MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 4506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011832	TA	3	6	253	258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011832	GA	3	6	778	783	50 %	0 %	50 %	0 %	219850688
3	NC_011832	CG	3	6	2529	2534	0 %	0 %	50 %	50 %	219850690
4	NC_011832	TC	3	6	3699	3704	0 %	50 %	0 %	50 %	219850691
5	NC_011832	CT	3	6	3900	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	219850691
6	NC_011832	TC	3	6	4013	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	219850691
7	NC_011832	TC	4	8	4595	4602	0 %	50 %	0 %	50 %	219850691
8	NC_011832	TC	3	6	5396	5401	0 %	50 %	0 %	50 %	219850692
9	NC_011832	TA	3	6	5574	5579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011832	AG	3	6	5996	6001	50 %	0 %	50 %	0 %	219850693
11	NC_011832	CT	3	6	6877	6882	0 %	50 %	0 %	50 %	219850695
12	NC_011832	CT	3	6	7004	7009	0 %	50 %	0 %	50 %	219850695
13	NC_011832	CT	3	6	7013	7018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011832	TA	3	6	9454	9459	50 %	50 %	0 %	0 %	219850697
15	NC_011832	GA	5	10	9605	9614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011832	GC	3	6	10008	10013	0 %	0 %	50 %	50 %	219850698
17	NC_011832	CG	3	6	10677	10682	0 %	0 %	50 %	50 %	219850698
18	NC_011832	TC	3	6	12478	12483	0 %	50 %	0 %	50 %	219850700
19	NC_011832	AG	3	6	13023	13028	50 %	0 %	50 %	0 %	219850700
20	NC_011832	TG	3	6	13260	13265	0 %	50 %	50 %	0 %	219850701
21	NC_011832	CT	3	6	13544	13549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011832	AT	4	8	13639	13646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011832	CT	3	6	14378	14383	0 %	50 %	0 %	50 %	219850702
24	NC_011832	GC	3	6	14542	14547	0 %	0 %	50 %	50 %	219850702
25	NC_011832	AG	3	6	14655	14660	50 %	0 %	50 %	0 %	219850702
26	NC_011832	CT	3	6	15173	15178	0 %	50 %	0 %	50 %	219850703
27	NC_011832	AG	3	6	15841	15846	50 %	0 %	50 %	0 %	219850704
28	NC_011832	CT	3	6	17545	17550	0 %	50 %	0 %	50 %	219850705
29	NC_011832	TC	3	6	17822	17827	0 %	50 %	0 %	50 %	219850705
30	NC_011832	TC	3	6	20202	20207	0 %	50 %	0 %	50 %	219850706
31	NC_011832	GT	3	6	20377	20382	0 %	50 %	50 %	0 %	219850707
32	NC_011832	CT	3	6	20748	20753	0 %	50 %	0 %	50 %	219850708
33	NC_011832	CT	3	6	22203	22208	0 %	50 %	0 %	50 %	219850709
34	NC_011832	CT	3	6	22577	22582	0 %	50 %	0 %	50 %	219850709
35	NC_011832	GA	3	6	23942	23947	50 %	0 %	50 %	0 %	219850711
36	NC_011832	TC	3	6	24643	24648	0 %	50 %	0 %	50 %	219850711
37	NC_011832	TG	3	6	26176	26181	0 %	50 %	50 %	0 %	219850714
38	NC_011832	GA	3	6	26281	26286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011832	GA	3	6	27145	27150	50 %	0 %	50 %	0 %	219850716
40	NC_011832	GA	3	6	27347	27352	50 %	0 %	50 %	0 %	219850716
41	NC_011832	CT	3	6	29150	29155	0 %	50 %	0 %	50 %	219850717
42	NC_011832	GC	3	6	30053	30058	0 %	0 %	50 %	50 %	219850718
43	NC_011832	TC	3	6	30074	30079	0 %	50 %	0 %	50 %	219850718
44	NC_011832	TA	3	6	30229	30234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011832	AG	3	6	31967	31972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011832	TC	3	6	32826	32831	0 %	50 %	0 %	50 %	219850721
47	NC_011832	TC	3	6	33078	33083	0 %	50 %	0 %	50 %	219850722
48	NC_011832	GA	3	6	33120	33125	50 %	0 %	50 %	0 %	219850722
