MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 3762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011831	TCACG	2	10	1426	1435	20 %	20 %	20 %	40 %	219846957
2	NC_011831	GTGCG	2	10	1700	1709	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011831	CACGC	2	10	8369	8378	20 %	0 %	20 %	60 %	219846965
4	NC_011831	GTTCG	2	10	10153	10162	0 %	40 %	40 %	20 %	219846966
5	NC_011831	TGCGC	2	10	10972	10981	0 %	20 %	40 %	40 %	219846966
6	NC_011831	TGGCT	2	10	14721	14730	0 %	40 %	40 %	20 %	219846968
7	NC_011831	CGCAA	2	10	15125	15134	40 %	0 %	20 %	40 %	219846968
8	NC_011831	CTCAT	2	10	15668	15677	20 %	40 %	0 %	40 %	219846968
9	NC_011831	ATGAG	2	10	16368	16377	40 %	20 %	40 %	0 %	219846968
10	NC_011831	CATTG	2	10	17137	17146	20 %	40 %	20 %	20 %	219846968
11	NC_011831	GGTAT	2	10	20249	20258	20 %	40 %	40 %	0 %	219846968
12	NC_011831	CGATC	2	10	20419	20428	20 %	20 %	20 %	40 %	219846968
13	NC_011831	TACAA	2	10	20444	20453	60 %	20 %	0 %	20 %	219846968
14	NC_011831	TCGCG	2	10	21054	21063	0 %	20 %	40 %	40 %	219846968
15	NC_011831	TGTAG	2	10	21624	21633	20 %	40 %	40 %	0 %	219846969
16	NC_011831	GCGTG	2	10	24728	24737	0 %	20 %	60 %	20 %	219846971
17	NC_011831	GAGCA	2	10	25487	25496	40 %	0 %	40 %	20 %	219846971
18	NC_011831	CAGGG	2	10	25606	25615	20 %	0 %	60 %	20 %	219846971
19	NC_011831	TCCAT	2	10	26827	26836	20 %	40 %	0 %	40 %	219846971
20	NC_011831	TGCGA	2	10	26965	26974	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011831	TTTAG	2	10	28767	28776	20 %	60 %	20 %	0 %	219846974
22	NC_011831	GCCAG	2	10	28906	28915	20 %	0 %	40 %	40 %	219846974
23	NC_011831	ATGCG	2	10	31631	31640	20 %	20 %	40 %	20 %	219846976
24	NC_011831	CGTAC	2	10	35284	35293	20 %	20 %	20 %	40 %	219846979
25	NC_011831	TAGCA	2	10	37282	37291	40 %	20 %	20 %	20 %	219846979
26	NC_011831	GGTCG	2	10	37500	37509	0 %	20 %	60 %	20 %	219846979
27	NC_011831	ATCGA	2	10	38300	38309	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011831	GCTCA	2	10	38985	38994	20 %	20 %	20 %	40 %	219846980
29	NC_011831	CGATC	2	10	39941	39950	20 %	20 %	20 %	40 %	219846980
30	NC_011831	ACGTA	2	10	40143	40152	40 %	20 %	20 %	20 %	219846980
31	NC_011831	GCGCG	2	10	44088	44097	0 %	0 %	60 %	40 %	219846984
32	NC_011831	ATGCA	2	10	44962	44971	40 %	20 %	20 %	20 %	219846984
33	NC_011831	CAACT	2	10	47557	47566	40 %	20 %	0 %	40 %	219846986
34	NC_011831	CGCGC	2	10	50372	50381	0 %	0 %	40 %	60 %	219846988
35	NC_011831	GATCT	2	10	50498	50507	20 %	40 %	20 %	20 %	219846988
36	NC_011831	GCACC	2	10	52621	52630	20 %	0 %	20 %	60 %	219846989
37	NC_011831	CCGGC	2	10	53230	53239	0 %	0 %	40 %	60 %	219846989
38	NC_011831	CATAT	2	10	56496	56505	40 %	40 %	0 %	20 %	219846990
39	NC_011831	GATCT	2	10	56626	56635	20 %	40 %	20 %	20 %	219846991
40	NC_011831	CCTTG	2	10	59767	59776	0 %	40 %	20 %	40 %	219846993
41	NC_011831	CACAC	2	10	60991	61000	40 %	0 %	0 %	60 %	219846994
42	NC_011831	GCATG	2	10	62540	62549	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011831	TTGGG	2	10	63242	63251	0 %	40 %	60 %	0 %	219846996
44	NC_011831	GCGTG	2	10	65101	65110	0 %	20 %	60 %	20 %	219846999
45	NC_011831	TCGGC	2	10	65230	65239	0 %	20 %	40 %	40 %	219846999
46	NC_011831	CGAAT	2	10	66100	66109	40 %	20 %	20 %	20 %	219846999
