MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 1186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011835	ACCAC	2	10	1798	1807	40 %	0 %	0 %	60 %	219682500
2	NC_011835	CCGGC	2	10	2815	2824	0 %	0 %	40 %	60 %	219682501
3	NC_011835	CCGTT	2	10	3128	3137	0 %	40 %	20 %	40 %	219682501
4	NC_011835	AACGC	2	10	3346	3355	40 %	0 %	20 %	40 %	219682501
5	NC_011835	CGATC	2	10	5861	5870	20 %	20 %	20 %	40 %	219682504
6	NC_011835	AAGGC	2	10	7675	7684	40 %	0 %	40 %	20 %	219682504
7	NC_011835	GCACG	2	10	14451	14460	20 %	0 %	40 %	40 %	219682509
8	NC_011835	GGTGG	2	10	15096	15105	0 %	20 %	80 %	0 %	219682509
9	NC_011835	GCGAG	2	10	15828	15837	20 %	0 %	60 %	20 %	219682510
10	NC_011835	CGTGC	2	10	15975	15984	0 %	20 %	40 %	40 %	219682510
11	NC_011835	GATTG	2	10	16749	16758	20 %	40 %	40 %	0 %	219682510
12	NC_011835	CGCAC	2	10	24619	24628	20 %	0 %	20 %	60 %	219682517
13	NC_011835	CGACG	2	10	25287	25296	20 %	0 %	40 %	40 %	219682517
14	NC_011835	CGCTG	2	10	25433	25442	0 %	20 %	40 %	40 %	219682517
15	NC_011835	GGGGA	2	10	27113	27122	20 %	0 %	80 %	0 %	219682518
16	NC_011835	GGGAA	2	10	32993	33002	40 %	0 %	60 %	0 %	219682525
17	NC_011835	GATGT	2	10	35063	35072	20 %	40 %	40 %	0 %	219682526
18	NC_011835	TATGC	2	10	38452	38461	20 %	40 %	20 %	20 %	219682528
19	NC_011835	AAAGC	2	10	39701	39710	60 %	0 %	20 %	20 %	219682528
20	NC_011835	CATCA	2	10	40506	40515	40 %	20 %	0 %	40 %	219682529
21	NC_011835	TGCTG	2	10	41096	41105	0 %	40 %	40 %	20 %	219682530
22	NC_011835	GAGAT	2	10	43648	43657	40 %	20 %	40 %	0 %	219682531
23	NC_011835	CAAGC	2	10	44352	44361	40 %	0 %	20 %	40 %	219682532
24	NC_011835	TTCGT	2	10	44864	44873	0 %	60 %	20 %	20 %	219682533
25	NC_011835	CGCCA	2	10	46462	46471	20 %	0 %	20 %	60 %	219682535
26	NC_011835	CTCGG	2	10	48414	48423	0 %	20 %	40 %	40 %	219682536
27	NC_011835	GCCAT	2	10	49114	49123	20 %	20 %	20 %	40 %	219682536
28	NC_011835	GCCCG	2	10	49991	50000	0 %	0 %	40 %	60 %	219682536
29	NC_011835	CGGTC	2	10	52574	52583	0 %	20 %	40 %	40 %	219682538
30	NC_011835	GCACG	2	10	53375	53384	20 %	0 %	40 %	40 %	219682538
31	NC_011835	ATTCA	2	10	55801	55810	40 %	40 %	0 %	20 %	219682540
32	NC_011835	TCCGC	2	10	56022	56031	0 %	20 %	20 %	60 %	219682540
33	NC_011835	TGAAT	2	10	56857	56866	40 %	40 %	20 %	0 %	219682540
34	NC_011835	GGATC	2	10	57513	57522	20 %	20 %	40 %	20 %	219682540
35	NC_011835	ATCGC	2	10	66830	66839	20 %	20 %	20 %	40 %	219682550
36	NC_011835	TGGGG	2	10	67529	67538	0 %	20 %	80 %	0 %	219682551
37	NC_011835	GGCGC	2	10	70029	70038	0 %	0 %	60 %	40 %	219682552
38	NC_011835	GCTCG	2	10	73193	73202	0 %	20 %	40 %	40 %	219682554
39	NC_011835	GCTGA	2	10	75356	75365	20 %	20 %	40 %	20 %	219682556
