MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-4

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011785	TAA	2	6	32	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011785	AAG	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011785	AAT	2	6	966	971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011785	TAT	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011785	ATA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011785	AAC	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011785	ATT	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011785	AAT	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011785	CAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011785	ATA	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011785	TAT	2	6	2010	2015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011785	ACT	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011785	ACA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011785	CTA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011785	GAA	2	6	2218	2223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011785	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011785	AAT	2	6	2708	2713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011785	TTA	3	9	2875	2883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011785	TAA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011785	ATA	2	6	2993	2998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011785	TTA	2	6	3059	3064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011785	ATC	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011785	ATT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011785	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011785	ATA	2	6	3963	3968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011785	TAA	2	6	3979	3984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011785	TCT	2	6	4874	4879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011785	TAG	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011785	TAA	2	6	4968	4973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011785	TTA	2	6	4974	4979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011785	TTA	2	6	4987	4992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011785	TTC	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011785	TAA	2	6	5024	5029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011785	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011785	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011785	TCA	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011785	GAT	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011785	AGC	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011785	GTA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011785	AAT	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011785	TAA	2	6	5563	5568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011785	TGA	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011785	AAC	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011785	GAA	3	9	5988	5996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011785	GGC	2	6	6083	6088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011785	TAT	2	6	6325	6330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011785	CCA	2	6	6416	6421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011785	AAT	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011785	TAA	2	6	6571	6576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011785	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011785	AAT	2	6	7177	7182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011785	AAT	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011785	ATA	2	6	7223	7228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011785	TAT	2	6	7251	7256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011785	AGA	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011785	ATT	2	6	7390	7395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011785	ATT	2	6	7526	7531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011785	ATT	2	6	7567	7572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011785	TGT	2	6	7574	7579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011785	ATG	2	6	7697	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011785	AGC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011785	ACT	2	6	7806	7811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011785	ACA	2	6	7844	7849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011785	ACA	2	6	7861	7866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011785	GAT	2	6	7932	7937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011785	TAA	2	6	8072	8077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011785	AAC	2	6	8119	8124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011785	CAA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011785	AGA	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011785	GAA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011785	TAT	2	6	8296	8301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011785	TTA	2	6	8333	8338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011785	TAA	2	6	8382	8387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011785	ATT	2	6	8396	8401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011785	TAA	2	6	8419	8424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011785	AAT	2	6	8441	8446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011785	TAA	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011785	TAA	2	6	8654	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011785	AGG	2	6	8690	8695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011785	TTA	2	6	9589	9594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011785	TAT	2	6	9692	9697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011785	ATT	2	6	9845	9850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011785	CAA	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011785	ACT	2	6	10205	10210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011785	CAA	2	6	10378	10383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011785	TAA	2	6	10386	10391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011785	TTG	2	6	10402	10407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011785	TAA	2	6	10421	10426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011785	TTA	2	6	10458	10463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011785	ATT	2	6	10520	10525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011785	ATT	2	6	10536	10541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011785	TTA	2	6	10581	10586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011785	TAA	2	6	10711	10716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011785	GTT	2	6	10717	10722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011785	TTA	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011785	ATT	2	6	11157	11162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011785	AAT	2	6	11266	11271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011785	ATT	3	9	11425	11433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011785	AAC	2	6	11434	11439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011785	GTA	2	6	11653	11658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011785	ATT	2	6	11734	11739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011785	TAA	2	6	14237	14242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011785	ATT	2	6	14885	14890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011785	AAT	2	6	14921	14926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011785	TAA	2	6	15085	15090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011785	GAA	2	6	15096	15101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011785	TAA	2	6	15120	15125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011785	AAG	2	6	15134	15139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011785	TAA	2	6	15146	15151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011785	TAA	2	6	15160	15165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011785	CAA	2	6	15187	15192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011785	AAT	2	6	15292	15297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011785	TTA	2	6	15320	15325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011785	ACT	2	6	15444	15449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011785	TGT	2	6	15467	15472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011785	ACC	2	6	15602	15607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011785	TAA	2	6	15720	15725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011785	AGA	2	6	15772	15777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011785	TAA	2	6	15957	15962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011785	GAT	2	6	15974	15979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011785	TAA	2	6	15997	16002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011785	AAT	2	6	16049	16054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011785	TTG	2	6	16107	16112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011785	CAT	2	6	16134	16139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011785	ATA	2	6	16160	16165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011785	TAA	2	6	16167	16172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011785	TAA	2	6	16205	16210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011785	GTT	2	6	16230	16235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011785	ATT	2	6	16242	16247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011785	TAT	2	6	16319	16324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011785	ATA	2	6	16359	16364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011785	ATT	2	6	16397	16402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011785	ATT	2	6	16410	16415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011785	TAT	2	6	16458	16463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011785	TAA	2	6	16466	16471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011785	ATT	3	9	16528	16536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011785	CTT	2	6	16616	16621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011785	GCT	2	6	16690	16695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011785	AAT	2	6	16782	16787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011785	ATT	2	6	16870	16875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011785	AGA	2	6	16951	16956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011785	TAA	2	6	16992	16997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011785	ATT	2	6	16999	17004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011785	ATT	2	6	17026	17031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011785	TAT	2	6	17212	17217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.