47	NC_011831	GGAGA	2	10	67311	67320	40 %	0 %	60 %	0 %	219847000
48	NC_011831	CAACC	2	10	68062	68071	40 %	0 %	0 %	60 %	219847001
49	NC_011831	GCGCG	2	10	69073	69082	0 %	0 %	60 %	40 %	219847002
50	NC_011831	AGCCA	2	10	69698	69707	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_011831	CTTGT	2	10	72358	72367	0 %	60 %	20 %	20 %	219847005
52	NC_011831	ATCCC	2	10	74200	74209	20 %	20 %	0 %	60 %	219847008
53	NC_011831	CCGAT	2	10	74523	74532	20 %	20 %	20 %	40 %	219847008
54	NC_011831	CATGT	2	10	75353	75362	20 %	40 %	20 %	20 %	219847008
55	NC_011831	GCGCC	2	10	77730	77739	0 %	0 %	40 %	60 %	219847012
56	NC_011831	CTGGT	2	10	79084	79093	0 %	40 %	40 %	20 %	219847012
57	NC_011831	GGTGA	2	10	79813	79822	20 %	20 %	60 %	0 %	219847012
58	NC_011831	GGTAC	2	10	79887	79896	20 %	20 %	40 %	20 %	219847012
59	NC_011831	ATTAC	2	10	81526	81535	40 %	40 %	0 %	20 %	219847013
60	NC_011831	CAAGT	2	10	81751	81760	40 %	20 %	20 %	20 %	219847013
61	NC_011831	TGGGG	2	10	85285	85294	0 %	20 %	80 %	0 %	219847014
62	NC_011831	GGTAT	2	10	85792	85801	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011831	CGCAG	2	10	87710	87719	20 %	0 %	40 %	40 %	219847017
64	NC_011831	ACGCG	2	10	92842	92851	20 %	0 %	40 %	40 %	219847022
65	NC_011831	AACGG	2	10	92913	92922	40 %	0 %	40 %	20 %	219847022
66	NC_011831	GCGGA	2	10	92959	92968	20 %	0 %	60 %	20 %	219847022
67	NC_011831	CCGAT	2	10	96035	96044	20 %	20 %	20 %	40 %	219847025
68	NC_011831	CTATT	2	10	96998	97007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011831	CGGCC	2	10	98223	98232	0 %	0 %	40 %	60 %	219847026
70	NC_011831	TATCA	2	10	100232	100241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011831	CCGTA	2	10	101098	101107	20 %	20 %	20 %	40 %	219847028
72	NC_011831	CAACC	2	10	101650	101659	40 %	0 %	0 %	60 %	219847028
73	NC_011831	CATCT	2	10	102908	102917	20 %	40 %	0 %	40 %	219847030
74	NC_011831	TGCTG	2	10	104753	104762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011831	ACGTA	2	10	105846	105855	40 %	20 %	20 %	20 %	219847032
76	NC_011831	TGCAG	2	10	105976	105985	20 %	20 %	40 %	20 %	219847032
77	NC_011831	GGTAG	2	10	106379	106388	20 %	20 %	60 %	0 %	219847032
78	NC_011831	TGGGG	2	10	106642	106651	0 %	20 %	80 %	0 %	219847032
79	NC_011831	CGCCA	2	10	107117	107126	20 %	0 %	20 %	60 %	219847033
80	NC_011831	AACCA	2	10	115712	115721	60 %	0 %	0 %	40 %	219847038
81	NC_011831	CCAAC	2	10	116522	116531	40 %	0 %	0 %	60 %	219847038
82	NC_011831	TCCAG	2	10	121099	121108	20 %	20 %	20 %	40 %	219847042
83	NC_011831	GCGTC	2	10	122667	122676	0 %	20 %	40 %	40 %	219847042
84	NC_011831	CACGT	2	10	122834	122843	20 %	20 %	20 %	40 %	219847042
85	NC_011831	CGTAG	2	10	123987	123996	20 %	20 %	40 %	20 %	219847044
86	NC_011831	GATGG	2	10	124145	124154	20 %	20 %	60 %	0 %	219847044
87	NC_011831	GCGCC	2	10	126076	126085	0 %	0 %	40 %	60 %	219847045
88	NC_011831	TACAA	2	10	132118	132127	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011831	TCCCA	2	10	132708	132717	20 %	20 %	0 %	60 %	219847049
90	NC_011831	AGCGG	2	10	133280	133289	20 %	0 %	60 %	20 %	219847050
91	NC_011831	CTGAG	2	10	134580	134589	20 %	20 %	40 %	20 %	219847051
92	NC_011831	ATCGC	2	10	136747	136756	20 %	20 %	20 %	40 %	219847052