40	NC_011835	CATCG	2	10	77156	77165	20 %	20 %	20 %	40 %	219682556
41	NC_011835	CGGTC	2	10	79764	79773	0 %	20 %	40 %	40 %	219682558
42	NC_011835	GCACG	2	10	80565	80574	20 %	0 %	40 %	40 %	219682558
43	NC_011835	CGGTG	2	10	81155	81164	0 %	20 %	60 %	20 %	219682559
44	NC_011835	TCATT	2	10	82071	82080	20 %	60 %	0 %	20 %	219682559
45	NC_011835	CCAAA	2	10	82554	82563	60 %	0 %	0 %	40 %	219682560
46	NC_011835	CCGGG	2	10	83047	83056	0 %	0 %	60 %	40 %	219682561
47	NC_011835	CGAAC	2	10	89838	89847	40 %	0 %	20 %	40 %	219682566
48	NC_011835	GCTCG	2	10	91319	91328	0 %	20 %	40 %	40 %	219682568
49	NC_011835	GGTGC	2	10	96600	96609	0 %	20 %	60 %	20 %	219682572
50	NC_011835	GTCTT	2	10	103066	103075	0 %	60 %	20 %	20 %	219682577
51	NC_011835	GCGCC	2	10	107385	107394	0 %	0 %	40 %	60 %	219682579
52	NC_011835	GCCGC	2	10	108341	108350	0 %	0 %	40 %	60 %	219682580
53	NC_011835	CGGCG	2	10	115488	115497	0 %	0 %	60 %	40 %	219682586
54	NC_011835	TGGCG	2	10	115512	115521	0 %	20 %	60 %	20 %	219682586
55	NC_011835	ACGGC	2	10	115604	115613	20 %	0 %	40 %	40 %	219682586
56	NC_011835	GACGA	2	10	115660	115669	40 %	0 %	40 %	20 %	219682586
57	NC_011835	CCGAG	2	10	115886	115895	20 %	0 %	40 %	40 %	219682586
58	NC_011835	CGATT	2	10	116121	116130	20 %	40 %	20 %	20 %	219682586
59	NC_011835	ACCTG	2	10	117342	117351	20 %	20 %	20 %	40 %	219682587
60	NC_011835	GCCCG	2	10	118049	118058	0 %	0 %	40 %	60 %	219682587
61	NC_011835	AGTCG	2	10	118397	118406	20 %	20 %	40 %	20 %	219682587
62	NC_011835	TGGTG	2	10	122292	122301	0 %	40 %	60 %	0 %	219682590
63	NC_011835	GTTCG	2	10	124408	124417	0 %	40 %	40 %	20 %	219682592
64	NC_011835	TCGAA	2	10	126039	126048	40 %	20 %	20 %	20 %	219682593
65	NC_011835	TGGCA	2	10	128525	128534	20 %	20 %	40 %	20 %	219682599
66	NC_011835	GCCGA	2	10	128564	128573	20 %	0 %	40 %	40 %	219682599
67	NC_011835	TCGCG	2	10	129464	129473	0 %	20 %	40 %	40 %	219682600
68	NC_011835	GCGCC	2	10	133832	133841	0 %	0 %	40 %	60 %	219682604
69	NC_011835	CGCAT	2	10	135672	135681	20 %	20 %	20 %	40 %	219682607
70	NC_011835	TGCTC	2	10	139625	139634	0 %	40 %	20 %	40 %	219682612
71	NC_011835	CGGCT	2	10	141484	141493	0 %	20 %	40 %	40 %	219682614
72	NC_011835	CAAGA	2	10	148080	148089	60 %	0 %	20 %	20 %	219682619
73	NC_011835	GACAA	2	10	150304	150313	60 %	0 %	20 %	20 %	219682621
74	NC_011835	CCCGA	2	10	150481	150490	20 %	0 %	20 %	60 %	219682621
75	NC_011835	CGACG	2	10	152960	152969	20 %	0 %	40 %	40 %	219682623
76	NC_011835	GCACC	2	10	156394	156403	20 %	0 %	20 %	60 %	219682625
77	NC_011835	GCTCG	2	10	157299	157308	0 %	20 %	40 %	40 %	219682626
78	NC_011835	CGGCA	2	10	157959	157968	20 %	0 %	40 %	40 %	219682626
