MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	TA	3	6	1958	1963	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
2	NC_011836	TA	3	6	2688	2693	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
3	NC_011836	AT	3	6	4929	4934	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
4	NC_011836	TA	3	6	4955	4960	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
5	NC_011836	TA	3	6	7200	7205	50 %	50 %	0 %	0 %	219684029
6	NC_011836	TA	5	10	7711	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
7	NC_011836	TA	3	6	7892	7897	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
8	NC_011836	AC	3	6	8002	8007	50 %	0 %	0 %	50 %	219684030
9	NC_011836	TA	3	6	8313	8318	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
10	NC_011836	TA	3	6	8444	8449	50 %	50 %	0 %	0 %	219684030
11	NC_011836	AG	3	6	9018	9023	50 %	0 %	50 %	0 %	219684031
12	NC_011836	AT	3	6	9122	9127	50 %	50 %	0 %	0 %	219684031
13	NC_011836	AT	3	6	9572	9577	50 %	50 %	0 %	0 %	219684031
14	NC_011836	TA	3	6	9870	9875	50 %	50 %	0 %	0 %	219684032
15	NC_011836	AG	3	6	10030	10035	50 %	0 %	50 %	0 %	219684032
16	NC_011836	GA	3	6	10779	10784	50 %	0 %	50 %	0 %	219684032
17	NC_011836	TC	3	6	11213	11218	0 %	50 %	0 %	50 %	219684032
18	NC_011836	TG	4	8	11309	11316	0 %	50 %	50 %	0 %	219684032
19	NC_011836	AT	3	6	12990	12995	50 %	50 %	0 %	0 %	219684034
20	NC_011836	AT	4	8	13253	13260	50 %	50 %	0 %	0 %	219684034
21	NC_011836	GA	3	6	13290	13295	50 %	0 %	50 %	0 %	219684034
22	NC_011836	TA	3	6	13744	13749	50 %	50 %	0 %	0 %	219684035
23	NC_011836	TA	3	6	14383	14388	50 %	50 %	0 %	0 %	219684036
24	NC_011836	AT	3	6	14909	14914	50 %	50 %	0 %	0 %	219684036
25	NC_011836	AG	3	6	15273	15278	50 %	0 %	50 %	0 %	219684037
26	NC_011836	TA	3	6	15638	15643	50 %	50 %	0 %	0 %	219684038
27	NC_011836	TA	3	6	15705	15710	50 %	50 %	0 %	0 %	219684038
28	NC_011836	AG	3	6	15774	15779	50 %	0 %	50 %	0 %	219684038
29	NC_011836	TG	3	6	15926	15931	0 %	50 %	50 %	0 %	219684038
30	NC_011836	AT	3	6	16055	16060	50 %	50 %	0 %	0 %	219684038
31	NC_011836	GA	3	6	16232	16237	50 %	0 %	50 %	0 %	219684038
32	NC_011836	AT	3	6	17157	17162	50 %	50 %	0 %	0 %	219684039
33	NC_011836	TA	3	6	17672	17677	50 %	50 %	0 %	0 %	219684039
34	NC_011836	AT	3	6	18348	18353	50 %	50 %	0 %	0 %	219684040
35	NC_011836	AT	3	6	18593	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	219684040
36	NC_011836	AT	3	6	18715	18720	50 %	50 %	0 %	0 %	219684040
37	NC_011836	AT	3	6	20726	20731	50 %	50 %	0 %	0 %	219684042
38	NC_011836	AT	3	6	21154	21159	50 %	50 %	0 %	0 %	219684042
39	NC_011836	AT	4	8	21521	21528	50 %	50 %	0 %	0 %	219684043
40	NC_011836	AT	3	6	21648	21653	50 %	50 %	0 %	0 %	219684043
41	NC_011836	AC	3	6	21955	21960	50 %	0 %	0 %	50 %	219684044
42	NC_011836	AT	3	6	23158	23163	50 %	50 %	0 %	0 %	219684046
43	NC_011836	AG	3	6	24611	24616	50 %	0 %	50 %	0 %	219684047
44	NC_011836	AG	3	6	24787	24792	50 %	0 %	50 %	0 %	219684047
45	NC_011836	AT	3	6	25026	25031	50 %	50 %	0 %	0 %	219684048
46	NC_011836	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	219684048
47	NC_011836	TA	3	6	26669	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	219684049
48	NC_011836	AG	3	6	28840	28845	50 %	0 %	50 %	0 %	219684051
49	NC_011836	AG	3	6	29428	29433	50 %	0 %	50 %	0 %	219684052
