MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-4

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011785	AAGAA	2	10	2960	2969	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011785	AAACA	2	10	3183	3192	80 %	0 %	0 %	20 %	218906780
3	NC_011785	CAAAA	2	10	4174	4183	80 %	0 %	0 %	20 %	218906790
4	NC_011785	TATAT	2	10	4306	4315	40 %	60 %	0 %	0 %	218906790
5	NC_011785	TAAAA	2	10	4527	4536	80 %	20 %	0 %	0 %	218906790
6	NC_011785	AAAAG	2	10	5274	5283	80 %	0 %	20 %	0 %	218906792
7	NC_011785	TTGGG	2	10	5385	5394	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011785	TAAAA	2	10	5738	5747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011785	TTAAT	2	10	6129	6138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011785	CATTG	2	10	6879	6888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011785	TTTAC	2	10	7017	7026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011785	TTAAA	2	10	7268	7277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011785	TAATA	2	10	7588	7597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011785	ATAAA	2	10	7730	7739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011785	ATTTA	2	10	8580	8589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011785	ATTTA	2	10	8604	8613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011785	AATTA	2	10	8632	8641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011785	TTACT	2	10	10409	10418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011785	TTTCT	2	10	11089	11098	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011785	ATATT	2	10	11187	11196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011785	AAATT	2	10	11278	11287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011785	AAATT	2	10	13831	13840	60 %	40 %	0 %	0 %	218906781
23	NC_011785	ATTAT	2	10	13859	13868	40 %	60 %	0 %	0 %	218906781
24	NC_011785	AAAGA	2	10	14370	14379	80 %	0 %	20 %	0 %	218906787
25	NC_011785	CAAAA	2	10	14682	14691	80 %	0 %	0 %	20 %	218906787
26	NC_011785	TTTGT	2	10	15582	15591	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011785	AAAAT	2	10	15762	15771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011785	TAAAA	2	10	15934	15943	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011785	TTAAA	2	10	16143	16152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011785	AATTT	2	10	18942	18951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011785	TATCG	2	10	19605	19614	20 %	40 %	20 %	20 %	218906800
32	NC_011785	TGCTA	2	10	19836	19845	20 %	40 %	20 %	20 %	218906800
33	NC_011785	TTAAT	2	10	22861	22870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011785	AATTT	2	10	22994	23003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011785	GTTTT	2	10	23248	23257	0 %	80 %	20 %	0 %	218906783
36	NC_011785	TTTGA	2	10	23688	23697	20 %	60 %	20 %	0 %	218906783
37	NC_011785	GTTTT	2	10	23829	23838	0 %	80 %	20 %	0 %	218906783
38	NC_011785	ATTTA	2	10	23956	23965	40 %	60 %	0 %	0 %	218906783
39	NC_011785	AATTT	2	10	24088	24097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011785	GTTTT	2	10	24342	24351	0 %	80 %	20 %	0 %	218906793
41	NC_011785	TTTGA	2	10	24776	24785	20 %	60 %	20 %	0 %	218906793
42	NC_011785	ATTTA	2	10	25020	25029	40 %	60 %	0 %	0 %	218906793
43	NC_011785	AATTT	2	10	25149	25158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011785	TTTTA	2	10	25717	25726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011785	TAAAA	2	10	25846	25855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011785	TAATA	2	10	26302	26311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011785	TCAAA	2	10	26718	26727	60 %	20 %	0 %	20 %	218906791

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.