79	NC_011835	CGACC	2	10	159028	159037	20 %	0 %	20 %	60 %	219682627
80	NC_011835	GCTCG	2	10	159348	159357	0 %	20 %	40 %	40 %	219682628
81	NC_011835	CACCG	2	10	162042	162051	20 %	0 %	20 %	60 %	219682630
82	NC_011835	TGGCA	2	10	162684	162693	20 %	20 %	40 %	20 %	219682630
83	NC_011835	GCGCC	2	10	165285	165294	0 %	0 %	40 %	60 %	219682633
84	NC_011835	CCGCG	2	10	165969	165978	0 %	0 %	40 %	60 %	219682633
85	NC_011835	TGCCG	2	10	174452	174461	0 %	20 %	40 %	40 %	219682638
86	NC_011835	TGCCC	2	10	177222	177231	0 %	20 %	20 %	60 %	219682641
87	NC_011835	TGCGC	2	10	178234	178243	0 %	20 %	40 %	40 %	219682642
88	NC_011835	GCGTG	2	10	178847	178856	0 %	20 %	60 %	20 %	219682643
89	NC_011835	CCACG	2	10	179753	179762	20 %	0 %	20 %	60 %	219682643
90	NC_011835	CTCGC	2	10	184534	184543	0 %	20 %	20 %	60 %	219682647
91	NC_011835	CGCCA	2	10	186142	186151	20 %	0 %	20 %	60 %	219682648
92	NC_011835	CGTGG	2	10	186833	186842	0 %	20 %	60 %	20 %	219682648
93	NC_011835	TCGCC	2	10	188874	188883	0 %	20 %	20 %	60 %	219682649
94	NC_011835	CAGCG	2	10	193222	193231	20 %	0 %	40 %	40 %	219682651
95	NC_011835	ATGGC	2	10	193443	193452	20 %	20 %	40 %	20 %	219682651
96	NC_011835	GCTCG	2	10	193781	193790	0 %	20 %	40 %	40 %	219682652
97	NC_011835	TCGAA	2	10	194941	194950	40 %	20 %	20 %	20 %	219682652
98	NC_011835	GCGAG	2	10	195094	195103	20 %	0 %	60 %	20 %	219682652
99	NC_011835	CGGCG	2	10	196444	196453	0 %	0 %	60 %	40 %	219682653
100	NC_011835	TGCCG	2	10	197021	197030	0 %	20 %	40 %	40 %	219682653
101	NC_011835	TGTGT	2	10	198881	198890	0 %	60 %	40 %	0 %	219682654
102	NC_011835	TGCCC	2	10	198926	198935	0 %	20 %	20 %	60 %	219682654
103	NC_011835	AGCCG	2	10	199276	199285	20 %	0 %	40 %	40 %	219682655
104	NC_011835	GCCGC	2	10	202482	202491	0 %	0 %	40 %	60 %	219682659
105	NC_011835	ACTGC	2	10	203173	203182	20 %	20 %	20 %	40 %	219682659
106	NC_011835	TCGTC	2	10	205710	205719	0 %	40 %	20 %	40 %	219682661
107	NC_011835	GCGTG	2	10	206535	206544	0 %	20 %	60 %	20 %	219682661
108	NC_011835	TCGAC	2	10	207248	207257	20 %	20 %	20 %	40 %	219682662
109	NC_011835	GCCGG	2	10	210197	210206	0 %	0 %	60 %	40 %	219682663
110	NC_011835	CACGC	2	10	213384	213393	20 %	0 %	20 %	60 %	219682666
111	NC_011835	CCGTG	2	10	214022	214031	0 %	20 %	40 %	40 %	219682666
112	NC_011835	CGGAA	2	10	215071	215080	40 %	0 %	40 %	20 %	219682667
113	NC_011835	AAGAC	2	10	221219	221228	60 %	0 %	20 %	20 %	219682672
114	NC_011835	TGGCG	2	10	222076	222085	0 %	20 %	60 %	20 %	219682673
115	NC_011835	GGTGG	2	10	225708	225717	0 %	20 %	80 %	0 %	219682675
116	NC_011835	GCGCA	2	10	227255	227264	20 %	0 %	40 %	40 %	219682677
