MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011778	AATA	2	8	89	96	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011778	ATTA	2	8	123	130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011778	GTTT	2	8	197	204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011778	TAAT	2	8	404	411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011778	AATT	2	8	602	609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011778	AGAT	2	8	770	777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011778	TGAT	2	8	803	810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011778	CTTT	2	8	839	846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011778	AAAT	2	8	1122	1129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011778	CTTT	2	8	1891	1898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011778	TTTC	2	8	2213	2220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011778	ATTA	2	8	2884	2891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011778	TTAA	2	8	2951	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011778	TAAT	2	8	3050	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011778	TTTC	2	8	3623	3630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011778	AATA	2	8	3718	3725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011778	AAAT	2	8	3900	3907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011778	CAAA	2	8	3970	3977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011778	TATT	2	8	4247	4254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011778	GATT	2	8	4568	4575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011778	ATTC	2	8	4818	4825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011778	TATT	2	8	4860	4867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011778	CAAA	2	8	5029	5036	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011778	CTCA	2	8	5344	5351	25 %	25 %	0 %	50 %	218868691
25	NC_011778	ATTA	2	8	5674	5681	50 %	50 %	0 %	0 %	218868691
26	NC_011778	TAAT	2	8	6643	6650	50 %	50 %	0 %	0 %	218868686
27	NC_011778	TAAG	2	8	6776	6783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011778	TATT	2	8	6883	6890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011778	TAAA	2	8	6917	6924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011778	TAAT	2	8	7692	7699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011778	TAAT	2	8	8419	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	218868684
32	NC_011778	ACAA	2	8	8805	8812	75 %	0 %	0 %	25 %	218868684
33	NC_011778	ATTT	2	8	8904	8911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011778	TTTA	2	8	9242	9249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011778	ATTT	2	8	9286	9293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011778	TAAA	2	8	9312	9319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011778	ATAA	2	8	9404	9411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011778	TAAA	2	8	9910	9917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011778	GCTA	2	8	10092	10099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011778	TATT	2	8	10120	10127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011778	ATAA	2	8	10293	10300	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
42	NC_011778	ATTT	2	8	10304	10311	25 %	75 %	0 %	0 %	218868679
43	NC_011778	ATAA	2	8	10588	10595	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
44	NC_011778	TAAA	2	8	10787	10794	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
45	NC_011778	GAAG	2	8	10963	10970	50 %	0 %	50 %	0 %	218868679
46	NC_011778	GCAT	2	8	11152	11159	25 %	25 %	25 %	25 %	218868679
47	NC_011778	ATAA	2	8	11254	11261	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
48	NC_011778	TGAT	2	8	11447	11454	25 %	50 %	25 %	0 %	218868679
49	NC_011778	ATAA	2	8	12148	12155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011778	AATA	2	8	12233	12240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011778	TTGT	2	8	12271	12278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011778	ATTA	2	8	12303	12310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011778	AAAT	2	8	12382	12389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011778	ATTA	2	8	12507	12514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011778	TAAA	2	8	12566	12573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011778	TAGA	2	8	13157	13164	50 %	25 %	25 %	0 %	218868669
57	NC_011778	TAAT	2	8	13470	13477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011778	TTTC	2	8	13620	13627	0 %	75 %	0 %	25 %	218868683
59	NC_011778	AAAT	2	8	14067	14074	75 %	25 %	0 %	0 %	218868683
60	NC_011778	ATCA	2	8	14200	14207	50 %	25 %	0 %	25 %	218868683
61	NC_011778	ATTT	2	8	14324	14331	25 %	75 %	0 %	0 %	218868683
62	NC_011778	AAAT	2	8	14625	14632	75 %	25 %	0 %	0 %	218868673
63	NC_011778	AAGT	2	8	14672	14679	50 %	25 %	25 %	0 %	218868673
64	NC_011778	TTTG	2	8	14694	14701	0 %	75 %	25 %	0 %	218868673
65	NC_011778	ACTA	2	8	14712	14719	50 %	25 %	0 %	25 %	218868673
66	NC_011778	CTTT	2	8	15276	15283	0 %	75 %	0 %	25 %	218868689
67	NC_011778	TCTT	2	8	15302	15309	0 %	75 %	0 %	25 %	218868689
68	NC_011778	TTTA	2	8	15643	15650	25 %	75 %	0 %	0 %	218868689
69	NC_011778	AATA	2	8	15974	15981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011778	GAAA	2	8	16282	16289	75 %	0 %	25 %	0 %	218868678
71	NC_011778	AAAT	2	8	16680	16687	75 %	25 %	0 %	0 %	218868678
72	NC_011778	ACAA	2	8	16703	16710	75 %	0 %	0 %	25 %	218868678