49	NC_011832	CT	3	6	34543	34548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011832	CA	3	6	34977	34982	50 %	0 %	0 %	50 %	219850723
51	NC_011832	AG	3	6	35098	35103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011832	TC	3	6	35220	35225	0 %	50 %	0 %	50 %	219850724
53	NC_011832	CG	4	8	37873	37880	0 %	0 %	50 %	50 %	219850726
54	NC_011832	CT	6	12	38611	38622	0 %	50 %	0 %	50 %	219850726
55	NC_011832	TA	3	6	39008	39013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011832	GA	3	6	40265	40270	50 %	0 %	50 %	0 %	219850728
57	NC_011832	GA	3	6	40765	40770	50 %	0 %	50 %	0 %	219850728
58	NC_011832	AG	3	6	41345	41350	50 %	0 %	50 %	0 %	219850730
59	NC_011832	CG	3	6	41452	41457	0 %	0 %	50 %	50 %	219850730
60	NC_011832	AT	3	6	41850	41855	50 %	50 %	0 %	0 %	219850731
61	NC_011832	AG	3	6	42383	42388	50 %	0 %	50 %	0 %	219850731
62	NC_011832	GT	3	6	43357	43362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011832	TC	3	6	44371	44376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011832	AG	4	8	44485	44492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011832	CT	3	6	44732	44737	0 %	50 %	0 %	50 %	219850732
66	NC_011832	TC	3	6	44976	44981	0 %	50 %	0 %	50 %	219850732
67	NC_011832	CT	4	8	45285	45292	0 %	50 %	0 %	50 %	219850733
68	NC_011832	CA	3	6	45647	45652	50 %	0 %	0 %	50 %	219850733
69	NC_011832	AG	3	6	45929	45934	50 %	0 %	50 %	0 %	219850733
70	NC_011832	AG	4	8	46776	46783	50 %	0 %	50 %	0 %	219850733
71	NC_011832	AG	4	8	47148	47155	50 %	0 %	50 %	0 %	219850733
72	NC_011832	GA	3	6	47333	47338	50 %	0 %	50 %	0 %	219850733
73	NC_011832	TC	3	6	48026	48031	0 %	50 %	0 %	50 %	219850733
74	NC_011832	GA	3	6	48343	48348	50 %	0 %	50 %	0 %	219850734
75	NC_011832	GT	3	6	48605	48610	0 %	50 %	50 %	0 %	219850734
76	NC_011832	AT	3	6	49021	49026	50 %	50 %	0 %	0 %	219850735
77	NC_011832	CT	3	6	49508	49513	0 %	50 %	0 %	50 %	219850735
78	NC_011832	AG	3	6	49730	49735	50 %	0 %	50 %	0 %	219850735
79	NC_011832	TG	3	6	50105	50110	0 %	50 %	50 %	0 %	219850735
80	NC_011832	AG	3	6	50187	50192	50 %	0 %	50 %	0 %	219850735
81	NC_011832	GA	3	6	50395	50400	50 %	0 %	50 %	0 %	219850735
82	NC_011832	GA	3	6	51289	51294	50 %	0 %	50 %	0 %	219850735
83	NC_011832	AT	3	6	51606	51611	50 %	50 %	0 %	0 %	219850735
84	NC_011832	TC	3	6	51803	51808	0 %	50 %	0 %	50 %	219850735
85	NC_011832	TG	3	6	52875	52880	0 %	50 %	50 %	0 %	219850736
86	NC_011832	GA	3	6	53673	53678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011832	TC	3	6	53879	53884	0 %	50 %	0 %	50 %	219850737
88	NC_011832	AT	3	6	54253	54258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011832	GT	3	6	55525	55530	0 %	50 %	50 %	0 %	219850738
90	NC_011832	TC	4	8	55918	55925	0 %	50 %	0 %	50 %	219850738
91	NC_011832	AT	3	6	56483	56488	50 %	50 %	0 %	0 %	219850738
92	NC_011832	TC	3	6	56838	56843	0 %	50 %	0 %	50 %	219850738
93	NC_011832	CT	3	6	59857	59862	0 %	50 %	0 %	50 %	219850741
94	NC_011832	AT	3	6	61403	61408	50 %	50 %	0 %	0 %	219850743
95	NC_011832	CT	3	6	62042	62047	0 %	50 %	0 %	50 %	219850743
96	NC_011832	TC	3	6	62670	62675	0 %	50 %	0 %	50 %	219850743
97	NC_011832	AT	3	6	63323	63328	50 %	50 %	0 %	0 %	219850744
98	NC_011832	TA	3	6	63690	63695	50 %	50 %	0 %	0 %	219850744