117	NC_011835	AGCAA	2	10	229525	229534	60 %	0 %	20 %	20 %	219682679
118	NC_011835	CGGCA	2	10	232461	232470	20 %	0 %	40 %	40 %	219682681
119	NC_011835	GCCCG	2	10	233350	233359	0 %	0 %	40 %	60 %	219682682
120	NC_011835	CGTGG	2	10	234040	234049	0 %	20 %	60 %	20 %	219682682
121	NC_011835	TGCTC	2	10	235409	235418	0 %	40 %	20 %	40 %	219682685
122	NC_011835	GGGGC	2	10	235953	235962	0 %	0 %	80 %	20 %	219682685
123	NC_011835	CGTTT	2	10	236342	236351	0 %	60 %	20 %	20 %	219682686
124	NC_011835	CTCAC	2	10	236663	236672	20 %	20 %	0 %	60 %	219682686
125	NC_011835	CTCGA	2	10	237410	237419	20 %	20 %	20 %	40 %	219682687
126	NC_011835	TCCGG	2	10	237465	237474	0 %	20 %	40 %	40 %	219682687
127	NC_011835	GCGCG	2	10	237785	237794	0 %	0 %	60 %	40 %	219682687
128	NC_011835	CTCGA	2	10	238332	238341	20 %	20 %	20 %	40 %	219682687
129	NC_011835	TCGTC	2	10	239242	239251	0 %	40 %	20 %	40 %	219682687
130	NC_011835	ACCCG	2	10	242152	242161	20 %	0 %	20 %	60 %	219682690
131	NC_011835	TCGGC	2	10	243189	243198	0 %	20 %	40 %	40 %	219682691
132	NC_011835	GCGAT	2	10	245202	245211	20 %	20 %	40 %	20 %	219682695
133	NC_011835	GGCGA	2	10	246149	246158	20 %	0 %	60 %	20 %	219682696
134	NC_011835	CCGCA	2	10	247758	247767	20 %	0 %	20 %	60 %	219682696
135	NC_011835	CGGCC	2	10	256172	256181	0 %	0 %	40 %	60 %	219682703
136	NC_011835	GCGCG	2	10	257020	257029	0 %	0 %	60 %	40 %	219682703
137	NC_011835	AGCCA	2	10	260599	260608	40 %	0 %	20 %	40 %	219682706
138	NC_011835	AGGCG	2	10	260777	260786	20 %	0 %	60 %	20 %	219682706
139	NC_011835	CTCGC	2	10	261705	261714	0 %	20 %	20 %	60 %	219682706
140	NC_011835	GGCGA	2	10	261777	261786	20 %	0 %	60 %	20 %	219682706
141	NC_011835	TTCGG	2	10	262242	262251	0 %	40 %	40 %	20 %	219682706
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155	NC_011835	GCTGG	2	10	283917	283926	0 %	20 %	60 %	20 %	219682721
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177	NC_011835	CCGAC	2	10	316938	316947	20 %	0 %	20 %	60 %	219682744
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253	NC_011835	CGCCT	2	10	416190	416199	0 %	20 %	20 %	60 %	219682814
254	NC_011835	GCGCA	2	10	416400	416409	20 %	0 %	40 %	40 %	219682814
255	NC_011835	TTCGA	2	10	417327	417336	20 %	40 %	20 %	20 %	219682814
256	NC_011835	CGACC	2	10	418418	418427	20 %	0 %	20 %	60 %	219682815
257	NC_011835	TGCGA	2	10	419185	419194	20 %	20 %	40 %	20 %	219682816
258	NC_011835	TGCCG	2	10	420878	420887	0 %	20 %	40 %	40 %	219682817
259	NC_011835	AGGCG	2	10	421637	421646	20 %	0 %	60 %	20 %	219682817
260	NC_011835	CGGTG	2	10	422153	422162	0 %	20 %	60 %	20 %	219682817
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