MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp17

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011782	AAT	2	6	259	264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011782	AAT	2	6	667	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011782	AAT	2	6	1307	1312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011782	ATT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011782	ATT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011782	AAT	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011782	ATA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011782	CAA	2	6	1726	1731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011782	TAT	2	6	1812	1817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011782	CAA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011782	ACT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011782	CTA	3	9	1913	1921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011782	GTT	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011782	TAA	2	6	2560	2565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011782	TAT	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011782	TTA	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011782	ACT	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011782	TAT	2	6	2727	2732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011782	GAA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011782	ACT	3	9	2768	2776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011782	TAA	2	6	3053	3058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011782	TAA	2	6	3069	3074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011782	GTT	2	6	3232	3237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011782	ATT	2	6	3291	3296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011782	ATA	2	6	3310	3315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011782	TAA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011782	TCC	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011782	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011782	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011782	CAA	2	6	3804	3809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011782	TAT	2	6	3851	3856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011782	TAA	2	6	3955	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011782	TAA	3	9	4003	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011782	AGA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011782	TAA	2	6	4056	4061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011782	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011782	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011782	ATA	2	6	4148	4153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011782	ATT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011782	ACA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011782	TAA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011782	TAA	3	9	4555	4563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011782	AAG	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011782	TAA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011782	TAA	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011782	TAA	2	6	4767	4772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011782	TAT	2	6	4802	4807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011782	TCA	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011782	TAT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011782	AAT	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011782	TCT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011782	ATT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011782	TAA	2	6	5016	5021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011782	TAT	2	6	5063	5068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011782	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011782	TGA	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011782	TAA	3	9	5204	5212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011782	TTA	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011782	TAT	2	6	5280	5285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011782	ATT	2	6	5446	5451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011782	TAG	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011782	ATC	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011782	CAA	2	6	5569	5574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011782	ACT	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011782	ATT	2	6	5640	5645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011782	ATA	2	6	5661	5666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011782	GAT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011782	TAA	2	6	6400	6405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011782	AAT	2	6	6463	6468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011782	ATT	2	6	6489	6494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011782	ATA	2	6	7148	7153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011782	TAT	3	9	7210	7218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011782	GTT	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011782	ATT	2	6	8792	8797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011782	AAT	2	6	8835	8840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011782	CAA	2	6	8861	8866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011782	TAT	3	9	10031	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011782	ATT	2	6	10538	10543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011782	ATT	2	6	10607	10612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011782	GTA	2	6	10613	10618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011782	ATA	2	6	10643	10648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011782	ATT	2	6	10789	10794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011782	AAT	2	6	10807	10812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011782	TTA	2	6	11166	11171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011782	ATT	2	6	11326	11331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011782	TAA	4	12	11332	11343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011782	TGT	2	6	12153	12158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011782	TAA	2	6	12238	12243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011782	AAT	2	6	12246	12251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011782	GAA	2	6	12252	12257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011782	ATT	2	6	12399	12404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011782	TAT	2	6	12523	12528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011782	TTA	2	6	12684	12689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011782	TAA	3	9	12870	12878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011782	TTA	2	6	13066	13071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011782	TAA	2	6	13104	13109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011782	TCA	2	6	13195	13200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011782	GTG	2	6	13249	13254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011782	TAA	2	6	13280	13285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011782	TAG	2	6	13455	13460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011782	AAT	2	6	13685	13690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011782	TAA	2	6	14739	14744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011782	AGT	2	6	14873	14878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011782	TGA	2	6	14944	14949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011782	ATT	2	6	14964	14969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011782	AGA	2	6	14979	14984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011782	TAT	2	6	15057	15062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011782	TCA	2	6	15084	15089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011782	ATT	2	6	15152	15157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011782	ATT	2	6	15190	15195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011782	ATA	2	6	15201	15206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011782	ATA	2	6	15455	15460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011782	TAA	3	9	15600	15608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011782	TTA	2	6	15611	15616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011782	TAG	3	9	15623	15631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011782	ATA	2	6	15643	15648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011782	AGT	3	9	15662	15670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011782	TAA	2	6	15707	15712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011782	GAA	2	6	15786	15791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011782	TTA	2	6	15909	15914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011782	TAA	2	6	16128	16133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011782	TAG	2	6	16203	16208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011782	TTG	2	6	16214	16219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011782	TAA	2	6	16296	16301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011782	TTA	3	9	16313	16321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011782	TAA	3	9	16360	16368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011782	ATT	2	6	16472	16477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011782	ATA	2	6	16742	16747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011782	TAT	2	6	16752	16757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011782	ATA	2	6	16845	16850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011782	ATT	2	6	16867	16872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011782	GTT	2	6	16963	16968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011782	AAT	2	6	17089	17094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011782	GTA	2	6	17164	17169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011782	TAT	2	6	17176	17181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011782	TTA	2	6	17215	17220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011782	TAT	2	6	17259	17264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.