MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 6652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011832	CTGA	2	8	463	470	25 %	25 %	25 %	25 %	219850688
2	NC_011832	CCCT	2	8	577	584	0 %	25 %	0 %	75 %	219850688
3	NC_011832	ACGC	2	8	1217	1224	25 %	0 %	25 %	50 %	219850688
4	NC_011832	GGAC	2	8	1573	1580	25 %	0 %	50 %	25 %	219850688
5	NC_011832	CAGA	2	8	1716	1723	50 %	0 %	25 %	25 %	219850689
6	NC_011832	TCGA	2	8	2367	2374	25 %	25 %	25 %	25 %	219850690
7	NC_011832	CGGT	2	8	2863	2870	0 %	25 %	50 %	25 %	219850690
8	NC_011832	CTGG	2	8	2926	2933	0 %	25 %	50 %	25 %	219850690
9	NC_011832	AGGA	2	8	3554	3561	50 %	0 %	50 %	0 %	219850691
10	NC_011832	CTGA	2	8	3600	3607	25 %	25 %	25 %	25 %	219850691
11	NC_011832	GCCT	2	8	3958	3965	0 %	25 %	25 %	50 %	219850691
12	NC_011832	GCCG	2	8	5211	5218	0 %	0 %	50 %	50 %	219850692
13	NC_011832	GGCC	2	8	5276	5283	0 %	0 %	50 %	50 %	219850692
14	NC_011832	TTCC	2	8	5301	5308	0 %	50 %	0 %	50 %	219850692
15	NC_011832	TCGA	2	8	5495	5502	25 %	25 %	25 %	25 %	219850692
16	NC_011832	GGGT	2	8	5795	5802	0 %	25 %	75 %	0 %	219850693
17	NC_011832	GAAC	2	8	6017	6024	50 %	0 %	25 %	25 %	219850693
18	NC_011832	CGAT	2	8	6150	6157	25 %	25 %	25 %	25 %	219850694
19	NC_011832	GGCG	2	8	6798	6805	0 %	0 %	75 %	25 %	219850695
20	NC_011832	CGAC	2	8	6822	6829	25 %	0 %	25 %	50 %	219850695
21	NC_011832	GCCC	2	8	8381	8388	0 %	0 %	25 %	75 %	219850696
22	NC_011832	CGCT	2	8	8571	8578	0 %	25 %	25 %	50 %	219850696
23	NC_011832	GGCC	2	8	8585	8592	0 %	0 %	50 %	50 %	219850696
24	NC_011832	GCCC	2	8	9929	9936	0 %	0 %	25 %	75 %	219850698
25	NC_011832	CTGG	2	8	9973	9980	0 %	25 %	50 %	25 %	219850698
26	NC_011832	TGGC	2	8	10131	10138	0 %	25 %	50 %	25 %	219850698
27	NC_011832	CTTC	2	8	10324	10331	0 %	50 %	0 %	50 %	219850698
28	NC_011832	GGGA	2	8	10443	10450	25 %	0 %	75 %	0 %	219850698
29	NC_011832	CGCT	2	8	10817	10824	0 %	25 %	25 %	50 %	219850698
30	NC_011832	GATC	2	8	11076	11083	25 %	25 %	25 %	25 %	219850698
31	NC_011832	CCAG	2	8	11671	11678	25 %	0 %	25 %	50 %	219850700
32	NC_011832	TCCC	2	8	11862	11869	0 %	25 %	0 %	75 %	219850700
33	NC_011832	CGCT	2	8	11915	11922	0 %	25 %	25 %	50 %	219850700
34	NC_011832	CGCA	2	8	14066	14073	25 %	0 %	25 %	50 %	219850702
35	NC_011832	TCCC	2	8	14734	14741	0 %	25 %	0 %	75 %	219850702
36	NC_011832	GATC	2	8	15827	15834	25 %	25 %	25 %	25 %	219850704
37	NC_011832	GGAT	2	8	15876	15883	25 %	25 %	50 %	0 %	219850704
38	NC_011832	TTCT	2	8	16381	16388	0 %	75 %	0 %	25 %	219850705
39	NC_011832	GTCG	2	8	16471	16478	0 %	25 %	50 %	25 %	219850705
40	NC_011832	TCGA	2	8	16745	16752	25 %	25 %	25 %	25 %	219850705
41	NC_011832	CTGC	2	8	17418	17425	0 %	25 %	25 %	50 %	219850705
42	NC_011832	CTCC	2	8	17583	17590	0 %	25 %	0 %	75 %	219850705
43	NC_011832	CTCC	2	8	17671	17678	0 %	25 %	0 %	75 %	219850705
44	NC_011832	TGCC	2	8	18073	18080	0 %	25 %	25 %	50 %	219850705
45	NC_011832	GGGA	2	8	18107	18114	25 %	0 %	75 %	0 %	219850705
46	NC_011832	GGAG	2	8	18150	18157	25 %	0 %	75 %	0 %	219850705
