MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp17

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011782	AAT	2	6	259	264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011782	AAC	2	6	303	308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875588
3	NC_011782	ATT	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
4	NC_011782	CCT	2	6	446	451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218875588
5	NC_011782	CAA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875588
6	NC_011782	TAT	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
7	NC_011782	ATT	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
8	NC_011782	ACT	3	9	638	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875588
9	NC_011782	AAT	2	6	667	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011782	TAA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875594
11	NC_011782	TTG	2	6	1106	1111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875594
12	NC_011782	AAT	2	6	1307	1312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011782	ATT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011782	GAT	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875592
15	NC_011782	ATT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011782	AAT	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011782	ATA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011782	CAA	2	6	1726	1731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011782	TAT	2	6	1812	1817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011782	CAA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011782	ACT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011782	CTA	3	9	1913	1921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011782	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875584
24	NC_011782	ACA	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875584
25	NC_011782	TAG	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875584
26	NC_011782	TTA	2	6	2233	2238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875584
27	NC_011782	AAC	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875584
28	NC_011782	TAA	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875584
29	NC_011782	TAC	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875584
30	NC_011782	ACT	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875584
31	NC_011782	GTT	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011782	TAA	2	6	2560	2565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011782	TAT	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011782	TTA	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011782	ACT	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011782	TAT	2	6	2727	2732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011782	GAA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011782	ACT	3	9	2768	2776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011782	TAA	2	6	3053	3058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011782	TAA	2	6	3069	3074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011782	GTT	2	6	3232	3237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011782	ATT	2	6	3291	3296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011782	ATA	2	6	3310	3315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011782	TAA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011782	TCC	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011782	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011782	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011782	CAA	2	6	3804	3809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011782	TAT	2	6	3851	3856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011782	TAA	2	6	3955	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011782	TAA	3	9	4003	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011782	AGA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011782	TAA	2	6	4056	4061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011782	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011782	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011782	ATA	2	6	4148	4153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011782	ATT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011782	ACA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011782	ATG	2	6	4272	4277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875582
60	NC_011782	TTA	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875582
61	NC_011782	ATA	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875582
62	NC_011782	AGA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875582
63	NC_011782	AAG	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875582
64	NC_011782	TAA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011782	TAA	3	9	4555	4563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011782	AAG	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011782	TAA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011782	TAA	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011782	TAA	2	6	4767	4772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011782	TAT	2	6	4802	4807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011782	TCA	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011782	TAT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011782	AAT	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011782	TCT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011782	ATT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011782	TAA	2	6	5016	5021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011782	TAT	2	6	5063	5068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011782	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011782	TGA	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011782	TAA	3	9	5204	5212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011782	TTA	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011782	TAT	2	6	5280	5285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011782	ATT	2	6	5446	5451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011782	TAG	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011782	ATC	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011782	CAA	2	6	5569	5574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011782	ACT	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011782	ATT	2	6	5640	5645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011782	ATA	2	6	5661	5666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011782	TCA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875587
91	NC_011782	ATA	2	6	6184	6189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875587
92	NC_011782	TTA	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875587
93	NC_011782	ATA	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875587
94	NC_011782	GAA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875587
95	NC_011782	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875587
96	NC_011782	GAT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011782	TAA	2	6	6400	6405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011782	AAT	2	6	6463	6468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011782	ATT	2	6	6489	6494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011782	CCA	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218875591
101	NC_011782	TTA	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
102	NC_011782	CAT	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875591
103	NC_011782	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218875591
104	NC_011782	TAT	2	6	6624	6629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
105	NC_011782	CAA	2	6	6642	6647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875591
106	NC_011782	ATA	2	6	6671	6676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
107	NC_011782	TGT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875591
108	NC_011782	TAA	2	6	6761	6766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
109	NC_011782	ACA	2	6	6767	6772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875591
110	NC_011782	TTA	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
111	NC_011782	AAT	2	6	6954	6959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
112	NC_011782	ATA	2	6	7148	7153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011782	TAT	3	9	7210	7218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011782	GTT	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011782	ATT	2	6	7331	7336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
116	NC_011782	TAT	2	6	7468	7473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
117	NC_011782	GAA	2	6	7562	7567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875585
118	NC_011782	ATG	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875585
119	NC_011782	TAT	2	6	7714	7719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
120	NC_011782	AAC	2	6	7757	7762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
121	NC_011782	TAC	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875585
122	NC_011782	AAC	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
123	NC_011782	GAA	2	6	7943	7948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875585
124	NC_011782	CAA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
125	NC_011782	TCT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875585
126	NC_011782	AAT	2	6	8108	8113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875585
127	NC_011782	TTA	2	6	8180	8185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
128	NC_011782	ATT	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
129	NC_011782	AGA	2	6	8469	8474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
130	NC_011782	AGA	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
131	NC_011782	AGA	2	6	8602	8607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
132	NC_011782	ATT	2	6	8792	8797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011782	AAT	2	6	8835	8840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011782	CAA	2	6	8861	8866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011782	ATA	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
136	NC_011782	TAA	2	6	8933	8938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
137	NC_011782	AGA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875589
138	NC_011782	ATA	2	6	9148	9153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
139	NC_011782	TAA	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
140	NC_011782	ATA	2	6	9178	9183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.