73	NC_011778	AATA	2	8	16877	16884	75 %	25 %	0 %	0 %	218868678
74	NC_011778	TTAA	2	8	16913	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011778	TAAT	2	8	17078	17085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011778	TATT	2	8	17251	17258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011778	ATTT	2	8	17348	17355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011778	TAAT	2	8	17662	17669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011778	CTTA	2	8	18236	18243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011778	TACA	2	8	19240	19247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011778	TTTA	2	8	19308	19315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011778	ACTC	2	8	19352	19359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011778	TCCT	2	8	19693	19700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011778	TTTA	2	8	20127	20134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011778	AAAG	2	8	20220	20227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011778	AGAA	2	8	20578	20585	75 %	0 %	25 %	0 %	218868672
87	NC_011778	AAGT	2	8	21221	21228	50 %	25 %	25 %	0 %	218868672
88	NC_011778	AGTA	2	8	21653	21660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011778	TGCA	2	8	21687	21694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011778	ATTT	2	8	21965	21972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011778	AATA	2	8	22877	22884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011778	TATT	2	8	23025	23032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011778	CTTT	2	8	23210	23217	0 %	75 %	0 %	25 %	218868680
94	NC_011778	TTAT	2	8	23249	23256	25 %	75 %	0 %	0 %	218868680
95	NC_011778	AAGC	2	8	23440	23447	50 %	0 %	25 %	25 %	218868680
96	NC_011778	CTGC	2	8	23640	23647	0 %	25 %	25 %	50 %	218868680
97	NC_011778	TAAG	2	8	23763	23770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011778	ACTT	2	8	23803	23810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011778	AAGT	2	8	23819	23826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011778	AAAG	2	8	24315	24322	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011778	TTAT	2	8	24646	24653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011778	GAAT	2	8	24662	24669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011778	AATA	2	8	24866	24873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011778	AGAA	2	8	24959	24966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011778	TCTG	2	8	26094	26101	0 %	50 %	25 %	25 %	218868675
106	NC_011778	ATAA	2	8	26171	26178	75 %	25 %	0 %	0 %	218868675
107	NC_011778	CTTT	2	8	26353	26360	0 %	75 %	0 %	25 %	218868675
108	NC_011778	GCTT	2	8	26671	26678	0 %	50 %	25 %	25 %	218868674
109	NC_011778	AGAA	2	8	27180	27187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011778	TTAT	2	8	27365	27372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011778	AAGT	2	8	27373	27380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011778	TTTA	2	8	27444	27451	25 %	75 %	0 %	0 %	218868681
113	NC_011778	CTTT	2	8	28072	28079	0 %	75 %	0 %	25 %	218868681
114	NC_011778	TTTA	2	8	28437	28444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011778	AAGC	2	8	28821	28828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011778	ATCT	2	8	29236	29243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011778	ATGC	2	8	29584	29591	25 %	25 %	25 %	25 %	218868671
118	NC_011778	TTGC	2	8	29765	29772	0 %	50 %	25 %	25 %	218868671
119	NC_011778	ATTT	2	8	30116	30123	25 %	75 %	0 %	0 %	218868671
120	NC_011778	TAAG	2	8	31181	31188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011778	TGTA	2	8	31526	31533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011778	AATA	2	8	31584	31591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011778	ATTA	2	8	31596	31603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011778	TTGC	2	8	32112	32119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011778	ATTT	2	8	32475	32482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011778	TAAA	2	8	33042	33049	75 %	25 %	0 %	0 %	218868676
127	NC_011778	CTTT	2	8	33789	33796	0 %	75 %	0 %	25 %	218868677
128	NC_011778	CTTT	2	8	33843	33850	0 %	75 %	0 %	25 %	218868677
129	NC_011778	ATTT	2	8	34018	34025	25 %	75 %	0 %	0 %	218868677
130	NC_011778	AGAT	2	8	34198	34205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011778	TAAA	2	8	34238	34245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011778	ATAA	2	8	34270	34277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011778	ATTT	2	8	34278	34285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011778	TATT	2	8	34565	34572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011778	TCAT	2	8	34621	34628	25 %	50 %	0 %	25 %	218868685
136	NC_011778	AATT	2	8	34893	34900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011778	TATT	2	8	34965	34972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011778	AAAG	2	8	35269	35276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011778	TTTC	2	8	35490	35497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011778	ATCT	2	8	35791	35798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011778	AGGT	2	8	35874	35881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011778	TTGG	2	8	35902	35909	0 %	50 %	50 %	0 %	218868690
143	NC_011778	TTCT	2	8	36175	36182	0 %	75 %	0 %	25 %	218868690
144	NC_011778	GTTT	2	8	36508	36515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.