47	NC_011832	CCAG	2	8	19724	19731	25 %	0 %	25 %	50 %	219850706
48	NC_011832	TTCT	2	8	19771	19778	0 %	75 %	0 %	25 %	219850706
49	NC_011832	GGCC	2	8	19892	19899	0 %	0 %	50 %	50 %	219850706
50	NC_011832	TTCA	2	8	20264	20271	25 %	50 %	0 %	25 %	219850707
51	NC_011832	GCTG	2	8	20681	20688	0 %	25 %	50 %	25 %	219850708
52	NC_011832	GTTG	2	8	20888	20895	0 %	50 %	50 %	0 %	219850708
53	NC_011832	TGGG	2	8	21012	21019	0 %	25 %	75 %	0 %	219850708
54	NC_011832	ATCG	2	8	21563	21570	25 %	25 %	25 %	25 %	219850708
55	NC_011832	CTGG	2	8	21635	21642	0 %	25 %	50 %	25 %	219850708
56	NC_011832	ATGG	2	8	21819	21826	25 %	25 %	50 %	0 %	219850708
57	NC_011832	ATCG	2	8	21946	21953	25 %	25 %	25 %	25 %	219850709
58	NC_011832	GGAT	2	8	22547	22554	25 %	25 %	50 %	0 %	219850709
59	NC_011832	CGTC	2	8	22733	22740	0 %	25 %	25 %	50 %	219850709
60	NC_011832	GCCA	2	8	23159	23166	25 %	0 %	25 %	50 %	219850710
61	NC_011832	TCCT	2	8	24022	24029	0 %	50 %	0 %	50 %	219850711
62	NC_011832	TGGA	2	8	24148	24155	25 %	25 %	50 %	0 %	219850711
63	NC_011832	GTTC	2	8	24516	24523	0 %	50 %	25 %	25 %	219850711
64	NC_011832	CACT	2	8	25164	25171	25 %	25 %	0 %	50 %	219850713
65	NC_011832	GGCC	2	8	25358	25365	0 %	0 %	50 %	50 %	219850713
66	NC_011832	GAGC	2	8	25397	25404	25 %	0 %	50 %	25 %	219850713
67	NC_011832	CAGT	2	8	25753	25760	25 %	25 %	25 %	25 %	219850713
68	NC_011832	CGAA	2	8	26480	26487	50 %	0 %	25 %	25 %	219850715
69	NC_011832	TGGG	2	8	26666	26673	0 %	25 %	75 %	0 %	219850715
70	NC_011832	GCAG	2	8	28214	28221	25 %	0 %	50 %	25 %	219850717
71	NC_011832	GCCC	2	8	28432	28439	0 %	0 %	25 %	75 %	219850717
72	NC_011832	TGGT	2	8	28542	28549	0 %	50 %	50 %	0 %	219850717
73	NC_011832	CAGG	2	8	28611	28618	25 %	0 %	50 %	25 %	219850717
74	NC_011832	TCGC	2	8	28824	28831	0 %	25 %	25 %	50 %	219850717
75	NC_011832	AGGT	2	8	29202	29209	25 %	25 %	50 %	0 %	219850717
76	NC_011832	CGAT	2	8	29455	29462	25 %	25 %	25 %	25 %	219850718
77	NC_011832	TCGA	2	8	29859	29866	25 %	25 %	25 %	25 %	219850718
78	NC_011832	ACGC	2	8	30093	30100	25 %	0 %	25 %	50 %	219850718
79	NC_011832	CGAT	2	8	30112	30119	25 %	25 %	25 %	25 %	219850718
80	NC_011832	AAGG	2	8	30314	30321	50 %	0 %	50 %	0 %	219850719
81	NC_011832	TCGA	2	8	31271	31278	25 %	25 %	25 %	25 %	219850719
82	NC_011832	TTCC	2	8	32149	32156	0 %	50 %	0 %	50 %	219850720
83	NC_011832	AGAT	2	8	32756	32763	50 %	25 %	25 %	0 %	219850721
84	NC_011832	CGGT	2	8	32814	32821	0 %	25 %	50 %	25 %	219850721
85	NC_011832	TCCC	2	8	33127	33134	0 %	25 %	0 %	75 %	219850722
86	NC_011832	CCCT	2	8	33490	33497	0 %	25 %	0 %	75 %	219850722
87	NC_011832	CGAT	2	8	33528	33535	25 %	25 %	25 %	25 %	219850722
88	NC_011832	GACC	2	8	34797	34804	25 %	0 %	25 %	50 %	219850723
89	NC_011832	TCCC	2	8	34938	34945	0 %	25 %	0 %	75 %	219850723
90	NC_011832	CGCC	2	8	35021	35028	0 %	0 %	25 %	75 %	219850723
91	NC_011832	TCAT	2	8	35086	35093	25 %	50 %	0 %	25 %	219850723
92	NC_011832	GGCC	2	8	35966	35973	0 %	0 %	50 %	50 %	219850724
93	NC_011832	CTCG	2	8	36730	36737	0 %	25 %	25 %	50 %	219850725
