MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011780	AAAG	2	8	6578	6585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011780	AAAG	2	8	6912	6919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011780	AAAG	2	8	7002	7009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011780	TTAT	2	8	7159	7166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011780	TTAA	2	8	7397	7404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011780	TTAA	2	8	7426	7433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011780	CAAT	2	8	8228	8235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011780	AAAT	2	8	8274	8281	75 %	25 %	0 %	0 %	218875345
9	NC_011780	TAAT	2	8	8552	8559	50 %	50 %	0 %	0 %	218875345
10	NC_011780	TAAA	2	8	9345	9352	75 %	25 %	0 %	0 %	218875345
11	NC_011780	TTAA	2	8	9356	9363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011780	CAAA	2	8	10138	10145	75 %	0 %	0 %	25 %	218875349
13	NC_011780	AAAT	2	8	10156	10163	75 %	25 %	0 %	0 %	218875349
14	NC_011780	TAAT	2	8	10267	10274	50 %	50 %	0 %	0 %	218875349
15	NC_011780	ATTG	2	8	10292	10299	25 %	50 %	25 %	0 %	218875349
16	NC_011780	TTAA	2	8	10584	10591	50 %	50 %	0 %	0 %	218875349
17	NC_011780	TAGA	2	8	11197	11204	50 %	25 %	25 %	0 %	218875344
18	NC_011780	TTAA	2	8	11506	11513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011780	ATTT	2	8	11521	11528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011780	CTTG	2	8	11533	11540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011780	TATT	2	8	11623	11630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011780	AAAT	2	8	11742	11749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011780	TTGT	2	8	11876	11883	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011780	TTAA	2	8	11948	11955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011780	AAAC	2	8	12726	12733	75 %	0 %	0 %	25 %	218875347
26	NC_011780	TTAA	2	8	13041	13048	50 %	50 %	0 %	0 %	218875353
27	NC_011780	ATTT	2	8	13354	13361	25 %	75 %	0 %	0 %	218875351
28	NC_011780	AACA	2	8	13403	13410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011780	AATA	2	8	13418	13425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011780	TTAA	2	8	15238	15245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011780	ATTT	2	8	15489	15496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011780	ACTA	2	8	15586	15593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011780	TTGT	2	8	15764	15771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011780	TAAG	2	8	16050	16057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011780	ATTT	2	8	16249	16256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011780	AAAG	2	8	16277	16284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011780	ATTT	2	8	16431	16438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011780	ATAA	2	8	16844	16851	75 %	25 %	0 %	0 %	218875342
39	NC_011780	TATT	2	8	17344	17351	25 %	75 %	0 %	0 %	218875342
40	NC_011780	ATTT	2	8	18416	18423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011780	AATA	2	8	19329	19336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011780	TATT	2	8	19477	19484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011780	CTCC	2	8	20026	20033	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_011780	TAAT	2	8	20331	20338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011780	GAAA	2	8	20639	20646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011780	AATC	2	8	20684	20691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011780	TAAA	2	8	20846	20853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011780	TATT	2	8	20982	20989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011780	ATCT	2	8	21202	21209	25 %	50 %	0 %	25 %	218875352
50	NC_011780	TATG	2	8	21246	21253	25 %	50 %	25 %	0 %	218875352
51	NC_011780	AATA	2	8	21387	21394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011780	TTTC	2	8	22063	22070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011780	ATCT	2	8	22364	22371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011780	AGGT	2	8	22447	22454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011780	TTGG	2	8	22475	22482	0 %	50 %	50 %	0 %	218875341
56	NC_011780	AGTG	2	8	22717	22724	25 %	25 %	50 %	0 %	218875341
57	NC_011780	TTCT	2	8	22751	22758	0 %	75 %	0 %	25 %	218875341
58	NC_011780	GTTT	2	8	23087	23094	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.