MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011835	AACGAC	2	12	17098	17109	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011835	CACCGA	2	12	17949	17960	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011835	ATGGGC	2	12	18957	18968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011835	AGTATG	2	12	32350	32361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011835	TGTGGT	2	12	45581	45592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011835	CTTCGA	2	12	47835	47846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011835	GGTCGA	2	12	50695	50706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011835	GGAAAA	2	12	51395	51406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011835	TTCCAG	2	12	58173	58184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011835	CATGAG	2	12	60878	60889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011835	GGGCGG	2	12	109082	109093	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011835	TACAAA	2	12	140511	140522	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011835	CTGGCA	2	12	147626	147637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011835	GATAGG	2	12	166709	166720	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011835	GCATGG	2	12	167000	167011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011835	GGCGCG	2	12	201248	201259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011835	GCGCCC	2	12	225914	225925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011835	ACTATG	2	12	240229	240240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011835	GAGACG	2	12	287069	287080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011835	AGAGGA	2	12	291811	291822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011835	GCTGTT	2	12	299421	299432	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011835	GCTTTT	2	12	361020	361031	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011835	GTTGGC	2	12	412731	412742	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011835	GAACGC	2	12	412791	412802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011835	CGCATC	2	12	445272	445283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011835	GCTGAA	2	12	482055	482066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011835	TGAGAT	2	12	498228	498239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011835	AAGGTA	2	12	498759	498770	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011835	TCCGCA	2	12	519141	519152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011835	CATGCA	2	12	530688	530699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011835	CCGACA	2	12	544297	544308	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011835	CGAAGG	2	12	566104	566115	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011835	GCGCAC	2	12	569833	569844	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011835	CGCTTT	2	12	625449	625460	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011835	GCCGTT	2	12	643962	643973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011835	CGCTTG	2	12	712059	712070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011835	GTCGAG	2	12	722060	722071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011835	ATGTTT	2	12	773023	773034	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011835	TCGATT	2	12	774389	774400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011835	ATACTC	2	12	783250	783261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011835	AGAGAA	2	12	787748	787759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011835	GTCGAC	2	12	819032	819043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011835	CAAAAA	2	12	886783	886794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011835	TCCCAT	2	12	905831	905842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011835	CGTAAG	2	12	957185	957196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011835	AAACCG	2	12	963824	963835	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011835	GGCCTT	2	12	984939	984950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011835	TTGAAG	2	12	984994	985005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011835	TCACAT	2	12	1015317	1015328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011835	GGCCAA	2	12	1033553	1033564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011835	TGGCTG	2	12	1072438	1072449	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011835	CTCGTT	2	12	1073765	1073776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011835	CCTTTG	2	12	1123764	1123775	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011835	GCAATC	2	12	1138324	1138335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011835	CATCTC	2	12	1150255	1150266	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011835	CAATCT	2	12	1150359	1150370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011835	GCGCTC	2	12	1213477	1213488	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011835	AGGGAA	2	12	1249411	1249422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011835	ATCGGG	2	12	1295480	1295491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011835	CCCATG	2	12	1310189	1310200	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011835	CTTGAT	2	12	1312591	1312602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011835	AAGGCG	2	12	1313263	1313274	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011835	TGCCTA	2	12	1314329	1314340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011835	GGAATC	2	12	1344681	1344692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011835	TCGCTC	2	12	1380086	1380097	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011835	GATTGC	2	12	1382024	1382035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011835	TCGCTC	2	12	1382081	1382092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011835	CGACAA	2	12	1395586	1395597	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011835	CATGCG	2	12	1452840	1452851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011835	ATGCCC	2	12	1486510	1486521	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011835	GCCACC	2	12	1533545	1533556	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011835	TTAGAC	2	12	1588866	1588877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011835	CGTGGC	2	12	1606934	1606945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011835	GCCCTT	2	12	1625173	1625184	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011835	AAAAGG	2	12	1642999	1643010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011835	TATCGT	2	12	1662026	1662037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011835	CGCCTG	2	12	1743388	1743399	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011835	CTTCGC	2	12	1803566	1803577	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011835	TCATGA	2	12	1803838	1803849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011835	GGGGCC	2	12	1804214	1804225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011835	GACATG	2	12	1818374	1818385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_011835	CCCATA	2	12	1836273	1836284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011835	CCTTTG	2	12	1881142	1881153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011835	ATCGAT	2	12	1906946	1906957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011835	CACCGT	2	12	1912528	1912539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011835	CTATAC	2	12	1929658	1929669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.