MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2

Total Repeats: 335

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011779	ATT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
2	NC_011779	GGA	2	6	194	199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868770
3	NC_011779	AAT	2	6	257	262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
4	NC_011779	AAG	2	6	267	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
5	NC_011779	AAG	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
6	NC_011779	AGG	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868770
7	NC_011779	CTA	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868770
8	NC_011779	GAA	2	6	503	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
9	NC_011779	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868770
10	NC_011779	AGA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
11	NC_011779	TTC	2	6	549	554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868770
12	NC_011779	TAA	2	6	615	620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
13	NC_011779	ATG	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868770
14	NC_011779	CAT	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868770
15	NC_011779	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
16	NC_011779	AGC	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218868770
17	NC_011779	TAT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
18	NC_011779	ATA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868770
19	NC_011779	TTA	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
20	NC_011779	AAG	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
21	NC_011779	GAA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868770
22	NC_011779	TTA	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868770
23	NC_011779	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
24	NC_011779	TAA	2	6	4327	4332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
25	NC_011779	CAA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
26	NC_011779	ACA	2	6	4363	4368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
27	NC_011779	TTC	2	6	4380	4385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868794
28	NC_011779	ATA	2	6	4416	4421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
29	NC_011779	AAC	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
30	NC_011779	ACT	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868794
31	NC_011779	ATT	2	6	4605	4610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
32	NC_011779	TAA	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
33	NC_011779	ATA	2	6	4746	4751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
34	NC_011779	ATA	3	9	4755	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
35	NC_011779	AGA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868794
36	NC_011779	TAA	2	6	4806	4811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
37	NC_011779	TTA	2	6	4838	4843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
38	NC_011779	TTC	2	6	4851	4856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868794
39	NC_011779	TAA	2	6	4876	4881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
40	NC_011779	CAA	3	9	5015	5023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
41	NC_011779	AAC	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868794
42	NC_011779	ATA	2	6	5322	5327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
43	NC_011779	TAA	3	9	5335	5343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
44	NC_011779	TTA	3	9	5344	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
45	NC_011779	ATT	2	6	5356	5361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868794
46	NC_011779	ATA	2	6	5366	5371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868794
47	NC_011779	AAG	2	6	5397	5402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868794
48	NC_011779	TTA	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
49	NC_011779	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868786
50	NC_011779	TAA	2	6	5566	5571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868786
51	NC_011779	ATT	2	6	5605	5610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
52	NC_011779	GAA	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868786
53	NC_011779	GAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868786
54	NC_011779	TTA	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
55	NC_011779	ATT	2	6	5869	5874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
56	NC_011779	TAT	2	6	5985	5990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868786
57	NC_011779	GAG	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868777
58	NC_011779	CTT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868777
59	NC_011779	CAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868777
60	NC_011779	TAA	2	6	6066	6071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
61	NC_011779	ATC	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868777
62	NC_011779	TAA	2	6	6176	6181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
63	NC_011779	TGT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868777
64	NC_011779	AAG	2	6	6272	6277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868777
65	NC_011779	ATT	2	6	6320	6325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868777
66	NC_011779	AGA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868777
67	NC_011779	TAA	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
68	NC_011779	AAT	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
69	NC_011779	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868777
70	NC_011779	TTA	2	6	6577	6582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868777
71	NC_011779	ATA	2	6	6643	6648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868777
72	NC_011779	TAC	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868777
73	NC_011779	TAA	3	9	6799	6807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868797
74	NC_011779	GAA	2	6	6846	6851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868797
75	NC_011779	GAT	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868797
76	NC_011779	GAA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868797
77	NC_011779	TGA	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868797
78	NC_011779	TAA	2	6	7168	7173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868797
79	NC_011779	CAC	2	6	7174	7179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218868797
80	NC_011779	TTA	2	6	7285	7290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868797
81	NC_011779	AGA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868797
82	NC_011779	ATT	2	6	7625	7630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868773
83	NC_011779	TCT	2	6	7671	7676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
84	NC_011779	AAT	2	6	7679	7684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868773
85	NC_011779	CCA	2	6	7937	7942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218868773
86	NC_011779	GGT	2	6	8063	8068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218868773
87	NC_011779	TTC	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
88	NC_011779	TCA	2	6	8190	8195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868773
89	NC_011779	TCA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868773
90	NC_011779	TTC	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
91	NC_011779	CAG	3	9	8428	8436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218868773
92	NC_011779	TGT	2	6	8471	8476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868773
93	NC_011779	TTC	2	6	8534	8539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
94	NC_011779	TCA	2	6	9009	9014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868773
95	NC_011779	ATT	2	6	9063	9068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868773
96	NC_011779	TTA	2	6	9297	9302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868773
97	NC_011779	TCT	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
98	NC_011779	AAC	2	6	9660	9665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868773
99	NC_011779	ATC	2	6	9810	9815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868773
100	NC_011779	TGT	2	6	9873	9878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868773
101	NC_011779	CTT	2	6	9901	9906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
102	NC_011779	CTT	2	6	10030	10035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
103	NC_011779	TCT	2	6	10086	10091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
104	NC_011779	CCA	2	6	10161	10166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218868773
105	NC_011779	TAG	2	6	10237	10242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868773
106	NC_011779	CTT	2	6	10354	10359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868773
107	NC_011779	TCA	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868773
108	NC_011779	ATA	2	6	10443	10448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868773
109	NC_011779	GCC	2	6	10461	10466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218868773
110	NC_011779	CCT	2	6	10515	10520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218868773
111	NC_011779	TGC	2	6	10564	10569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868773
112	NC_011779	ATC	2	6	10703	10708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868773
113	NC_011779	ATT	2	6	10772	10777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868773
114	NC_011779	GCC	2	6	10909	10914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218868772
115	NC_011779	TTG	2	6	11235	11240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868787
116	NC_011779	CGA	2	6	11252	11257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218868787
117	NC_011779	TTG	2	6	11309	11314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868787
118	NC_011779	TCT	3	9	11443	11451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868787
119	NC_011779	TTG	2	6	11534	11539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868787
120	NC_011779	CCT	2	6	11540	11545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218868781
121	NC_011779	GAA	2	6	11553	11558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868781
122	NC_011779	CCA	2	6	11687	11692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218868781
123	NC_011779	ATT	2	6	11793	11798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868781
124	NC_011779	TTA	2	6	11860	11865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868781
125	NC_011779	GTT	2	6	11947	11952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868781
126	NC_011779	TTG	2	6	11972	11977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868781
127	NC_011779	TCA	2	6	12034	12039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868781
128	NC_011779	TAG	2	6	12085	12090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868781
129	NC_011779	TGC	2	6	12095	12100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868781
130	NC_011779	CTT	2	6	12101	12106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868781
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132	NC_011779	ATT	3	9	12258	12266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868781
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.