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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 1321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011832	ATCT	2	8	60	67	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011832	ATCG	2	8	334	341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011832	CTCC	2	8	9489	9496	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_011832	CTAT	2	8	13454	13461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011832	CTTT	2	8	13536	13543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011832	CCAG	2	8	35136	35143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011832	CGAT	2	8	43303	43310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011832	ATCG	2	8	44589	44596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011832	CGTC	2	8	54439	54446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011832	GGAT	2	8	63056	63063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011832	GATG	2	8	64583	64590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011832	GGCA	2	8	64648	64655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011832	GCCG	2	8	65916	65923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011832	CAGG	2	8	66192	66199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011832	ATCG	2	8	66898	66905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011832	CTAT	2	8	67023	67030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011832	CAGA	2	8	68779	68786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011832	GACC	2	8	69002	69009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011832	AATT	2	8	81574	81581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011832	GATC	2	8	91386	91393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011832	CGAA	2	8	93910	93917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011832	GTCT	2	8	97722	97729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011832	ATAA	2	8	98643	98650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011832	ACCC	2	8	107543	107550	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_011832	CCAT	2	8	109046	109053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011832	TGGT	2	8	109073	109080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011832	GGGC	2	8	109253	109260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011832	CTCG	2	8	109669	109676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011832	GGCC	2	8	109741	109748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011832	CCGC	2	8	109821	109828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_011832	GCCG	2	8	109981	109988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011832	CGAT	2	8	110129	110136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011832	GATC	2	8	110355	110362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011832	CCGG	2	8	110602	110609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011832	TCAT	2	8	111020	111027	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011832	CGGC	2	8	116643	116650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011832	GAAT	2	8	125119	125126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011832	GTAT	2	8	127258	127265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011832	TTTC	2	8	133945	133952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011832	CAGA	2	8	139972	139979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011832	GTTC	2	8	139990	139997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011832	GAAA	2	8	153767	153774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011832	TGCA	2	8	157654	157661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011832	TGAT	2	8	172506	172513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011832	ATCA	2	8	177949	177956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011832	AATA	2	8	185717	185724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011832	CATT	2	8	192813	192820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011832	AAAG	2	8	197241	197248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011832	CCGT	2	8	199598	199605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011832	TCGG	2	8	199841	199848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011832	GCCG	2	8	203765	203772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011832	GCCA	2	8	203804	203811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011832	GTCG	2	8	205060	205067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011832	TATC	2	8	205464	205471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011832	AGGA	2	8	209164	209171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011832	TTCG	2	8	219683	219690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011832	CATC	2	8	219755	219762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011832	TGGC	2	8	219844	219851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011832	GCGA	2	8	219994	220001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011832	CGAC	2	8	220024	220031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011832	TATT	2	8	221527	221534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011832	GAAG	2	8	224331	224338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011832	GAGG	2	8	225329	225336	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011832	CCTA	2	8	229058	229065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011832	ACCC	2	8	229100	229107	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_011832	TGAA	2	8	232687	232694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011832	TCCT	2	8	233439	233446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011832	GGGT	2	8	238794	238801	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011832	GGAT	2	8	241076	241083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011832	ACCT	2	8	242098	242105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011832	TTTG	2	8	243200	243207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011832	TAAT	2	8	243651	243658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011832	TCAT	2	8	258017	258024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011832	GATT	2	8	258037	258044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011832	TTCC	2	8	258485	258492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011832	CCGG	2	8	262726	262733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011832	TTTC	2	8	262737	262744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011832	ATGG	2	8	264025	264032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011832	CTAT	2	8	264073	264080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011832	CGAT	2	8	264574	264581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011832	CGCT	2	8	264679	264686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011832	TCAG	2	8	265501	265508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011832	AAAT	2	8	276541	276548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011832	AAAT	2	8	276573	276580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011832	CTGG	2	8	286124	286131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011832	GATA	2	8	299851	299858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011832	ATCT	2	8	299982	299989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011832	CCTG	2	8	300159	300166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011832	TCTG	2	8	303695	303702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011832	