MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	TA	3	6	1958	1963	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
2	NC_011836	TA	3	6	2688	2693	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
3	NC_011836	AT	3	6	4929	4934	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
4	NC_011836	TA	3	6	4955	4960	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
5	NC_011836	TA	3	6	7200	7205	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
6	NC_011836	TA	5	10	7711	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
7	NC_011836	TA	3	6	7892	7897	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
8	NC_011836	AC	3	6	8002	8007	50 %	0 %	0 %	50 %	219684030
9	NC_011836	TA	3	6	8313	8318	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
10	NC_011836	TA	3	6	8444	8449	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
11	NC_011836	AG	3	6	9018	9023	50 %	0 %	50 %	0 %	219684031
12	NC_011836	AT	3	6	9122	9127	50 %	50 %	0 %	0 %	219684031
13	NC_011836	AT	3	6	9572	9577	50 %	50 %	0 %	0 %	219684031
14	NC_011836	TA	3	6	9870	9875	50 %	50 %	0 %	0 %	219684032
15	NC_011836	AG	3	6	10030	10035	50 %	0 %	50 %	0 %	219684032
16	NC_011836	GA	3	6	10779	10784	50 %	0 %	50 %	0 %	219684032
17	NC_011836	TC	3	6	11213	11218	0 %	50 %	0 %	50 %	219684032
18	NC_011836	TG	4	8	11309	11316	0 %	50 %	50 %	0 %	219684032
19	NC_011836	AT	3	6	12990	12995	50 %	50 %	0 %	0 %	219684034
20	NC_011836	AT	4	8	13253	13260	50 %	50 %	0 %	0 %	219684034
21	NC_011836	GA	3	6	13290	13295	50 %	0 %	50 %	0 %	219684034
22	NC_011836	TA	3	6	13744	13749	50 %	50 %	0 %	0 %	219684035
23	NC_011836	TA	3	6	14383	14388	50 %	50 %	0 %	0 %	219684036
24	NC_011836	AT	3	6	14909	14914	50 %	50 %	0 %	0 %	219684036
25	NC_011836	AG	3	6	15273	15278	50 %	0 %	50 %	0 %	219684037
26	NC_011836	TA	3	6	15638	15643	50 %	50 %	0 %	0 %	219684038
27	NC_011836	TA	3	6	15705	15710	50 %	50 %	0 %	0 %	219684038
28	NC_011836	AG	3	6	15774	15779	50 %	0 %	50 %	0 %	219684038
29	NC_011836	TG	3	6	15926	15931	0 %	50 %	50 %	0 %	219684038
30	NC_011836	AT	3	6	16055	16060	50 %	50 %	0 %	0 %	219684038
31	NC_011836	GA	3	6	16232	16237	50 %	0 %	50 %	0 %	219684038
32	NC_011836	TA	3	6	16581	16586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011836	TA	3	6	16588	16593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011836	AT	4	8	16614	16621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011836	AT	3	6	16686	16691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011836	TA	4	8	16748	16755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011836	AT	3	6	16809	16814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011836	AT	3	6	17157	17162	50 %	50 %	0 %	0 %	219684039
39	NC_011836	TA	3	6	17672	17677	50 %	50 %	0 %	0 %	219684039
40	NC_011836	TA	3	6	17768	17773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011836	AT	3	6	18348	18353	50 %	50 %	0 %	0 %	219684040
42	NC_011836	AT	3	6	18593	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	219684040
43	NC_011836	AT	3	6	18715	18720	50 %	50 %	0 %	0 %	219684040
44	NC_011836	AT	4	8	19602	19609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011836	AT	3	6	19697	19702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011836	TA	3	6	19786	19791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011836	AT	3	6	20726	20731	50 %	50 %	0 %	0 %	219684042
48	NC_011836	AT	3	6	21154	21159	50 %	50 %	0 %	0 %	219684042
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50	NC_011836	AT	3	6	21648	21653	50 %	50 %	0 %	0 %	219684043
51	NC_011836	TA	3	6	21682	21687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011836	AT	3	6	21790	21795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011836	AC	3	6	21955	21960	50 %	0 %	0 %	50 %	219684044
54	NC_011836	TA	3	6	22210	22215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011836	AT	3	6	22628	22633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011836	TC	3	6	22679	22684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011836	TA	3	6	22721	22726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011836	GT	3	6	22870	22875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011836	CA	3	6	22981	22986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011836	TA	3	6	23119	23124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_011836	TG	3	6	23615	23620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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64	NC_011836	TA	4	8	23754	23761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_011836	AG	3	6	24787	24792	50 %	0 %	50 %	0 %	219684047
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70	NC_011836	AT	3	6	25026	25031	50 %	50 %	0 %	0 %	219684048
71	NC_011836	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	219684048
72	NC_011836	TA	3	6	26669	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	219684049
73	NC_011836	AT	3	6	26740	26745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011836	TA	3	6	26995	27000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011836	TA	3	6	27119	27124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011836	AT	3	6	27125	27130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011836	TA	3	6	27141	27146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_011836	AT	3	6	36769	36774	50 %	50 %	0 %	0 %	219684057
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110	NC_011836	AT	3	6	41503	41508	50 %	50 %	0 %	0 %	219684064
111	NC_011836	AT	3	6	41818	41823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011836	GA	3	6	41959	41964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011836	TA	3	6	42213	42218	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
114	NC_011836	AT	3	6	42226	42231	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
115	NC_011836	TA	3	6	42390	42395	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
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126	NC_011836	TA	4	8	46312	46319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011836	AT	3	6	46343	46348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011836	AT	4	8	47171	47178	50 %	50 %	0 %	0 %	219684069
129	NC_011836	TA	3	6	47376	47381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011836	AG	3	6	47774	47779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011836	AT	4	8	48262	48269	50 %	50 %	0 %	0 %	219684071
132	NC_011836	AG	3	6	48286	48291	50 %	0 %	50 %	0 %	219684071
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149	NC_011836	TA	3	6	58994	58999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.