MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. 5A (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011833	AAAGA	2	10	81	90	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011833	TTTAA	2	10	200	209	40 %	60 %	0 %	0 %	219681390
3	NC_011833	ATTTT	2	10	2761	2770	20 %	80 %	0 %	0 %	219681391
4	NC_011833	TTTTA	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	219681391
5	NC_011833	AAAAT	2	10	5470	5479	80 %	20 %	0 %	0 %	219681395
6	NC_011833	ATTAA	2	10	6030	6039	60 %	40 %	0 %	0 %	219681395
7	NC_011833	ATGAA	2	10	7586	7595	60 %	20 %	20 %	0 %	219681397
8	NC_011833	TTTTC	2	10	9692	9701	0 %	80 %	0 %	20 %	219681399
9	NC_011833	TATAT	2	10	9868	9877	40 %	60 %	0 %	0 %	219681399
10	NC_011833	AAAAT	2	10	10594	10603	80 %	20 %	0 %	0 %	219681399
11	NC_011833	TAAGG	2	10	12212	12221	40 %	20 %	40 %	0 %	219681400
12	NC_011833	TTTTC	2	10	12606	12615	0 %	80 %	0 %	20 %	219681401
13	NC_011833	ATTTC	2	10	13392	13401	20 %	60 %	0 %	20 %	219681401
14	NC_011833	ATATA	2	10	14086	14095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011833	TACAA	2	10	14753	14762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011833	TTTCT	2	10	15053	15062	0 %	80 %	0 %	20 %	219681403
17	NC_011833	TTAGT	2	10	15188	15197	20 %	60 %	20 %	0 %	219681403
18	NC_011833	TATCT	2	10	16578	16587	20 %	60 %	0 %	20 %	219681403
19	NC_011833	CAAAA	2	10	17575	17584	80 %	0 %	0 %	20 %	219681404
20	NC_011833	ATTAA	2	10	18310	18319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011833	TTTAT	2	10	20368	20377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011833	TATTT	2	10	20681	20690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011833	TACTT	2	10	20917	20926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011833	AACAA	2	10	21167	21176	80 %	0 %	0 %	20 %	219681407
25	NC_011833	ATTTG	2	10	22976	22985	20 %	60 %	20 %	0 %	219681410
26	NC_011833	ATTTT	2	10	23582	23591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011833	TAAAA	2	10	23695	23704	80 %	20 %	0 %	0 %	219681411
28	NC_011833	TAATT	2	10	24052	24061	40 %	60 %	0 %	0 %	219681411
29	NC_011833	ATACA	2	10	24579	24588	60 %	20 %	0 %	20 %	219681411
30	NC_011833	TTTCT	2	10	27114	27123	0 %	80 %	0 %	20 %	219681413
31	NC_011833	TAAAC	2	10	27911	27920	60 %	20 %	0 %	20 %	219681414
32	NC_011833	AAAAT	2	10	28439	28448	80 %	20 %	0 %	0 %	219681414
33	NC_011833	AAAAT	2	10	29452	29461	80 %	20 %	0 %	0 %	219681415
34	NC_011833	TTTTA	2	10	30720	30729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011833	TTGTA	2	10	30869	30878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011833	TGATA	2	10	30942	30951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011833	TATAA	2	10	33490	33499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011833	ATCCA	2	10	34047	34056	40 %	20 %	0 %	40 %	219681417
39	NC_011833	TAAAT	2	10	34650	34659	60 %	40 %	0 %	0 %	219681417
40	NC_011833	CTTGT	2	10	37397	37406	0 %	60 %	20 %	20 %	219681419
41	NC_011833	AAATA	2	10	38222	38231	80 %	20 %	0 %	0 %	219681419
42	NC_011833	TACAT	2	10	39945	39954	40 %	40 %	0 %	20 %	219681419
43	NC_011833	CTTTG	2	10	40256	40265	0 %	60 %	20 %	20 %	219681419
44	NC_011833	TGATC	2	10	40449	40458	20 %	40 %	20 %	20 %	219681419
45	NC_011833	TGTTT	2	10	41688	41697	0 %	80 %	20 %	0 %	219681420
46	NC_011833	TCCAT	2	10	42224	42233	20 %	40 %	0 %	40 %	219681420
