2	6	19749	19754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011836	GAA	2	6	19809	19814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011836	TCA	2	6	19825	19830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011836	TAC	2	6	19953	19958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011836	GGA	2	6	21800	21805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011836	TAT	2	6	22609	22614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011836	TAT	2	6	22619	22624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011836	ATG	2	6	22768	22773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011836	TTA	2	6	22828	22833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011836	AGG	2	6	22901	22906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011836	AAG	2	6	22972	22977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011836	CAC	2	6	23105	23110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011836	ATT	2	6	23129	23134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011836	AGG	2	6	23139	23144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011836	TTA	2	6	23722	23727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011836	GCA	2	6	23779	23784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011836	TGC	2	6	23809	23814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011836	AAG	2	6	23828	23833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011836	TGA	2	6	23883	23888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011836	TTA	2	6	26342	26347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011836	AAC	2	6	26868	26873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011836	TAT	2	6	26941	26946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011836	TTA	3	9	27069	27077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011836	AAT	2	6	27286	27291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011836	AAT	2	6	27323	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011836	TTA	2	6	27336	27341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011836	ATT	2	6	27382	27387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011836	GAT	2	6	27390	27395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011836	ATA	2	6	27848	27853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011836	CCT	2	6	27854	27859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011836	ACA	2	6	27902	27907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011836	ATA	2	6	27933	27938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011836	TAT	2	6	27950	27955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011836	AGG	2	6	27996	28001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011836	AGC	2	6	28139	28144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011836	AGG	2	6	28200	28205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011836	ACT	2	6	28284	28289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011836	AGG	2	6	29549	29554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011836	GCA	2	6	30060	30065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011836	AAG	2	6	30134	30139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011836	GAG	2	6	30196	30201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011836	TTA	2	6	30371	30376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011836	GAA	2	6	31796	31801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011836	ATG	2	6	31803	31808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011836	ACA	2	6	31867	31872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011836	TAA	2	6	32092	32097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011836	TAG	2	6	33228	33233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011836	AGG	2	6	33417	33422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011836	TGC	2	6	33459	33464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011836	TGA	2	6	33471	33476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011836	AGG	2	6	33497	33502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011836	GGT	2	6	37296	37301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011836	ATG	2	6	38151	38156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011836	GCA	2	6	38684	38689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011836	AAT	2	6	38714	38719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011836	AAT	2	6	38753	38758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011836	ATT	2	6	38791	38796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011836	ATG	2	6	38851	38856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011836	GAA	2	6	38859	38864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011836	AGA	2	6	38924	38929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011836	AGG	2	6	38967	38972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011836	TTC	2	6	39071	39076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011836	TTA	2	6	39146	39151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011836	TAG	2	6	39216	39221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011836	AGA	2	6	39222	39227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011836	GAG	2	6	40271	40276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011836	AGA	2	6	40336	40341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011836	GGT	2	6	40401	40406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011836	TTA	2	6	40418	40423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011836	TTG	2	6	40459	40464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011836	TTG	2	6	40504	40509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011836	ATT	2	6	40576	40581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011836	TAA	2	6	40896	40901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011836	TAA	2	6	41002	41007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011836	TAG	2	6	41572	41577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011836	GAG	2	6	41736	41741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011836	GAT	2	6	41801	41806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011836	GAT	2	6	41879	41884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011836	AGG	2	6	41985	41990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011836	GAT	2	6	42960	42965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011836	ATA	2	6	46225	46230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011836	TTA	2	6	46249	46254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011836	TTA	2	6	46260	46265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011836	TTA	2	6	46272	46277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011836	TAA	2	6	46322	46327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011836	ATA	2	6	46329	46334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011836	GTA	2	6	46454	46459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011836	TTA	2	6	46483	46488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011836	TTA	2	6	46495	46500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011836	AAG	2	6	46507	46512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011836	ACT	2	6	46632	46637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011836	AGT	2	6	46669	46674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011836	AAT	2	6	46750	46755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011836	AGA	2	6	47539	47544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011836	AAT	2	6	47554	47559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011836	TTC	2	6	47570	47575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011836	AGA	2	6	47579	47584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011836	TAC	2	6	47621	47626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011836	GAA	2	6	47691	47696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011836	GGT	2	6	48217	48222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011836	GTG	2	6	48615	48620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011836	CAA	2	6	55315	55320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011836	CAA	2	6	55465	55470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011836	ATA	2	6	57962	57967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011836	ATT	2	6	58370	58375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011836	ACA	2	6	58382	58387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011836	GAA	2	6	58403	58408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011836	AAC	2	6	58420	58425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011836	AGA	2	6	58483	58488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011836	TTG	2	6	59014	59019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011836	TAT	2	6	59020	59025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.