MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011778	CTCA	2	8	5344	5351	25 %	25 %	0 %	50 %	218868691
2	NC_011778	ATTA	2	8	5674	5681	50 %	50 %	0 %	0 %	218868691
3	NC_011778	TAAT	2	8	6643	6650	50 %	50 %	0 %	0 %	218868686
4	NC_011778	TAAT	2	8	8419	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	218868684
5	NC_011778	ACAA	2	8	8805	8812	75 %	0 %	0 %	25 %	218868684
6	NC_011778	ATAA	2	8	10293	10300	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
7	NC_011778	ATTT	2	8	10304	10311	25 %	75 %	0 %	0 %	218868679
8	NC_011778	ATAA	2	8	10588	10595	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
9	NC_011778	TAAA	2	8	10787	10794	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
10	NC_011778	GAAG	2	8	10963	10970	50 %	0 %	50 %	0 %	218868679
11	NC_011778	GCAT	2	8	11152	11159	25 %	25 %	25 %	25 %	218868679
12	NC_011778	ATAA	2	8	11254	11261	75 %	25 %	0 %	0 %	218868679
13	NC_011778	TGAT	2	8	11447	11454	25 %	50 %	25 %	0 %	218868679
14	NC_011778	TAGA	2	8	13157	13164	50 %	25 %	25 %	0 %	218868669
15	NC_011778	TTTC	2	8	13620	13627	0 %	75 %	0 %	25 %	218868683
16	NC_011778	AAAT	2	8	14067	14074	75 %	25 %	0 %	0 %	218868683
17	NC_011778	ATCA	2	8	14200	14207	50 %	25 %	0 %	25 %	218868683
18	NC_011778	ATTT	2	8	14324	14331	25 %	75 %	0 %	0 %	218868683
19	NC_011778	AAAT	2	8	14625	14632	75 %	25 %	0 %	0 %	218868673
20	NC_011778	AAGT	2	8	14672	14679	50 %	25 %	25 %	0 %	218868673
21	NC_011778	TTTG	2	8	14694	14701	0 %	75 %	25 %	0 %	218868673
22	NC_011778	ACTA	2	8	14712	14719	50 %	25 %	0 %	25 %	218868673
23	NC_011778	CTTT	2	8	15276	15283	0 %	75 %	0 %	25 %	218868689
24	NC_011778	TCTT	2	8	15302	15309	0 %	75 %	0 %	25 %	218868689
25	NC_011778	TTTA	2	8	15643	15650	25 %	75 %	0 %	0 %	218868689
26	NC_011778	GAAA	2	8	16282	16289	75 %	0 %	25 %	0 %	218868678
27	NC_011778	AAAT	2	8	16680	16687	75 %	25 %	0 %	0 %	218868678
28	NC_011778	ACAA	2	8	16703	16710	75 %	0 %	0 %	25 %	218868678
29	NC_011778	AATA	2	8	16877	16884	75 %	25 %	0 %	0 %	218868678
30	NC_011778	AGAA	2	8	20578	20585	75 %	0 %	25 %	0 %	218868672
31	NC_011778	AAGT	2	8	21221	21228	50 %	25 %	25 %	0 %	218868672
32	NC_011778	CTTT	2	8	23210	23217	0 %	75 %	0 %	25 %	218868680
33	NC_011778	TTAT	2	8	23249	23256	25 %	75 %	0 %	0 %	218868680
34	NC_011778	AAGC	2	8	23440	23447	50 %	0 %	25 %	25 %	218868680
35	NC_011778	CTGC	2	8	23640	23647	0 %	25 %	25 %	50 %	218868680
36	NC_011778	TCTG	2	8	26094	26101	0 %	50 %	25 %	25 %	218868675
37	NC_011778	ATAA	2	8	26171	26178	75 %	25 %	0 %	0 %	218868675
38	NC_011778	CTTT	2	8	26353	26360	0 %	75 %	0 %	25 %	218868675
39	NC_011778	GCTT	2	8	26671	26678	0 %	50 %	25 %	25 %	218868674
40	NC_011778	TTTA	2	8	27444	27451	25 %	75 %	0 %	0 %	218868681
41	NC_011778	CTTT	2	8	28072	28079	0 %	75 %	0 %	25 %	218868681
42	NC_011778	ATGC	2	8	29584	29591	25 %	25 %	25 %	25 %	218868671
43	NC_011778	TTGC	2	8	29765	29772	0 %	50 %	25 %	25 %	218868671
44	NC_011778	ATTT	2	8	30116	30123	25 %	75 %	0 %	0 %	218868671
45	NC_011778	TAAA	2	8	33042	33049	75 %	25 %	0 %	0 %	218868676
46	NC_011778	CTTT	2	8	33789	33796	0 %	75 %	0 %	25 %	218868677
47	NC_011778	CTTT	2	8	33843	33850	0 %	75 %	0 %	25 %	218868677
48	NC_011778	ATTT	2	8	34018	34025	25 %	75 %	0 %	0 %	218868677
49	NC_011778	TCAT	2	8	34621	34628	25 %	50 %	0 %	25 %	218868685
50	NC_011778	TTGG	2	8	35902	35909	0 %	50 %	50 %	0 %	218868690
51	NC_011778	TTCT	2	8	36175	36182	0 %	75 %	0 %	25 %	218868690

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.