MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011780	TTA	2	6	8364	8369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875345
2	NC_011780	TAA	3	9	8373	8381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
3	NC_011780	AAG	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
4	NC_011780	AAG	2	6	8402	8407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
5	NC_011780	TAA	2	6	8616	8621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
6	NC_011780	TAG	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875345
7	NC_011780	TAA	3	9	8676	8684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
8	NC_011780	AGA	2	6	8685	8690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
9	NC_011780	CAA	2	6	8920	8925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875345
10	NC_011780	AAG	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
11	NC_011780	AGA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875345
12	NC_011780	ATA	2	6	9155	9160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
13	NC_011780	ATT	2	6	9230	9235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875345
14	NC_011780	ATT	2	6	9278	9283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875345
15	NC_011780	TAA	2	6	9315	9320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875345
16	NC_011780	TTA	2	6	9382	9387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875350
17	NC_011780	TAA	2	6	9519	9524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
18	NC_011780	TAA	2	6	9567	9572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
19	NC_011780	ATG	2	6	9614	9619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875350
20	NC_011780	ACA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875350
21	NC_011780	TAA	2	6	9836	9841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
22	NC_011780	GGA	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218875350
23	NC_011780	ATA	2	6	9930	9935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875350
24	NC_011780	ATT	2	6	9981	9986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875349
25	NC_011780	TAA	2	6	10010	10015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875349
26	NC_011780	TAC	2	6	10104	10109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875349
27	NC_011780	AAT	3	9	10161	10169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875349
28	NC_011780	AAG	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875349
29	NC_011780	ATT	2	6	10238	10243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875349
30	NC_011780	AAT	3	9	10272	10280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875349
31	NC_011780	CCT	2	6	10305	10310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218875349
32	NC_011780	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875349
33	NC_011780	TTA	2	6	10480	10485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875349
34	NC_011780	AAG	2	6	10639	10644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875349
35	NC_011780	GAT	2	6	10791	10796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875344
36	NC_011780	AAG	2	6	10829	10834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875344
37	NC_011780	TGA	2	6	10934	10939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875344
38	NC_011780	TAG	2	6	11063	11068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875344
39	NC_011780	GAA	2	6	11244	11249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875344
40	NC_011780	AAC	2	6	12420	12425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875347
41	NC_011780	AAG	2	6	12442	12447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875347
42	NC_011780	ATA	2	6	12462	12467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875347
43	NC_011780	ATT	2	6	12658	12663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875347
44	NC_011780	TAA	2	6	12734	12739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875347
45	NC_011780	TAA	2	6	12779	12784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875347
46	NC_011780	GAA	2	6	13073	13078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875353
47	NC_011780	GAA	3	9	13092	13100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875353
48	NC_011780	AGA	2	6	13124	13129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875353
49	NC_011780	AAT	2	6	16645	16650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
50	NC_011780	TCA	2	6	16689	16694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875342
51	NC_011780	TAA	2	6	16765	16770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
52	NC_011780	TCA	2	6	16824	16829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875342
53	NC_011780	TAA	2	6	16915	16920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
54	NC_011780	CAA	2	6	16966	16971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875342
55	NC_011780	TCT	2	6	17043	17048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875342
56	NC_011780	AAC	2	6	17076	17081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875342
57	NC_011780	TTA	2	6	17178	17183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875342
58	NC_011780	TCG	2	6	17238	17243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218875342
59	NC_011780	AAT	2	6	17246	17251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875342
60	NC_011780	ATT	2	6	17280	17285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875342
61	NC_011780	TAT	3	9	17306	17314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875342
62	NC_011780	AAC	2	6	17318	17323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875342
63	NC_011780	GAT	2	6	17412	17417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875342
64	NC_011780	ATT	2	6	18876	18881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875348
65	NC_011780	ATT	2	6	19571	19576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875346
66	NC_011780	AAT	2	6	19626	19631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875346
67	NC_011780	GAT	2	6	19647	19652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875346
68	NC_011780	ATA	2	6	19753	19758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875346
69	NC_011780	TTC	2	6	19775	19780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875346
70	NC_011780	TAA	2	6	19808	19813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875346
71	NC_011780	TAG	2	6	21254	21259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875352
72	NC_011780	AAC	2	6	21264	21269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875352
73	NC_011780	ATG	2	6	21275	21280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875352
74	NC_011780	GTT	2	6	22512	22517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875341
75	NC_011780	AGT	2	6	22571	22576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875341
76	NC_011780	GTA	2	6	22706	22711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875341
77	NC_011780	GAG	2	6	22733	22738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218875341
78	NC_011780	TAA	2	6	22744	22749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875341
79	NC_011780	GTT	2	6	22795	22800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875341
80	NC_011780	TAT	2	6	22801	22806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875341
81	NC_011780	AAT	2	6	22826	22831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875341
82	NC_011780	GAG	2	6	22871	22876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218875341

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.