99	NC_011832	GA	3	6	64237	64242	50 %	0 %	50 %	0 %	219850744
100	NC_011832	TC	3	6	66331	66336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_011832	TG	3	6	66937	66942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011832	CT	3	6	66950	66955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011832	TC	3	6	67114	67119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011832	TC	3	6	67153	67158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011832	TC	4	8	67179	67186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011832	TC	5	10	68829	68838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011832	AG	3	6	69301	69306	50 %	0 %	50 %	0 %	219850749
109	NC_011832	CT	3	6	69870	69875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011832	TC	3	6	71293	71298	0 %	50 %	0 %	50 %	219850752
111	NC_011832	CT	3	6	72191	72196	0 %	50 %	0 %	50 %	219850753
112	NC_011832	TC	3	6	74124	74129	0 %	50 %	0 %	50 %	219850754
113	NC_011832	CT	3	6	75759	75764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011832	AG	3	6	76286	76291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011832	AG	3	6	76437	76442	50 %	0 %	50 %	0 %	219850757
116	NC_011832	TC	3	6	77243	77248	0 %	50 %	0 %	50 %	219850758
117	NC_011832	AG	3	6	77339	77344	50 %	0 %	50 %	0 %	219850758
118	NC_011832	GC	3	6	77526	77531	0 %	0 %	50 %	50 %	219850759
119	NC_011832	TC	3	6	77752	77757	0 %	50 %	0 %	50 %	219850759
120	NC_011832	TC	3	6	78390	78395	0 %	50 %	0 %	50 %	219850759
121	NC_011832	CG	3	6	80776	80781	0 %	0 %	50 %	50 %	219850761
122	NC_011832	TA	3	6	81642	81647	50 %	50 %	0 %	0 %	219850762
123	NC_011832	AT	3	6	82788	82793	50 %	50 %	0 %	0 %	219850763
124	NC_011832	CT	3	6	83754	83759	0 %	50 %	0 %	50 %	219850763
125	NC_011832	AT	3	6	83925	83930	50 %	50 %	0 %	0 %	219850763
126	NC_011832	CT	3	6	84103	84108	0 %	50 %	0 %	50 %	219850763
127	NC_011832	TC	4	8	85116	85123	0 %	50 %	0 %	50 %	219850763
128	NC_011832	TC	3	6	85568	85573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011832	CT	3	6	85574	85579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011832	CT	3	6	85694	85699	0 %	50 %	0 %	50 %	219850764
131	NC_011832	GA	3	6	86090	86095	50 %	0 %	50 %	0 %	219850764
132	NC_011832	TC	3	6	86946	86951	0 %	50 %	0 %	50 %	219850764
133	NC_011832	TC	5	10	87582	87591	0 %	50 %	0 %	50 %	219850764
134	NC_011832	CT	3	6	88435	88440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011832	GA	3	6	88505	88510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011832	TC	3	6	90500	90505	0 %	50 %	0 %	50 %	219850766
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138	NC_011832	TC	3	6	91229	91234	0 %	50 %	0 %	50 %	219850766
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140	NC_011832	AG	3	6	92286	92291	50 %	0 %	50 %	0 %	219850767
141	NC_011832	CG	3	6	93510	93515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011832	AT	3	6	93820	93825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011832	CA	3	6	94153	94158	50 %	0 %	0 %	50 %	219850769
144	NC_011832	GA	3	6	94405	94410	50 %	0 %	50 %	0 %	219850769
145	NC_011832	GT	3	6	95240	95245	0 %	50 %	50 %	0 %	219850769
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