93	NC_011831	AATCG	2	10	137866	137875	40 %	20 %	20 %	20 %	219847052
94	NC_011831	GGCTT	2	10	139113	139122	0 %	40 %	40 %	20 %	219847053
95	NC_011831	GAAGA	2	10	139571	139580	60 %	0 %	40 %	0 %	219847054
96	NC_011831	CGTGC	2	10	140746	140755	0 %	20 %	40 %	40 %	219847055
97	NC_011831	GCACG	2	10	140832	140841	20 %	0 %	40 %	40 %	219847055
98	NC_011831	AGCCG	2	10	143257	143266	20 %	0 %	40 %	40 %	219847056
99	NC_011831	CTATT	2	10	148737	148746	20 %	60 %	0 %	20 %	219847060
100	NC_011831	GCTCA	2	10	149647	149656	20 %	20 %	20 %	40 %	219847061
101	NC_011831	CCCAA	2	10	151790	151799	40 %	0 %	0 %	60 %	219847062
102	NC_011831	GTCCG	2	10	152991	153000	0 %	20 %	40 %	40 %	219847063
103	NC_011831	TGGGC	2	10	153597	153606	0 %	20 %	60 %	20 %	219847063
104	NC_011831	TCATG	2	10	153741	153750	20 %	40 %	20 %	20 %	219847063
105	NC_011831	GCCAG	2	10	155252	155261	20 %	0 %	40 %	40 %	219847065
106	NC_011831	CGAGC	2	10	155851	155860	20 %	0 %	40 %	40 %	219847066
107	NC_011831	GGCCC	2	10	157654	157663	0 %	0 %	40 %	60 %	219847067
108	NC_011831	CGTGC	2	10	162511	162520	0 %	20 %	40 %	40 %	219847071
109	NC_011831	ACCCG	2	10	163701	163710	20 %	0 %	20 %	60 %	219847072
110	NC_011831	ATGGT	2	10	164019	164028	20 %	40 %	40 %	0 %	219847072
111	NC_011831	GAGGG	2	10	164841	164850	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011831	ACAGC	2	10	167873	167882	40 %	0 %	20 %	40 %	219847076
113	NC_011831	CACCG	2	10	169153	169162	20 %	0 %	20 %	60 %	219847077
114	NC_011831	TGCGC	2	10	170620	170629	0 %	20 %	40 %	40 %	219847077
115	NC_011831	CGAGC	2	10	170967	170976	20 %	0 %	40 %	40 %	219847077
116	NC_011831	TCCAC	2	10	172143	172152	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_011831	TTGGG	2	10	173354	173363	0 %	40 %	60 %	0 %	219847080
118	NC_011831	CGTCG	2	10	175157	175166	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011831	TGCTT	2	10	175284	175293	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011831	CGGTA	2	10	177077	177086	20 %	20 %	40 %	20 %	219847083
121	NC_011831	CGAGG	2	10	181584	181593	20 %	0 %	60 %	20 %	219847086
122	NC_011831	TGATC	2	10	182796	182805	20 %	40 %	20 %	20 %	219847087
123	NC_011831	TAGGT	2	10	182991	183000	20 %	40 %	40 %	0 %	219847087
124	NC_011831	ACTAC	2	10	183913	183922	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011831	GGCGT	2	10	184077	184086	0 %	20 %	60 %	20 %	219847089
126	NC_011831	TTGCG	2	10	184132	184141	0 %	40 %	40 %	20 %	219847089
127	NC_011831	CGTTG	2	10	185935	185944	0 %	40 %	40 %	20 %	219847092
128	NC_011831	CGGAA	2	10	189080	189089	40 %	0 %	40 %	20 %	219847095
129	NC_011831	CAGCG	2	10	194105	194114	20 %	0 %	40 %	40 %	219847099
130	NC_011831	GGGTC	2	10	196501	196510	0 %	20 %	60 %	20 %	219847099
131	NC_011831	GATGA	2	10	199344	199353	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011831	GCGTG	2	10	200983	200992	0 %	20 %	60 %	20 %	219847103
133	NC_011831	GCGGG	2	10	203902	203911	0 %	0 %	80 %	20 %	219847106
134	NC_011831	TCAGC	2	10	204291	204300	20 %	20 %	20 %	40 %	219847107
135	NC_011831	GCCCT	2	10	206689	206698	0 %	20 %	20 %	60 %	219847109
136	NC_011831	TGCGC	2	10	207017	207026	0 %	20 %	40 %	40 %	219847110
137	NC_011831	AGGAA	2	10	207115	207124	60 %	0 %	40 %	0 %	219847110
138	NC_011831	ACCAG	2	10	207341	207350	40 %	0 %	20 %	40 %	219847110