47	NC_011833	ATTTT	2	10	43801	43810	20 %	80 %	0 %	0 %	219681420
48	NC_011833	ATTTT	2	10	44788	44797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011833	TTTAT	2	10	45687	45696	20 %	80 %	0 %	0 %	219681422
50	NC_011833	GTCAT	2	10	46842	46851	20 %	40 %	20 %	20 %	219681424
51	NC_011833	ATAAA	2	10	47849	47858	80 %	20 %	0 %	0 %	219681426
52	NC_011833	TAAAA	2	10	48383	48392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011833	ATTAT	2	10	48890	48899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011833	TTTAA	2	10	49000	49009	40 %	60 %	0 %	0 %	219681427
55	NC_011833	ATATT	2	10	49397	49406	40 %	60 %	0 %	0 %	219681427
56	NC_011833	ATTGT	2	10	49591	49600	20 %	60 %	20 %	0 %	219681427
57	NC_011833	GAGCA	2	10	50694	50703	40 %	0 %	40 %	20 %	219681428
58	NC_011833	ATAAA	2	10	50765	50774	80 %	20 %	0 %	0 %	219681428
59	NC_011833	TTTAA	2	10	51048	51057	40 %	60 %	0 %	0 %	219681429
60	NC_011833	AATAA	2	10	51105	51114	80 %	20 %	0 %	0 %	219681429
61	NC_011833	TGTAA	2	10	52229	52238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011833	ATTGT	2	10	52646	52655	20 %	60 %	20 %	0 %	219681430
63	NC_011833	TAATT	2	10	53903	53912	40 %	60 %	0 %	0 %	219681431
64	NC_011833	GGAAA	2	10	54558	54567	60 %	0 %	40 %	0 %	219681432
65	NC_011833	GGAAT	2	10	54637	54646	40 %	20 %	40 %	0 %	219681432
66	NC_011833	AATTA	2	10	57066	57075	60 %	40 %	0 %	0 %	219681434
67	NC_011833	ATTAA	2	10	57591	57600	60 %	40 %	0 %	0 %	219681435
68	NC_011833	ATCTA	2	10	57815	57824	40 %	40 %	0 %	20 %	219681435
69	NC_011833	GAAAA	2	10	58181	58190	80 %	0 %	20 %	0 %	219681436
70	NC_011833	CTTTA	2	10	58305	58314	20 %	60 %	0 %	20 %	219681436
71	NC_011833	ATTTA	2	10	58823	58832	40 %	60 %	0 %	0 %	219681436
72	NC_011833	TTTAT	2	10	58908	58917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011833	ATATT	2	10	61854	61863	40 %	60 %	0 %	0 %	219681438
74	NC_011833	CAATT	2	10	63574	63583	40 %	40 %	0 %	20 %	219681440
75	NC_011833	TACCG	2	10	64653	64662	20 %	20 %	20 %	40 %	219681441
76	NC_011833	TAATA	2	10	64744	64753	60 %	40 %	0 %	0 %	219681441
77	NC_011833	CATTC	2	10	65349	65358	20 %	40 %	0 %	40 %	219681442
78	NC_011833	AGAAT	2	10	66237	66246	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011833	AATGC	2	10	66868	66877	40 %	20 %	20 %	20 %	219681443
80	NC_011833	ATATT	2	10	66967	66976	40 %	60 %	0 %	0 %	219681443
81	NC_011833	ATTAA	2	10	67395	67404	60 %	40 %	0 %	0 %	219681443
82	NC_011833	ATTTT	2	10	68362	68371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011833	AGAAA	2	10	68897	68906	80 %	0 %	20 %	0 %	219681445
84	NC_011833	ATCCC	2	10	69119	69128	20 %	20 %	0 %	60 %	219681446
85	NC_011833	AAATC	2	10	69266	69275	60 %	20 %	0 %	20 %	219681446
86	NC_011833	CATAT	2	10	72028	72037	40 %	40 %	0 %	20 %	219681448
87	NC_011833	ATTAA	2	10	72229	72238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011833	TAAAT	2	10	72997	73006	60 %	40 %	0 %	0 %	219681449
89	NC_011833	ATGTT	2	10	75032	75041	20 %	60 %	20 %	0 %	219681450
90	NC_011833	GAAAA	2	10	75754	75763	80 %	0 %	20 %	0 %	219681450
91	NC_011833	TTTTA	2	10	75927	75936	20 %	80 %	0 %	0 %	219681450
92	NC_011833	GAAAA	2	10	76118	76127	80 %	0 %	20 %	0 %	219681450
93	NC_011833	GCATG	2	10	76380	76389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011833	AAATT	2	10	76763	76772	60 %	40 %	0 %	0 %	219681451
