MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-4

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011785	AAC	2	6	402	407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906786
2	NC_011785	TAC	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906786
3	NC_011785	AAC	2	6	556	561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906786
4	NC_011785	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906786
5	NC_011785	CTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906786
6	NC_011785	AAT	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906786
7	NC_011785	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906786
8	NC_011785	CTA	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906786
9	NC_011785	ATT	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
10	NC_011785	ATT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
11	NC_011785	TTA	2	6	1071	1076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
12	NC_011785	AAT	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906795
13	NC_011785	TTA	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
14	NC_011785	AGA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906795
15	NC_011785	ATC	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906795
16	NC_011785	TAG	3	9	1538	1546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906795
17	NC_011785	TAC	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906795
18	NC_011785	TAA	2	6	2288	2293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906798
19	NC_011785	ACA	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
20	NC_011785	TAG	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906798
21	NC_011785	ACA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
22	NC_011785	TTA	2	6	2434	2439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906798
23	NC_011785	AAC	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
24	NC_011785	TAA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906798
25	NC_011785	TAC	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906798
26	NC_011785	ACT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906798
27	NC_011785	ACA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
28	NC_011785	AAC	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
29	NC_011785	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906780
30	NC_011785	CAA	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
31	NC_011785	CTA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906780
32	NC_011785	ATA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906782
33	NC_011785	TAA	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
34	NC_011785	AGA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
35	NC_011785	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906790
36	NC_011785	AGA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
37	NC_011785	AGA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
38	NC_011785	ATA	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
39	NC_011785	ACA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906790
40	NC_011785	TAA	2	6	4565	4570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
41	NC_011785	ATC	2	6	4592	4597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906790
42	NC_011785	AGA	2	6	4617	4622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
43	NC_011785	ATC	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906790
44	NC_011785	CAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906790
45	NC_011785	AAT	2	6	4738	4743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
46	NC_011785	GAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906790
47	NC_011785	CTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906790
48	NC_011785	TAG	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906790
49	NC_011785	ATT	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906792
50	NC_011785	TAA	2	6	5166	5171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906792
51	NC_011785	TAA	2	6	5254	5259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906792
52	NC_011785	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906797
53	NC_011785	AGA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906797
54	NC_011785	AGA	3	9	8857	8865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
55	NC_011785	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
56	NC_011785	GAA	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
57	NC_011785	CAA	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
58	NC_011785	GAA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
59	NC_011785	CAA	2	6	8933	8938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
60	NC_011785	GAA	2	6	8939	8944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
61	NC_011785	ACA	2	6	8965	8970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
62	NC_011785	AGA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
63	NC_011785	ATT	2	6	9221	9226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906794
64	NC_011785	GGA	2	6	9284	9289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218906794
65	NC_011785	TTA	2	6	9434	9439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906794
66	NC_011785	TAA	2	6	9466	9471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906794
67	NC_011785	CAA	2	6	9512	9517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
68	NC_011785	AGA	2	6	9538	9543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
69	NC_011785	ACT	2	6	9863	9868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906789
70	NC_011785	CTG	2	6	9919	9924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218906789
71	NC_011785	ACA	2	6	11885	11890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906784
72	NC_011785	TTA	2	6	11966	11971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906784
73	NC_011785	TTA	2	6	12113	12118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906784
74	NC_011785	AAC	2	6	12207	12212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906784
75	NC_011785	TAA	2	6	12230	12235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906784
76	NC_011785	TAA	7	21	12263	12283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906784
77	NC_011785	AGA	5	15	12284	12298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906784
78	NC_011785	ATA	2	6	12307	12312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906784
79	NC_011785	GAA	2	6	12366	12371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906784
80	NC_011785	ATA	2	6	12420	12425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906784
81	NC_011785	ATA	2	6	12429	12434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906784
82	NC_011785	AAC	2	6	12559	12564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906784
83	NC_011785	TAT	2	6	12617	12622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906784
84	NC_011785	TAT	3	9	12852	12860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906784
85	NC_011785	TGT	2	6	12922	12927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218906784
86	NC_011785	ATA	2	6	12934	12939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906784
87	NC_011785	CAT	2	6	12949	12954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906785
88	NC_011785	ATG	2	6	13058	13063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906785
89	NC_011785	AGA	2	6	13144	13149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906785
90	NC_011785	AAG	2	6	13170	13175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906785
91	NC_011785	TTA	2	6	13346	13351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906785
92	NC_011785	ATA	2	6	13377	13382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906785
93	NC_011785	AAT	2	6	13459	13464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906785
94	NC_011785	ATA	2	6	13492	13497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906785
95	NC_011785	AAT	2	6	13542	13547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906781
96	NC_011785	TAT	2	6	13559	13564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906781
97	NC_011785	GAT	2	6	13597	13602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906781
98	NC_011785	GCT	2	6	13606	13611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218906781
99	NC_011785	TTA	3	9	13620	13628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906781
100	NC_011785	TAA	2	6	13704	13709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906781
101	NC_011785	ATT	2	6	13714	13719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906781
102	NC_011785	TAT	3	9	13783	13791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906781
103	NC_011785	AAG	2	6	13983	13988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906781
104	NC_011785	AAG	2	6	13997	14002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906781
105	NC_011785	TTA	2	6	14027	14032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906781
106	NC_011785	AGA	2	6	14118	14123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906781
107	NC_011785	ATT	2	6	14176	14181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906781
108	NC_011785	TAA	2	6	14311	14316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906787
109	NC_011785	AAT	2	6	14330	14335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906787
110	NC_011785	ATT	2	6	14438	14443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906787
111	NC_011785	AGG	2	6	14494	14499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218906787
112	NC_011785	GCT	2	6	14573	14578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218906787
113	NC_011785	AGA	2	6	14599	14604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906787
114	NC_011785	AAT	2	6	14618	14623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906787
115	NC_011785	ATG	2	6	14774	14779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906787
116	NC_011785	TAA	2	6	14812	14817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906787
117	NC_011785	TTC	2	6	18171	18176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906796
118	NC_011785	TTA	2	6	18214	18219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906796
119	NC_011785	GTT	2	6	18379	18384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218906796
120	NC_011785	CTA	2	6	18428	18433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906796
121	NC_011785	TCT	2	6	18522	18527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906796
122	NC_011785	TTC	2	6	18624	18629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906796
123	NC_011785	TTA	2	6	18661	18666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906796
124	NC_011785	AGT	2	6	18697	18702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906796
125	NC_011785	GTT	3	9	18713	18721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218906796
126	NC_011785	ATA	2	6	19547	19552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906800
127	NC_011785	ATC	2	6	19635	19640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906800
128	NC_011785	TGA	2	6	19666	19671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906800
129	NC_011785	TAA	2	6	19674	19679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906800
130	NC_011785	TTG	2	6	19694	19699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218906800
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.