MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp54

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011784	ATTTTT	2	12	45	56	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011784	TAAAAA	2	12	61	72	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011784	ATTAAT	2	12	534	545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011784	AATTAA	2	12	1123	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011784	AAATTT	2	12	4506	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011784	CTTAAG	2	12	4578	4589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011784	TAAAAA	2	12	4609	4620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011784	AAAGCA	2	12	13030	13041	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011784	TAACTT	2	12	15861	15872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011784	TTAAAT	2	12	17306	17317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011784	TCTTTT	2	12	24425	24436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011784	AAAAAG	2	12	33780	33791	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011784	AAATTC	2	12	33882	33893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011784	CTTTTT	2	12	38100	38111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011784	AAAATT	2	12	39537	39548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011784	ATTAAT	2	12	41054	41065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011784	GTTTAA	2	12	41344	41355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011784	ATTGAT	2	12	42174	42185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011784	TTTAAA	2	12	46301	46312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011784	AATATA	2	12	51221	51232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011784	TTGTTT	2	12	51432	51443	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.