MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011779	ATT	3	9	72	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011779	AAT	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011779	TAT	2	6	111	116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011779	ATA	3	9	1126	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011779	CTA	2	6	1174	1179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011779	ATA	2	6	1189	1194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011779	AAT	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011779	ATA	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011779	TAA	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011779	CAA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011779	ATT	2	6	1362	1367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011779	AAG	2	6	1399	1404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011779	AGA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011779	ATT	2	6	1587	1592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011779	GTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011779	CAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011779	AGA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011779	TTA	2	6	1804	1809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011779	AAG	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011779	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011779	ATT	2	6	2124	2129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011779	AGG	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011779	TGG	3	9	2348	2356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011779	ACT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011779	AGG	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011779	TAA	2	6	2456	2461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011779	GGA	2	6	2464	2469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011779	TAT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011779	AGG	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011779	ATT	3	9	2521	2529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011779	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011779	CTT	2	6	2728	2733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011779	ATT	2	6	2780	2785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011779	TAC	2	6	2795	2800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011779	TAT	2	6	2809	2814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011779	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011779	ACT	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011779	ACT	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011779	TAA	2	6	3312	3317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011779	GAT	2	6	3478	3483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011779	ACT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011779	TCT	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011779	ATC	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011779	CTA	3	9	3637	3645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011779	ATT	2	6	3754	3759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011779	TTC	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011779	TAA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011779	ATT	2	6	3961	3966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011779	TAA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011779	TTA	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011779	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011779	ATA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011779	TAT	2	6	7469	7474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011779	ATT	3	9	10800	10808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011779	TCA	2	6	10809	10814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011779	CCT	2	6	14391	14396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011779	CCT	2	6	15480	15485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011779	TTG	2	6	18856	18861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011779	CAA	2	6	24261	24266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011779	ATT	2	6	24282	24287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011779	AGG	2	6	26013	26018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011779	ATA	2	6	26449	26454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011779	AGG	2	6	26455	26460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011779	GTT	2	6	26517	26522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011779	CAG	2	6	26535	26540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011779	ATT	2	6	26577	26582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011779	TGA	2	6	26611	26616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011779	TAG	2	6	28057	28062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011779	AAG	2	6	29642	29647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.