139	NC_011831	CACCG	2	10	209581	209590	20 %	0 %	20 %	60 %	219847113
140	NC_011831	GATCC	2	10	212047	212056	20 %	20 %	20 %	40 %	219847114
141	NC_011831	CTGGC	2	10	212418	212427	0 %	20 %	40 %	40 %	219847114
142	NC_011831	GTACC	2	10	214938	214947	20 %	20 %	20 %	40 %	219847115
143	NC_011831	TTACG	2	10	217759	217768	20 %	40 %	20 %	20 %	219847119
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146	NC_011831	TCTGG	2	10	220842	220851	0 %	40 %	40 %	20 %	219847122
147	NC_011831	ACCCA	2	10	225221	225230	40 %	0 %	0 %	60 %	219847129
148	NC_011831	AGCAA	2	10	225461	225470	60 %	0 %	20 %	20 %	219847129
149	NC_011831	TTGGG	2	10	226408	226417	0 %	40 %	60 %	0 %	219847130
150	NC_011831	CGACA	2	10	231542	231551	40 %	0 %	20 %	40 %	219847135
151	NC_011831	CTGAC	2	10	234118	234127	20 %	20 %	20 %	40 %	219847136
152	NC_011831	CAGTG	2	10	235245	235254	20 %	20 %	40 %	20 %	219847138
153	NC_011831	GAGCG	2	10	235294	235303	20 %	0 %	60 %	20 %	219847138
154	NC_011831	CAGTG	2	10	235409	235418	20 %	20 %	40 %	20 %	219847139
155	NC_011831	ACAGT	2	10	235461	235470	40 %	20 %	20 %	20 %	219847139
156	NC_011831	GAGCG	2	10	235511	235520	20 %	0 %	60 %	20 %	219847139
157	NC_011831	CAGTG	2	10	235626	235635	20 %	20 %	40 %	20 %	219847140
158	NC_011831	ACAGT	2	10	235678	235687	40 %	20 %	20 %	20 %	219847140
159	NC_011831	GAGCG	2	10	235783	235792	20 %	0 %	60 %	20 %	219847140
160	NC_011831	ACAGT	2	10	235962	235971	40 %	20 %	20 %	20 %	219847140
161	NC_011831	ACAGT	2	10	236015	236024	40 %	20 %	20 %	20 %	219847140
162	NC_011831	GAGCG	2	10	236118	236127	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
163	NC_011831	ACAGT	2	10	236231	236240	40 %	20 %	20 %	20 %	219847141
164	NC_011831	ACAGT	2	10	236317	236326	40 %	20 %	20 %	20 %	219847141
165	NC_011831	ACAGT	2	10	236370	236379	40 %	20 %	20 %	20 %	219847141
166	NC_011831	CAGTG	2	10	236569	236578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
167	NC_011831	ACAGT	2	10	236621	236630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_011831	GAGCG	2	10	236672	236681	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
169	NC_011831	ACAGT	2	10	236786	236795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_011831	GAGCG	2	10	236890	236899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
171	NC_011831	ACAGT	2	10	237003	237012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_011831	ACAGT	2	10	237056	237065	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_011831	GAGCG	2	10	237106	237115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
174	NC_011831	CAGTG	2	10	237221	237230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_011831	GAGCG	2	10	237325	237334	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
176	NC_011831	CAGTG	2	10	237440	237449	20 %	20 %	40 %	20 %	219847142
177	NC_011831	TACAA	2	10	245858	245867	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
178	NC_011831	ATGCG	2	10	247730	247739	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
179	NC_011831	CCCAG	2	10	249115	249124	20 %	0 %	20 %	60 %	219847151
180	NC_011831	CTTCA	2	10	251284	251293	20 %	40 %	0 %	40 %	219847152
181	NC_011831	AGCCG	2	10	253203	253212	20 %	0 %	40 %	40 %	219847153
