MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011779	TAATAT	2	12	2136	2147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011779	ATTAAT	2	12	2163	2174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011779	TTAAAT	2	12	2818	2829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011779	ATTCTT	2	12	6164	6175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218868777
5	NC_011779	TAGAAA	2	12	6953	6964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218868797
6	NC_011779	AAAAGA	2	12	7384	7395	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011779	TATCAA	2	12	7457	7468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011779	TGAGCT	2	12	9879	9890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218868773
9	NC_011779	GCTCTC	2	12	10831	10842	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218868772
10	NC_011779	TGATCT	2	12	11707	11718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218868781
11	NC_011779	TTCAAT	2	12	13572	13583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218868774
12	NC_011779	GTTGCA	2	12	14741	14752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218868788
13	NC_011779	CTCAGC	2	12	15301	15312	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218868784
14	NC_011779	TCTTTA	2	12	19520	19531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218868789
15	NC_011779	CATTAA	2	12	20034	20045	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218868792
16	NC_011779	CTCGTA	2	12	20734	20745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218868792
17	NC_011779	AAGGAA	2	12	24926	24937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868769
18	NC_011779	AGAGAA	2	12	25741	25752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868769
19	NC_011779	GCAAAC	2	12	25806	25817	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218868769
20	NC_011779	TGAAAA	2	12	27188	27199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218868796

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.