50	NC_011836	AT	3	6	29857	29862	50 %	50 %	0 %	0 %	219684053
51	NC_011836	TA	3	6	30008	30013	50 %	50 %	0 %	0 %	219684053
52	NC_011836	TG	3	6	30765	30770	0 %	50 %	50 %	0 %	219684054
53	NC_011836	TA	3	6	32317	32322	50 %	50 %	0 %	0 %	219684056
54	NC_011836	AT	3	6	32791	32796	50 %	50 %	0 %	0 %	219684056
55	NC_011836	AT	3	6	35464	35469	50 %	50 %	0 %	0 %	219684057
56	NC_011836	AG	3	6	36331	36336	50 %	0 %	50 %	0 %	219684057
57	NC_011836	GA	3	6	36711	36716	50 %	0 %	50 %	0 %	219684057
58	NC_011836	AT	3	6	36769	36774	50 %	50 %	0 %	0 %	219684057
59	NC_011836	GA	3	6	37161	37166	50 %	0 %	50 %	0 %	219684057
60	NC_011836	GA	3	6	37476	37481	50 %	0 %	50 %	0 %	219684058
61	NC_011836	TG	3	6	38348	38353	0 %	50 %	50 %	0 %	219684060
62	NC_011836	CT	3	6	38357	38362	0 %	50 %	0 %	50 %	219684060
63	NC_011836	AG	3	6	38443	38448	50 %	0 %	50 %	0 %	219684060
64	NC_011836	AT	3	6	39505	39510	50 %	50 %	0 %	0 %	219684061
65	NC_011836	AT	3	6	39796	39801	50 %	50 %	0 %	0 %	219684062
66	NC_011836	AG	3	6	40781	40786	50 %	0 %	50 %	0 %	219684063
67	NC_011836	AG	3	6	41163	41168	50 %	0 %	50 %	0 %	219684064
68	NC_011836	AT	3	6	41186	41191	50 %	50 %	0 %	0 %	219684064
69	NC_011836	AT	3	6	41212	41217	50 %	50 %	0 %	0 %	219684064
70	NC_011836	TG	3	6	41408	41413	0 %	50 %	50 %	0 %	219684064
71	NC_011836	AT	3	6	41503	41508	50 %	50 %	0 %	0 %	219684064
72	NC_011836	TA	3	6	42213	42218	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
73	NC_011836	AT	3	6	42226	42231	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
74	NC_011836	TA	3	6	42390	42395	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
75	NC_011836	AT	3	6	42540	42545	50 %	50 %	0 %	0 %	219684065
76	NC_011836	AT	3	6	42862	42867	50 %	50 %	0 %	0 %	219684066
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78	NC_011836	TA	3	6	43830	43835	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
79	NC_011836	AT	3	6	43907	43912	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
80	NC_011836	TA	3	6	43991	43996	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
81	NC_011836	AT	3	6	44508	44513	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
82	NC_011836	TA	4	8	45907	45914	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
83	NC_011836	AT	3	6	46179	46184	50 %	50 %	0 %	0 %	219684068
84	NC_011836	AT	4	8	47171	47178	50 %	50 %	0 %	0 %	219684069
85	NC_011836	AT	4	8	48262	48269	50 %	50 %	0 %	0 %	219684071
86	NC_011836	AG	3	6	48286	48291	50 %	0 %	50 %	0 %	219684071
87	NC_011836	TA	3	6	50035	50040	50 %	50 %	0 %	0 %	219684073
88	NC_011836	AT	3	6	50389	50394	50 %	50 %	0 %	0 %	219684073
89	NC_011836	TA	3	6	51160	51165	50 %	50 %	0 %	0 %	219684073
90	NC_011836	GA	3	6	51256	51261	50 %	0 %	50 %	0 %	219684073
91	NC_011836	AT	5	10	52619	52628	50 %	50 %	0 %	0 %	219684074
92	NC_011836	AG	3	6	52903	52908	50 %	0 %	50 %	0 %	219684074
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94	NC_011836	AT	3	6	55646	55651	50 %	50 %	0 %	0 %	219684077
95	NC_011836	AG	3	6	56464	56469	50 %	0 %	50 %	0 %	219684079
96	NC_011836	AT	3	6	56479	56484	50 %	50 %	0 %	0 %	219684079
97	NC_011836	TA	3	6	57004	57009	50 %	50 %	0 %	0 %	219684081
98	NC_011836	AT	3	6	57199	57204	50 %	50 %	0 %	0 %	219684081
99	NC_011836	AT	3	6	58160	58165	50 %	50 %	0 %	0 %	219684082

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.