MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp54

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011784	ATTTTT	2	12	45	56	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011784	TAAAAA	2	12	61	72	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011784	ATTAAT	2	12	534	545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011784	ATTAAT	2	12	624	635	50 %	50 %	0 %	0 %	219499140
5	NC_011784	AATTAA	2	12	1123	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011784	TTAAAC	2	12	1596	1607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219499173
7	NC_011784	CTGTAT	2	12	3668	3679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219499137
8	NC_011784	AAATTT	2	12	4506	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011784	CTTAAG	2	12	4578	4589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011784	TAAAAA	2	12	4609	4620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011784	CATTAA	2	12	4856	4867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219499164
12	NC_011784	ACAATA	2	12	5543	5554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219499155
13	NC_011784	ATTGAG	2	12	6073	6084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219499128
14	NC_011784	AAATTT	2	12	8341	8352	50 %	50 %	0 %	0 %	219499170
15	NC_011784	AAAAGT	2	12	10903	10914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219499134
16	NC_011784	GAAAAA	2	12	12075	12086	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219499154
17	NC_011784	AAAAAC	2	12	12558	12569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	219499154
18	NC_011784	AAAGCA	2	12	13030	13041	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011784	GATAAA	2	12	14355	14366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219499127
20	NC_011784	TAAAGA	2	12	14505	14516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219499127
21	NC_011784	TAACTT	2	12	15861	15872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011784	TTTTTA	2	12	17136	17147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219499175
23	NC_011784	TTAAAT	2	12	17306	17317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011784	TTCCAA	2	12	23130	23141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219499158
25	NC_011784	TCTTTT	2	12	24425	24436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011784	ATCAAA	2	12	24636	24647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219499168
27	NC_011784	TTTTTA	2	12	25056	25067	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219499168
28	NC_011784	TGAAGA	2	12	25711	25722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219499144
29	NC_011784	ATTATG	2	12	25902	25913	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219499144
30	NC_011784	GTTTTA	2	12	30530	30541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	219499147
31	NC_011784	GCTTAA	2	12	31616	31627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219499161
32	NC_011784	TTCCAA	2	12	31852	31863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219499177
33	NC_011784	AAAAAG	2	12	33780	33791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011784	AAATTC	2	12	33882	33893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011784	TACAAA	2	12	34566	34577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219499178
36	NC_011784	AAATAT	2	12	35281	35292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219499167
37	NC_011784	ACAAAA	2	12	35306	35317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	219499167
38	NC_011784	CTTTTT	2	12	38100	38111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011784	TTTGGG	2	12	38341	38352	0 %	50 %	50 %	0 %	219499131
40	NC_011784	GTATTA	2	12	38536	38547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219499131
41	NC_011784	AAAATT	2	12	39537	39548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011784	ATTAAT	2	12	41054	41065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011784	GTTTAA	2	12	41344	41355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011784	ATTGAT	2	12	42174	42185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011784	ATTAAA	2	12	42524	42535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219499150
46	NC_011784	CTTTGT	2	12	44427	44438	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219499159
47	NC_011784	TTTAAA	2	12	46301	46312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011784	AATATA	2	12	51221	51232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011784	TTGTTT	2	12	51432	51443	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011784	GGAATT	2	12	52201	52212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219499125

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.