182	NC_011831	AATCA	2	10	256993	257002	60 %	20 %	0 %	20 %	219847156
183	NC_011831	CATGC	2	10	257890	257899	20 %	20 %	20 %	40 %	219847157
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192	NC_011831	GGTTA	2	10	268758	268767	20 %	40 %	40 %	0 %	219847167
193	NC_011831	CCGGT	2	10	275286	275295	0 %	20 %	40 %	40 %	219847171
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223	NC_011831	TGCCG	2	10	314763	314772	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
224	NC_011831	AAGTT	2	10	316488	316497	40 %	40 %	20 %	0 %	219847201
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232	NC_011831	GGTAC	2	10	322113	322122	20 %	20 %	40 %	20 %	219847206
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234	NC_011831	TTACC	2	10	326289	326298	20 %	40 %	0 %	40 %	219847208
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237	NC_011831	CGGTC	2	10	327732	327741	0 %	20 %	40 %	40 %	219847209
238	NC_011831	GGTGC	2	10	327975	327984	0 %	20 %	60 %	20 %	219847209
239	NC_011831	CGGCC	2	10	328473	328482	0 %	0 %	40 %	60 %	219847209
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241	NC_011831	GGACC	2	10	331352	331361	20 %	0 %	40 %	40 %	219847210
242	NC_011831	TACCG	2	10	332177	332186	20 %	20 %	20 %	40 %	219847211
243	NC_011831	GCAGC	2	10	334659	334668	20 %	0 %	40 %	40 %	219847214
244	NC_011831	GCAGA	2	10	339088	339097	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
245	NC_011831	CATTG	2	10	339198	339207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
246	NC_011831	CTGCG	2	10	339364	339373	0 %	20 %	40 %	40 %	219847219
247	NC_011831	GAGCT	2	10	339715	339724	20 %	20 %	40 %	20 %	219847219
248	NC_011831	GGATT	2	10	339900	339909	20 %	40 %	40 %	0 %	219847219
249	NC_011831	TCCAC	2	10	341861	341870	20 %	20 %	0 %	60 %	219847221
250	NC_011831	TGCGT	2	10	343559	343568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
251	NC_011831	ATGAC	2	10	344998	345007	40 %	20 %	20 %	20 %	219847224
252	NC_011831	CCACG	2	10	345548	345557	20 %	0 %	20 %	60 %	219847225
253	NC_011831	GGTTG	2	10	347358	347367	0 %	40 %	60 %	0 %	219847226
254	NC_011831	CCGAC	2	10	348470	348479	20 %	0 %	20 %	60 %	219847227
255	NC_011831	GCCGT	2	10	349753	349762	0 %	20 %	40 %	40 %	219847229
256	NC_011831	CAACG	2	10	350753	350762	40 %	0 %	20 %	40 %	219847229
257	NC_011831	ATTCC	2	10	352116	352125	20 %	40 %	0 %	40 %	219847231
258	NC_011831	CGGTA	2	10	355133	355142	20 %	20 %	40 %	20 %	219847234
259	NC_011831	GCAAG	2	10	356768	356777	40 %	0 %	40 %	20 %	219847237
260	NC_011831	GTACG	2	10	356962	356971	20 %	20 %	40 %	20 %	219847237
261	NC_011831	GGGGT	2	10	358447	358456	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
262	NC_011831	CTGGT	2	10	358575	358584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
263	NC_011831	AGCGC	2	10	358742	358751	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_011831	GCAGT	2	10	362973	362982	20 %	20 %	40 %	20 %	219847242
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266	NC_011831	GTGGC	2	10	364701	364710	0 %	20 %	60 %	20 %	219847242
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398	NC_011831	GGATG	2	10	514869	514878	20 %	20 %	60 %	0 %	219847363
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