94	NC_011832	CCCT	2	8	37618	37625	0 %	25 %	0 %	75 %	219850725
95	NC_011832	GGCC	2	8	37817	37824	0 %	0 %	50 %	50 %	219850726
96	NC_011832	CCGA	2	8	39209	39216	25 %	0 %	25 %	50 %	219850727
97	NC_011832	AGAA	2	8	39329	39336	75 %	0 %	25 %	0 %	219850727
98	NC_011832	ACCA	2	8	39872	39879	50 %	0 %	0 %	50 %	219850727
99	NC_011832	CCAA	2	8	39914	39921	50 %	0 %	0 %	50 %	219850727
100	NC_011832	CCTG	2	8	40024	40031	0 %	25 %	25 %	50 %	219850727
101	NC_011832	GGCC	2	8	40670	40677	0 %	0 %	50 %	50 %	219850728
102	NC_011832	GATC	2	8	40975	40982	25 %	25 %	25 %	25 %	219850729
103	NC_011832	GGTC	2	8	41440	41447	0 %	25 %	50 %	25 %	219850730
104	NC_011832	TCCT	2	8	41725	41732	0 %	50 %	0 %	50 %	219850731
105	NC_011832	GTCT	2	8	41824	41831	0 %	50 %	25 %	25 %	219850731
106	NC_011832	CGAT	2	8	41903	41910	25 %	25 %	25 %	25 %	219850731
107	NC_011832	ACGA	2	8	44745	44752	50 %	0 %	25 %	25 %	219850732
108	NC_011832	GATG	2	8	45404	45411	25 %	25 %	50 %	0 %	219850733
109	NC_011832	CGGG	2	8	45473	45480	0 %	0 %	75 %	25 %	219850733
110	NC_011832	GATG	2	8	45665	45672	25 %	25 %	50 %	0 %	219850733
111	NC_011832	TCTG	2	8	45842	45849	0 %	50 %	25 %	25 %	219850733
112	NC_011832	AGGC	2	8	45987	45994	25 %	0 %	50 %	25 %	219850733
113	NC_011832	AGGG	2	8	46080	46087	25 %	0 %	75 %	0 %	219850733
114	NC_011832	TCTG	2	8	46157	46164	0 %	50 %	25 %	25 %	219850733
115	NC_011832	CCAT	2	8	46552	46559	25 %	25 %	0 %	50 %	219850733
116	NC_011832	GTCA	2	8	48072	48079	25 %	25 %	25 %	25 %	219850733
117	NC_011832	CGGC	2	8	48364	48371	0 %	0 %	50 %	50 %	219850734
118	NC_011832	ATCT	2	8	48402	48409	25 %	50 %	0 %	25 %	219850734
119	NC_011832	AGGG	2	8	48885	48892	25 %	0 %	75 %	0 %	219850734
120	NC_011832	ATCG	2	8	49433	49440	25 %	25 %	25 %	25 %	219850735
121	NC_011832	CAGG	2	8	49649	49656	25 %	0 %	50 %	25 %	219850735
122	NC_011832	GATG	2	8	49924	49931	25 %	25 %	50 %	0 %	219850735
123	NC_011832	CAGG	2	8	50132	50139	25 %	0 %	50 %	25 %	219850735
124	NC_011832	TCAC	2	8	51233	51240	25 %	25 %	0 %	50 %	219850735
125	NC_011832	GGCA	2	8	51398	51405	25 %	0 %	50 %	25 %	219850735
126	NC_011832	CCGA	2	8	52940	52947	25 %	0 %	25 %	50 %	219850736
127	NC_011832	GGGA	2	8	53171	53178	25 %	0 %	75 %	0 %	219850736
128	NC_011832	GATC	2	8	55721	55728	25 %	25 %	25 %	25 %	219850738
129	NC_011832	CCAT	2	8	55765	55772	25 %	25 %	0 %	50 %	219850738
130	NC_011832	AGGA	2	8	56025	56032	50 %	0 %	50 %	0 %	219850738
131	NC_011832	GACA	2	8	56159	56166	50 %	0 %	25 %	25 %	219850738
132	NC_011832	AGGA	2	8	56354	56361	50 %	0 %	50 %	0 %	219850738
133	NC_011832	GATC	2	8	56750	56757	25 %	25 %	25 %	25 %	219850738
134	NC_011832	TCCC	2	8	56851	56858	0 %	25 %	0 %	75 %	219850738
135	NC_011832	ACTG	2	8	57459	57466	25 %	25 %	25 %	25 %	219850738
136	NC_011832	GAAG	2	8	57509	57516	50 %	0 %	50 %	0 %	219850738
137	NC_011832	GCGG	2	8	58419	58426	0 %	0 %	75 %	25 %	219850739
138	NC_011832	CAGC	2	8	59111	59118	25 %	0 %	25 %	50 %	219850740
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