95	NC_011833	AATAC	2	10	78525	78534	60 %	20 %	0 %	20 %	219681452
96	NC_011833	TAAAT	2	10	79961	79970	60 %	40 %	0 %	0 %	219681454
97	NC_011833	GCTAT	2	10	81183	81192	20 %	40 %	20 %	20 %	219681455
98	NC_011833	GATAT	2	10	81737	81746	40 %	40 %	20 %	0 %	219681456
99	NC_011833	ATAAA	2	10	82489	82498	80 %	20 %	0 %	0 %	219681457
100	NC_011833	AATTA	2	10	83159	83168	60 %	40 %	0 %	0 %	219681457
101	NC_011833	TTAAT	2	10	83623	83632	40 %	60 %	0 %	0 %	219681458
102	NC_011833	CAAAT	2	10	85402	85411	60 %	20 %	0 %	20 %	219681460
103	NC_011833	TTAAA	2	10	87596	87605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011833	AATAT	2	10	87707	87716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011833	TAATA	2	10	87739	87748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011833	TCAAA	2	10	88552	88561	60 %	20 %	0 %	20 %	219681465
107	NC_011833	TTAAA	2	10	89006	89015	60 %	40 %	0 %	0 %	219681465
108	NC_011833	TTTAC	2	10	89077	89086	20 %	60 %	0 %	20 %	219681465
109	NC_011833	TAAAA	2	10	90417	90426	80 %	20 %	0 %	0 %	219681465
110	NC_011833	AAATT	2	10	90718	90727	60 %	40 %	0 %	0 %	219681465
111	NC_011833	AATAT	2	10	91531	91540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011833	CCATG	2	10	93144	93153	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011833	GCAAT	2	10	94976	94985	40 %	20 %	20 %	20 %	219681468
114	NC_011833	GAATT	2	10	95108	95117	40 %	40 %	20 %	0 %	219681468
115	NC_011833	AGATC	2	10	96039	96048	40 %	20 %	20 %	20 %	219681469
116	NC_011833	ATATT	2	10	96535	96544	40 %	60 %	0 %	0 %	219681469
117	NC_011833	GATAT	2	10	97268	97277	40 %	40 %	20 %	0 %	219681470
118	NC_011833	TTTTA	2	10	100829	100838	20 %	80 %	0 %	0 %	219681472
119	NC_011833	AATAT	2	10	101426	101435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011833	AATTA	2	10	101801	101810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011833	CAGAA	2	10	102447	102456	60 %	0 %	20 %	20 %	219681473
122	NC_011833	TAAAT	2	10	103225	103234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011833	TATTT	2	10	103320	103329	20 %	80 %	0 %	0 %	219681474
124	NC_011833	TATTT	2	10	103916	103925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011833	GAATT	2	10	106641	106650	40 %	40 %	20 %	0 %	219681477
126	NC_011833	TAAAA	2	10	107795	107804	80 %	20 %	0 %	0 %	219681478
127	NC_011833	TAAAA	2	10	107894	107903	80 %	20 %	0 %	0 %	219681478
128	NC_011833	ATTTT	2	10	108952	108961	20 %	80 %	0 %	0 %	219681479
129	NC_011833	TAATT	2	10	110182	110191	40 %	60 %	0 %	0 %	219681481
130	NC_011833	ATTAT	2	10	110509	110518	40 %	60 %	0 %	0 %	219681481
131	NC_011833	ATTTA	2	10	111146	111155	40 %	60 %	0 %	0 %	219681482
132	NC_011833	TTTTA	2	10	111497	111506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011833	TGTTT	2	10	116728	116737	0 %	80 %	20 %	0 %	219681486
134	NC_011833	AGTAA	2	10	116819	116828	60 %	20 %	20 %	0 %	219681486
135	NC_011833	TAATT	2	10	116992	117001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011833	ATATA	2	10	117138	117147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011833	GAAAA	2	10	117250	117259	80 %	0 %	20 %	0 %	219681487
138	NC_011833	TATTT	2	10	117879	117888	20 %	80 %	0 %	0 %	219681488
139	NC_011833	ATTTA	2	10	118070	118079	40 %	60 %	0 %	0 %	219681488
140	NC_011833	TAAAA	2	10	119609	119618	80 %	20 %	0 %	0 %	219681490
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