ATCT	2	8	307673	307680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011832	ATCT	2	8	308962	308969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011832	ATTG	2	8	311225	311232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011832	TGCT	2	8	315915	315922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011832	TAAT	2	8	315941	315948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011832	GATC	2	8	329093	329100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011832	AGGG	2	8	330997	331004	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011832	ACTT	2	8	331032	331039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011832	CTGG	2	8	331980	331987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011832	GCAC	2	8	334174	334181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011832	GAAT	2	8	334388	334395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011832	ATCG	2	8	339538	339545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011832	TGGG	2	8	346970	346977	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011832	ATTC	2	8	347105	347112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011832	TCTT	2	8	347784	347791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011832	CAGT	2	8	348723	348730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011832	TTGA	2	8	352405	352412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011832	AAAT	2	8	352526	352533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011832	AAAT	2	8	353626	353633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011832	CAAT	2	8	355547	355554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011832	ATCT	2	8	366030	366037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011832	TCCC	2	8	367797	367804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_011832	TTAT	2	8	367845	367852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011832	CGAT	2	8	367944	367951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011832	GAAA	2	8	372963	372970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011832	ATTC	2	8	380073	380080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011832	ATCC	2	8	380221	380228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011832	ATCG	2	8	380322	380329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011832	AAAT	2	8	381033	381040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011832	TTAA	2	8	381100	381107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011832	AATG	2	8	382425	382432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011832	ATTG	2	8	382502	382509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011832	AATA	2	8	384552	384559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011832	AACC	2	8	384567	384574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011832	AAGA	2	8	384651	384658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011832	GAAT	2	8	384747	384754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011832	ACAA	2	8	386982	386989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011832	CGAT	2	8	390105	390112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011832	GGAT	2	8	390206	390213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011832	AGAA	2	8	394895	394902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011832	AATA	2	8	400253	400260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011832	CAAA	2	8	400641	400648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011832	AACG	2	8	409633	409640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011832	CTTC	2	8	413193	413200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011832	TAAA	2	8	413813	413820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011832	ATCC	2	8	425416	425423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011832	AAAG	2	8	425559	425566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011832	AATT	2	8	433884	433891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011832	ATCA	2	8	452540	452547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011832	TCGA	2	8	453814	453821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011832	GATC	2	8	456679	456686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011832	ATTG	2	8	457642	457649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011832	GTTC	2	8	457814	457821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011832	GTGG	2	8	459057	459064	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011832	AGGA	2	8	459169	459176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011832	GATT	2	8	459309	459316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011832	CAGA	2	8	475180	475187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011832	TCGA	2	8	482240	482247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011832	AATA	2	8	486013	486020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011832	CGCT	2	8	488209	488216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011832	GGCT	3	12	488258	488269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011832	TTCG	2	8	488279	488286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011832	GATC	2	8	488359	488366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_011832	ATGT	2	8	506102	506109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011832	GATC	2	8	506166	506173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_011832	ATCA	2	8	543011	543018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_011832	AGCC	2	8	1143284	1143291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
480	NC_011832	ATCG	2	8	1144174	1144181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
481	NC_011832	CCAT	2	8	1144426	1144433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_011832	AGGA	2	8	1144493	1144500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_011832	CGGC	2	8	1144635	1144642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_011832	TAAA	2	8	1144834	1144841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_011832	GAGT	2	8	1146939	1146946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_011832	GGCA	2	8	1147234	1147241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_011832	GCCG	3	12	1147307	1147318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_011832	CCAC	2	8	1147371	1147378	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
489	NC_011832	TCAT	2	8	1150135	1150142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_011832	ACCT	2	8	1150180	1150187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_011832	CGAA	2	8	1150519	1150526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_011832	AGGG	2	8	1150568	1150575	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
493	NC_011832	GCCG	2	8	1151251	1151258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
494	NC_011832	AACC	2	8	1151780	1151787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_011832	TCAA	2	8	1154103	1154110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_011832	CATT	2	8	1155114	1155121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
497	NC_011832	ATTC	2	8	1155199	1155206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
498	NC_011832	GGAT	2	8	1158803	1158810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_011832	TGAT	2	8	1166702	1166709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011832	TCAA	2	8	1179212	1179219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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