MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp17

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011782	AAC	2	6	303	308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875588
2	NC_011782	ATT	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
3	NC_011782	CCT	2	6	446	451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218875588
4	NC_011782	CAA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875588
5	NC_011782	TAT	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
6	NC_011782	ATT	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
7	NC_011782	ACT	3	9	638	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875588
8	NC_011782	TAA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875594
9	NC_011782	TTG	2	6	1106	1111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875594
10	NC_011782	GAT	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875592
11	NC_011782	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875584
12	NC_011782	ACA	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875584
13	NC_011782	TAG	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875584
14	NC_011782	TTA	2	6	2233	2238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875584
15	NC_011782	AAC	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875584
16	NC_011782	TAA	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875584
17	NC_011782	TAC	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875584
18	NC_011782	ACT	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875584
19	NC_011782	ATG	2	6	4272	4277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875582
20	NC_011782	TTA	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875582
21	NC_011782	ATA	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875582
22	NC_011782	AGA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875582
23	NC_011782	AAG	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875582
24	NC_011782	TCA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875587
25	NC_011782	ATA	2	6	6184	6189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875587
26	NC_011782	TTA	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875587
27	NC_011782	ATA	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875587
28	NC_011782	GAA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875587
29	NC_011782	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875587
30	NC_011782	CCA	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218875591
31	NC_011782	TTA	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
32	NC_011782	CAT	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875591
33	NC_011782	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218875591
34	NC_011782	TAT	2	6	6624	6629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
35	NC_011782	CAA	2	6	6642	6647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875591
36	NC_011782	ATA	2	6	6671	6676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
37	NC_011782	TGT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875591
38	NC_011782	TAA	2	6	6761	6766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
39	NC_011782	ACA	2	6	6767	6772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875591
40	NC_011782	TTA	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
41	NC_011782	AAT	2	6	6954	6959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
42	NC_011782	ATT	2	6	7331	7336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
43	NC_011782	TAT	2	6	7468	7473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
44	NC_011782	GAA	2	6	7562	7567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875585
45	NC_011782	ATG	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875585
46	NC_011782	TAT	2	6	7714	7719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
47	NC_011782	AAC	2	6	7757	7762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
48	NC_011782	TAC	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875585
49	NC_011782	AAC	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
50	NC_011782	GAA	2	6	7943	7948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875585
51	NC_011782	CAA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
52	NC_011782	TCT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875585
53	NC_011782	AAT	2	6	8108	8113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875585
54	NC_011782	TTA	2	6	8180	8185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
55	NC_011782	ATT	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
56	NC_011782	AGA	2	6	8469	8474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
57	NC_011782	AGA	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
58	NC_011782	AGA	2	6	8602	8607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
59	NC_011782	ATA	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
60	NC_011782	TAA	2	6	8933	8938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
61	NC_011782	AGA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875589
62	NC_011782	ATA	2	6	9148	9153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
63	NC_011782	TAA	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
64	NC_011782	ATA	2	6	9178	9183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
65	NC_011782	TAA	2	6	9241	9246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
66	NC_011782	ATT	2	6	9333	9338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875589
67	NC_011782	TAA	2	6	9350	9355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
68	NC_011782	CAA	2	6	9413	9418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875589
69	NC_011782	AAT	2	6	9432	9437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
70	NC_011782	CAA	2	6	9650	9655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875589
71	NC_011782	GAA	2	6	9714	9719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875589
72	NC_011782	GAT	2	6	9788	9793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875589
73	NC_011782	ATT	2	6	9918	9923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875589
74	NC_011782	GAA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875593
75	NC_011782	TAT	3	9	10302	10310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875593
76	NC_011782	TAA	2	6	10462	10467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875593
77	NC_011782	ATA	2	6	10485	10490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875593
78	NC_011782	TAG	2	6	11431	11436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875583
79	NC_011782	TGT	3	9	11439	11447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875583
80	NC_011782	TTA	2	6	11496	11501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875583
81	NC_011782	ATT	2	6	11550	11555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875583
82	NC_011782	TCT	2	6	11571	11576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875583
83	NC_011782	ATA	2	6	11630	11635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875583
84	NC_011782	TCG	2	6	11664	11669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218875583
85	NC_011782	ATT	2	6	11691	11696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875583
86	NC_011782	TAA	2	6	11737	11742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875583
87	NC_011782	GGT	2	6	13736	13741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218875590
88	NC_011782	TTC	2	6	13834	13839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875590
89	NC_011782	GAA	2	6	13894	13899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875590
90	NC_011782	AGT	2	6	13915	13920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875590
91	NC_011782	AGA	2	6	13976	13981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875590
92	NC_011782	GAT	2	6	14021	14026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875590
93	NC_011782	GAA	2	6	14103	14108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875590
94	NC_011782	TTA	2	6	14130	14135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875590
95	NC_011782	AGA	2	6	14185	14190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875590
96	NC_011782	ATT	2	6	14240	14245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875590
97	NC_011782	TAA	2	6	14257	14262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875590
98	NC_011782	ATT	2	6	14382	14387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875590
99	NC_011782	AGA	2	6	14463	14468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875586
100	NC_011782	ATT	2	6	14470	14475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875586
101	NC_011782	ATA	2	6	14513	14518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875586
102	NC_011782	TTA	2	6	14522	14527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875586
103	NC_011782	TAA	2	6	14704	14709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875586

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.